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SECUENCIACIÓN DE PRÓXIMA GENERACIÓN ONKOSIGHT ADVANCEDTM

Presentamos OnkoSight AdvancedTM. Ofrecemos a los médicos secuenciación genética avanzada para mejorar el manejo de los pacientes con cáncer.

OnkoSight AdvancedTM es un ensayo de secuenciación de próxima generación (NGS, por sus siglas en inglés) que permite la creación de perfiles mutacionales de vanguardia de ADN a partir de muestras tumorales. OnkoSight AdvancedTM se centra en mutaciones accionables en cánceres frecuentes. Este enfoque dirigido ayuda a personalizar el tratamiento y manejo del paciente y, a su vez, reduce en gran medida la cantidad de variantes no claras que suelen ocurrir en los resultados de perfiles de NGS más amplios.

Los genes incluidos en los perfiles de NGS OnkoSight AdvancedTM son aquellos con claro valor terapéutico, diagnóstico o de pronóstico y para los que hay ensayos clínicos de etapa avanzada disponibles. Se incluyen genes recomendados por las pautas nacionales en cada perfil específico de un tumor.

También se informan con todos los análisis OnkoSight AdvancedTM biomarcadores genómicos críticos relevantes para la inmunoterapia; carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés) e inestabilidad microsatelital (MSI, por sus siglas en inglés).

Las regiones de codificación exónicas completas y algunos intrones están ampliamente cubiertos entre los genes seleccionados para el análisis. La cobertura de regiones de codificación exónicas completas representa una mejora respecto de los enfoques de zonas específicas y minimiza el riesgo de potenciales falsos negativos debido a falta de cobertura en todos los loci clínicamente relevantes.

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PERFIL DE TUMORES SÓLIDOS

Perfil de cáncer colorrectal OnkoSight AdvancedTM (29 genes), TMB y
MSI
Código de la prueba: TH50-8

AKT1APCBRAFEGFREPCAMERBB2ERBB4FGFR1FGFR2
FGFR3FGFR4HRASKRASMETMAP2K1MLH1MSH2MSH6
NRASNTRK1PIK3CAPMS2POLD1POLEPTENSMAD4STK11
TERTTP53
Gen:
AKT1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del AKT1 pueden predecir la respuesta a los inhibidores del AKT1/mTOR.
Gen:
APC
Utilidad clínica:
Supresor de tumores. Promueve la rápida degradación de CTNNB1 y participa en señalización de Wnt como regulador negativo. Se requiere para regulación ascendente de MMP9 a través de la vía de señalización de JNK en células de tumores colorrectales.
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
EGFR
Utilidad clínica:
EGFR pertenece a una familia de cuatro tirosina quinasas que comprenden ErbB1 (EGFR, HER1), ErbB2 (Her-2, Neu), ErbB3 (Her-3) y ErbB4 (Her-4). Se detectaron amplificaciones y mutaciones en EGFR (HER1) en un 45 % a un 57 % de los casos de glioblastoma, lo que indica un rol causal en la patogénesis del glioblastoma. Los EGFR inducen proliferación y se han implicado en la patogénesis del glioblastoma y la resistencia al tratamiento. El EGFR se considera una potencial diana terapéutica para la terapia anti-EGFR en el cáncer de mama triple negativo (TNBC, por sus siglas en inglés). La sensibilización de las mutaciones del EGFR predicen la respuesta a TKI del EGFR en el CPCNP, incluidos TKI aprobados por la FDA (erlotinib, gefitinib y afatinib), mientras que otras mutaciones predicen la resistencia a TKI de primera y segunda generación.
Gen:
EPCAM
Utilidad clínica:
Se ha demostrado que la molécula de adhesión de las células epiteliales (EpCAM, por sus siglas en inglés) está fuertemente expresada en el cáncer de mama humano y en las células madre cancerosas, y se supone que su sobreexpresión promueve el avance y la metástasis de los tumores. Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión del EPCAM puede correlacionarse con el desarrollo de metástasis en los huesos y una peor supervivencia libre de recurrencias bioquímicas del cáncer de próstata.
Gen:
ERBB2
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el ERBB2 (HER2) son dianas emergentes asociadas a la respuesta al anticuerpo anti-HER2 (trastuzumab) o a la terapia con TKI (afatinib) en el CPCNP. En el cáncer de mama, la sobreexpresión del ERBB2 o la amplificación del gen se asocia con la respuesta a terapias dirigidas anti-HER2 establecidas. En neoplasias del SNC, se ha detectado mutación de ErbB2/HER-2 en el 8 % al 41 % de los casos de glioblastoma.
Gen:
ERBB4
Utilidad clínica:
La red de señalización de ErbB desempeña un papel crucial en el crecimiento y avance de varios tipos de cáncer, entre ellos, el cáncer colorrectal (CCR), e incluye genes potencialmente tratables con fármacos. La activación de oncogenes de la vía de ErbB por mutaciones y amplificaciones focales ha surgido recientemente como un importante marcador predictivo de pronóstico de los pacientes con CCR.
Gen:
FGFR1
Utilidad clínica:
La amplificación del gen FGFR1 predice la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FGFR2
Utilidad clínica:
Las alteraciones del FGFR2, incluida la amplificación, las reorganizaciones y las mutaciones puntuales, predicen la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FGFR3
Utilidad clínica:
Las alteraciones del FGFR3, incluida la amplificación, las reorganizaciones y las mutaciones puntuales, predicen la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FGFR4
Utilidad clínica:
La señalización de FGF-1/-3/FGFR4 en fibroblastos asociados al cáncer promueve el avance del tumor en el cáncer de colon a través de Erk y MMP-7. La fosforilación de FGFR4 aumentó la producción de metaloproteinasa (MMP)-7 y la proteína cinasa activada por mitógenos (Mek)/cinasa regulada por señales extracelulares (Erk, por sus siglas en inglés), que estuvo acompañada por una excesiva generación de vasos y proliferación de células.
Gen:
HRAS
Utilidad clínica:
Las proteínas RAS (KRAS4A, KRAS4B, NRAS y HRAS) funcionan como interruptores de encendido y apagado binarios con regulación GDP–GTP, que regulan las redes de señalización citoplasmática que controlan los diversos procesos celulares normales. Las mutaciones con cambio de sentido de ganancia de función en genes RAS se encuentran en un ∼25 % de los cánceres humanos, lo que genera interés en identificar las estrategias terapéuticas anti-RAS para el tratamiento del cáncer. Las mutaciones del RAS tienen un valor predictivo positivo alto para malignidad en tumores de tiroides, y ayudan en el diagnóstico de lesiones tiroideas foliculares.
Gen:
KRAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones del KRAS en el mCRC son predictivas de beneficio para agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab). En el CPCNP, las mutaciones del KRAS se asocian con resistencia primaria a TKI del EGFR. En el cáncer de mama, se halló que la expresión de ARNm de KRAS es un factor de pronóstico independiente. La función de pronóstico del ARNm de KRAS fue efectiva solo en el cáncer de mama luminal de subtipo A.
Gen:
MET
Utilidad clínica:
Las alteraciones del MET en tumores sólidos, incluida la amplificación y las mutaciones, pueden predecir la respuesta a los inhibidores del MET. La amplificación del MET se ha asociado a resistencia adquirida a TKI anti-EGFR en cáncer de pulmón.
Gen:
MAP2K1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del MAP2K1 pueden conferir resistencia a inhibidores del BRAF y el MEK.
Gen:
MLH1
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión de reparación de errores de emparejamiento (MMR, por sus siglas en inglés) de ADN es común en el cáncer de próstata y está vinculada a un resultado poco favorable, así como a características que indican inestabilidad genética. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales, mientras que otros han informado hipermetilación somática del promotor del gen MLH1, que se asocia a la inactivación del gen MLH1, en hasta un 52 % de los tumores de colon. La inestabilidad microsatelital y la deficiencia de reparación de errores de emparejamiento, que pueden surgir en el contexto de mutaciones de MLH1, MSH2, MSH6 y PMS2, sugieren
potencial vulnerabilidad a inhibidores de PD-1.
Gen:
MSH2
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata; las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. La pérdida de la proteína MSH2 se correlaciona con la inactivación de MSH2, hipermutación y una densidad más alta de linfocitos infiltrantes tumorales, y parece ser más frecuente entre los tumores primarios de muy alto grado, para los cuales pueden garantizarse análisis de detección de rutina si se validan en cohortes adicionales.
Gen:
MSH6
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. El MSH6 se asocia con un mayor riesgo de cáncer de mama, y debe considerarse al solicitar pruebas genéticas para personas que tienen antecedentes familiares o personales de cáncer de mama.
Gen:
NRAS
Utilidad clínica:
Se encuentran mutaciones y sobreexpresión del homólogo del oncogén viral RAS (v‐ras) de neuroblastoma (NRAS, por sus siglas en inglés) en múltiples tipos de tumores y son frecuentes en cánceres altamente metastásicos, como tumores de primario desconocido, melanomas y sarcomas que presentan una llamativa propensión a metástasis en pulmón. Estudios clínicos sugieren que los pacientes con tumores con mutación de NRAS o amplificados sufren una enfermedad de mayor malignidad que los pacientes con alelos NRAS de tipo salvaje. Las mutaciones de NRAS en mCRC son predictivas de falta de beneficio de los agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab), y puede predecir la respuesta a inhibidores de MEK en melanoma metastásico.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PIK3CA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PIK3CA pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PMS2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales. Además, los pacientes con síndrome de Lynch y mutaciones de PMS2 pueden presentar un riesgo mayor de desarrollar cáncer de mama. En el cáncer de próstata, el PMS2 tiene un rol de supresor tumoral al aumentar la apoptosis en células de cáncer de próstata.
Gen:
POLD1
Utilidad clínica:
Se han sugerido las variantes de los genes POLE/POLD1 como potenciales marcadores para inmunoterapia debido a su asociación significativa con la carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés), un indicador eficaz de predicción de la respuesta en inmunoterapia.
Gen:
POLE
Utilidad clínica:
Se han sugerido las variantes de los genes POLE/POLD1 como potenciales marcadores para inmunoterapia debido a su asociación significativa con la carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés), un indicador eficaz de predicción de la respuesta en inmunoterapia.
Gen:
PTEN
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PTEN pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
SMAD4
Utilidad clínica:
Un gen supresor de tumores que se encuentra en al menos 26 tipos de cáncer, con frecuencias más altas en cánceres del tracto gastrointestinal, por ejemplo, cáncer de esófago, estómago, páncreas y colorrectal. Además, la pérdida de SMAD4 en tumores afecta el avance del cáncer y la terapia, por ejemplo, una respuesta reducida a la quimioterapia adyuvante.
Gen:
STK11
Utilidad clínica:
El STK11/LKB1 se encuentra entre los supresores tumorales más comúnmente inactivados en cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC, por sus siglas en inglés), especialmente en tumores con mutaciones de KRAS. En un estudio clínico, se halló que las alteraciones de STK11/LKB1 son el factor genómico más prevalente de la resistencia primaria a inhibidores de eje PD-1 en adenocarcinoma de pulmón con mutación de KRAS. Las mutaciones en este gen se han asociado a síndrome de Peutz-Jeghers (SPJ), un trastorno autosómico dominante caracterizado por el crecimiento de pólipos en el tracto gastrointestinal, máculas pigmentadas en la piel y la boca, y otras neoplasias. Varios informes publicados han demostrado que el SPJ predispone a los portadores a cánceres del tracto gastrointestinal, así como a susceptibilidad a una variedad de tumores.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida
en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.
Gen:
APC
Utilidad clínica:
Supresor de tumores. Promueve la rápida degradación de CTNNB1 y participa en señalización de Wnt como regulador negativo. Se requiere para regulación ascendente de MMP9 a través de la vía de señalización de JNK en células de tumores colorrectales.
Gen:
ATRX
Utilidad clínica:
Las mutaciones de ATRX en gliomas se asocian fuertemente con mutaciones de IDH, y casi siempre son mutuamente excluyentes con codeleción de 1p/19q. La deficiencia de ATRX, junto con las mutaciones de IDH, es típica del astrocitoma.
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
CDKN2A
Utilidad clínica:
La pérdida de CDKN2A es común en neoplasias linfoides, tiene implicaciones de pronóstico en algunas neoplasias malignas y presenta una diana terapéutica para inhibidores del CDK4/6.
Gen:
CTNNB1
Utilidad clínica:
Las mutaciones activadoras del CTNNB1 puede predecir la respuesta a los inhibidores de WNT.
Gen:
EGFR
Utilidad clínica:
EGFR pertenece a una familia de cuatro tirosina quinasas que comprenden ErbB1 (EGFR, HER1), ErbB2 (Her-2, Neu), ErbB3 (Her-3) y ErbB4 (Her-4). Se detectaron amplificaciones y mutaciones en EGFR (HER1) en un 45 % a un 57 % de los casos de glioblastoma, lo que indica un rol causal en la patogénesis del glioblastoma. Los EGFR inducen proliferación y se han implicado en la patogénesis del glioblastoma y la resistencia al tratamiento. El EGFR se considera una potencial diana terapéutica para la terapia anti-EGFR en el cáncer de mama triple negativo (TNBC, por sus siglas en inglés). La sensibilización de las mutaciones del EGFR predicen la respuesta a TKI del EGFR en el CPCNP, incluidos TKI aprobados por la FDA (erlotinib, gefitinib y afatinib), mientras que otras mutaciones predicen la resistencia a TKI de primera y segunda generación.
Gen:
ERBB2
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el ERBB2 (HER2) son dianas emergentes asociadas a la respuesta al anticuerpo anti-HER2 (trastuzumab) o a la terapia con TKI (afatinib) en el CPCNP. En el cáncer de mama, la sobreexpresión del ERBB2 o la amplificación del gen se asocia con la respuesta a terapias dirigidas anti-HER2 establecidas. En neoplasias del SNC, se ha detectado mutación de ErbB2/HER-2 en el 8 % al 41 % de los casos de glioblastoma.
Gen:
H3F3A
Utilidad clínica:
Las mutaciones en H3F3A, que codifica la histona H3.3, ocurre con alta frecuencia en glioblastoma pediátrico y malignidades óseas. Asimismo, las sustituciones de H3F3A K27M ocurren en gliomas que surgen en ubicaciones de línea media (p. ej., el puente troncoencefálico, el tálamo, la columna vertebral); además, esta sustitución ocurre en tumores en niños y adolescentes. Más del 80 % de los tumores de células gigantes presentaron mutaciones de H3F3A en el codón Gly34, aproximadamente el 95 % de los cuales fueron p.G34W como resultado de una alteración de un nucleótido GGG>TGG. Dada la alta prevalencia en tumores de células gigantes en huesos y prácticamente la inexistencia entre potenciales copias, las mutaciones de H3F3A G34 podrían servir como un complemento útil para el diagnóstico.
Gen:
H3F3B
Utilidad clínica:
Los genes de codificación de histona H3, particularmente H3F3A y H3F3B, los genes que codifican la variante de la histona H3.3, mutan a alta frecuencia en malignidades cerebrales y óseas pediátricas. Las mutaciones en H3F3A, que codifica la histona H3.3, ocurre con alta frecuencia en glioblastoma pediátrico y malignidades óseas. Asimismo, las sustituciones de H3F3A K27M ocurren en gliomas que surgen en ubicaciones de línea media (p. ej., el puente troncoencefálico, el tálamo, la columna vertebral); además, esta sustitución ocurre en tumores en niños y adolescentes. Más del 80 % de los tumores de células gigantes presentaron mutaciones de H3F3A en el codón Gly34, aproximadamente el 95 % de los cuales fueron p.G34W como resultado de una alteración de un nucleótido GGG>TGG. Dada la alta prevalencia
en tumores de células gigantes en huesos y prácticamente la inexistencia entre potenciales copias, las mutaciones de H3F3A G34 podrían servir como un complemento útil para el diagnóstico.
Gen:
H3F3C
Utilidad clínica:
Las mutaciones en H3F3A, que codifica la histona H3.3, ocurre con alta frecuencia en glioblastoma pediátrico y malignidades óseas. Asimismo, las sustituciones de H3F3A K27M ocurren en gliomas que surgen en ubicaciones de línea media (p. ej., el puente troncoencefálico, el tálamo, la columna vertebral); además, esta sustitución ocurre en tumores en niños y adolescentes. Más del 80 % de los tumores de células gigantes presentaron mutaciones de H3F3A en el codón Gly34, aproximadamente el 95 % de los cuales fueron p.G34W como resultado de una alteración de un nucleótido GGG>TGG. Dada la alta prevalencia en tumores de células gigantes en huesos y prácticamente la inexistencia entre potenciales copias, las mutaciones de H3F3A G34 podrían servir como un complemento útil para el diagnóstico.
Gen:
HIST1H3B
Utilidad clínica:
La mutación de HIST1H3B K27M se asocia con un comportamiento menos agresivo en el glioma pontino intrínseco difuso (GPID).
Gen:
HIST1H3C
Utilidad clínica:
Útil en un subgrupo específico de pacientes con neuroblastoma para predecir la supervivencia. La metilación de HIST1H3C se asocia tanto con la supervivencia general como con la supervivencia libre de eventos
Gen:
IDH1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del IDH (IDH1 e IDH2) son más relevantes en gliomas difusos de bajo grado, y en glioblastomas secundarios, se asocian con un mejor pronóstico en gliomas de bajo grado, y pueden predecir la respuesta a la terapia (inhibidores del IDH, temozolomida). En la leucemia mieloide aguda (LMA), las mutaciones somáticas en IDH1 e IDH2 son altamente recurrentes y son casi exclusivamente heterocigotas, y ocurren con mayor frecuencia en LMA en citogenética normal.
Gen:
IDH2
Utilidad clínica:
Las mutaciones del IDH (IDH1 e IDH2) son más relevantes en gliomas difusos de bajo grado, y en glioblastomas secundarios, se asocian con un mejor pronóstico en gliomas de bajo grado, y pueden predecir la respuesta a la terapia (inhibidores del IDH, temozolomida). En la leucemia mieloide aguda (LMA), las mutaciones somáticas en IDH1 e IDH2 son altamente recurrentes y son casi exclusivamente heterocigotas, y ocurren con mayor frecuencia en LMA en citogenética normal.
Gen:
MYC
Utilidad clínica:
Activa la transcripción de genes relacionados con el crecimiento. Se une al promotor de VEGFA, promoviendo la producción de VEGFA y la posterior angiogénesis por brote. Regulador de la reprogramación de células somáticas, controla la autorrenovación de células madre embrionarias. Actúa con el TAF6L para activar la expresión génica a través del pausado y liberación de la ARN polimerasa II.
Gen:
NF1
Utilidad clínica:
El factor nuclear I (NFI, por sus siglas en inglés) es una familia de factores de transcripción que consta de cuatro genes bien diferenciados, pero estrechamente relacionados: NFIA, NFIB, NFIC y NFIX. Los resultados de un estudio reciente han mostrado que la familia del NFI puede desempeñar un papel fundamental en el avance de diversos tumores humanos y se han identificado como
supresores tumorales clave y oncogenes para numerosos cánceres.
Gen:
NF2
Utilidad clínica:
La mutación de los resultados de NF2 en el síndrome de propensión clínica a tumores, neurofibromatosis tipo 2 (NF2), caracterizada por el desarrollo de múltiples tumores intracraneales y espinales, entre ellos, schwannomas, meningiomas y ependimomas.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PDGFRA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PDGFRA predicen la respuesta a los TKI (imatinib, sunitinib).
Gen:
PIK3CA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PIK3CA pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PTEN
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PTEN pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
SMARCA4
Utilidad clínica:
SMARCA4 (BRG1), una ATPasa central de complejos BAF, es el gen similar a Snf2 con mutación más frecuente en el cáncer humano, y se ha identificado como un importante supresor tumoral en estudios de pancáncer. Las mutaciones de pérdida de función de SMARCA4 se ven incrementadas en diversos tipos de cáncer, lo que contribuye a una amplia variedad de cánceres, entre ellos, de pulmón, ovarios, piel, sarcoma torácico y linfomas. La inactivación de SMARCA4 es especialmente frecuente en el carcinoma de ovario de células pequeñas, de tipo hipercalcémico (SCCOHT, por sus siglas en inglés).
Gen:
SMARCB1
Utilidad clínica:
MARCB1/INI1 es una de las subunidades proteicas centrales del complejo remodelador de la cromatina SWI/SNF dependiente del ATP, y se identifica como un potente supresor tumoral genuino. Se han demostrado interacciones entre SMARCB1/INI1 y las proteínas clave en diversas vías relacionadas con la proliferación y avance de tumores: la vía p16-RB, la vía de señalización de WNT, la vía de señalización de sonic hedgehog y la vía Polycomb.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida
en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.
Gen:
VHL
Utilidad clínica:
Las mutaciones de VHL predisponen al desarrollo de una amplia variedad de tumores (más comúnmente, hemangioblastomas del sistema nervioso central y retinianos, carcinoma renal de células claras y feocromocitomas). El hemangioblastoma (CHB, por sus siglas en inglés) del sistema nervioso central es la manifestación más común de la enfermedad de VHL. Las mutaciones de la línea germinal en el gen supresor tumoral VHL son responsables del síndrome de predisposición al cáncer heredado o enfermedad de von Hippel-Lindau (VHL).

Perfil de tumor CNS OnkoSight AdvancedTM (26 genes), TMB y MSI
Código de la prueba: TH57-3

APCATRXBRAFCDKN2ACTNNB1EGFRERBB2H3F3AH3F3B
H3F3CHIST1H3BHIST1H3CIDH1IDH2MYCNF1NF2NTRK1
PDGFRAPIK3CAPTENSMARCA4SMARCB1TERTTP53VHL
Gen:
APC
Utilidad clínica:
Supresor de tumores. Promueve la rápida degradación de CTNNB1 y participa en señalización de Wnt como regulador negativo. Se requiere para regulación ascendente de MMP9 a través de la vía de señalización de JNK en células de tumores colorrectales.
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
EGFR
Utilidad clínica:
EGFR pertenece a una familia de cuatro tirosina quinasas que comprenden ErbB1 (EGFR, HER1), ErbB2 (Her-2, Neu), ErbB3 (Her-3) y ErbB4 (Her-4). Se detectaron amplificaciones y mutaciones en EGFR (HER1) en un 45 % a un 57 % de los casos de glioblastoma, lo que indica un rol causal en la patogénesis del glioblastoma. Los EGFR inducen proliferación y se han implicado en la patogénesis del glioblastoma y la resistencia al tratamiento. El EGFR se considera una potencial diana terapéutica para la terapia anti-EGFR en el cáncer de mama triple negativo (TNBC, por sus siglas en inglés). La sensibilización de las mutaciones del EGFR predicen la respuesta a TKI del EGFR en el CPCNP, incluidos TKI aprobados por la FDA (erlotinib, gefitinib y afatinib), mientras que otras mutaciones predicen la resistencia a TKI de primera y segunda generación.
Gen:
EPCAM
Utilidad clínica:
Se ha demostrado que la molécula de adhesión de las células epiteliales (EpCAM, por sus siglas en inglés) está fuertemente expresada en el cáncer de mama humano y en las células madre cancerosas, y se supone que su sobreexpresión promueve el avance y la metástasis de los tumores. Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión del EPCAM puede correlacionarse con el desarrollo de metástasis en los huesos y una peor supervivencia libre de recurrencias bioquímicas del cáncer de próstata.
Gen:
ERBB2
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el ERBB2 (HER2) son dianas emergentes asociadas a la respuesta al anticuerpo anti-HER2 (trastuzumab) o a la terapia con TKI (afatinib) en el CPCNP. En el cáncer de mama, la sobreexpresión del ERBB2 o la amplificación del gen se asocia con la respuesta a terapias dirigidas anti-HER2 establecidas. En neoplasias del SNC, se ha detectado mutación de ErbB2/HER-2 en el 8 % al 41 % de los casos de glioblastoma.
Gen:
ERBB4
Utilidad clínica:
La red de señalización de ErbB desempeña un papel crucial en el crecimiento y avance de varios tipos de cáncer, entre ellos, el cáncer colorrectal (CCR), e incluye genes potencialmente tratables con fármacos. La activación de oncogenes de la vía de ErbB por mutaciones y amplificaciones focales ha surgido recientemente como un importante marcador predictivo de pronóstico de los pacientes con CCR.
Gen:
FGFR1
Utilidad clínica:
La amplificación del gen FGFR1 predice la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FGFR2
Utilidad clínica:
Las alteraciones del FGFR2, incluida la amplificación, las reorganizaciones y las mutaciones puntuales, predicen la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FGFR3
Utilidad clínica:
Las alteraciones del FGFR3, incluida la amplificación, las reorganizaciones y las mutaciones puntuales, predicen la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FGFR4
Utilidad clínica:
La señalización de FGF-1/-3/FGFR4 en fibroblastos asociados al cáncer promueve el avance del tumor en el cáncer de colon a través de Erk y MMP-7. La fosforilación de FGFR4 aumentó la producción de metaloproteinasa (MMP)-7 y la proteína cinasa activada por mitógenos (Mek)/cinasa regulada por señales extracelulares (Erk, por sus siglas en inglés), que estuvo acompañada por una excesiva generación de vasos y proliferación de células.
Gen:
HRAS
Utilidad clínica:
Las proteínas RAS (KRAS4A, KRAS4B, NRAS y HRAS) funcionan como interruptores de encendido y apagado binarios con regulación GDP–GTP, que regulan las redes de señalización citoplasmática que controlan los diversos procesos celulares normales. Las mutaciones con cambio de sentido de ganancia de función en genes RAS se encuentran en un ∼25 % de los cánceres humanos, lo que genera interés en identificar las estrategias terapéuticas anti-RAS para el tratamiento del cáncer. Las mutaciones del RAS tienen un valor predictivo positivo alto para malignidad en tumores de tiroides, y ayudan en el diagnóstico de lesiones tiroideas foliculares.
Gen:
KRAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones del KRAS en el mCRC son predictivas de beneficio para agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab). En el CPCNP, las mutaciones del KRAS se asocian con resistencia primaria a TKI del EGFR. En el cáncer de mama, se halló que la expresión de ARNm de KRAS es un factor de pronóstico independiente. La función de pronóstico del ARNm de KRAS fue efectiva solo en el cáncer de mama luminal de subtipo A.
Gen:
MET
Utilidad clínica:
Las alteraciones del MET en tumores sólidos, incluida la amplificación y las mutaciones, pueden predecir la respuesta a los inhibidores del MET. La amplificación del MET se ha asociado a resistencia adquirida a TKI anti-EGFR en cáncer de pulmón.
Gen:
MAP2K1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del MAP2K1 pueden conferir resistencia a inhibidores del BRAF y el MEK.
Gen:
MLH1
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión de reparación de errores de emparejamiento (MMR, por sus siglas en inglés) de ADN es común en el cáncer de próstata y está vinculada a un resultado poco favorable, así como a características que indican inestabilidad genética. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales, mientras que otros han informado hipermetilación somática del promotor del gen MLH1, que se asocia a la inactivación del gen MLH1, en hasta un 52 % de los tumores de colon. La inestabilidad microsatelital y la deficiencia de reparación de errores de emparejamiento, que pueden surgir en el contexto de mutaciones de MLH1, MSH2, MSH6 y PMS2, sugieren
potencial vulnerabilidad a inhibidores de PD-1.
Gen:
MSH2
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata; las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. La pérdida de la proteína MSH2 se correlaciona con la inactivación de MSH2, hipermutación y una densidad más alta de linfocitos infiltrantes tumorales, y parece ser más frecuente entre los tumores primarios de muy alto grado, para los cuales pueden garantizarse análisis de detección de rutina si se validan en cohortes adicionales.
Gen:
MSH6
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. El MSH6 se asocia con un mayor riesgo de cáncer de mama, y debe considerarse al solicitar pruebas genéticas para personas que tienen antecedentes familiares o personales de cáncer de mama.
Gen:
NRAS
Utilidad clínica:
Se encuentran mutaciones y sobreexpresión del homólogo del oncogén viral RAS (v‐ras) de neuroblastoma (NRAS, por sus siglas en inglés) en múltiples tipos de tumores y son frecuentes en cánceres altamente metastásicos, como tumores de primario desconocido, melanomas y sarcomas que presentan una llamativa propensión a metástasis en pulmón. Estudios clínicos sugieren que los pacientes con tumores con mutación de NRAS o amplificados sufren una enfermedad de mayor malignidad que los pacientes con alelos NRAS de tipo salvaje. Las mutaciones de NRAS en mCRC son predictivas de falta de beneficio de los agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab), y puede predecir la respuesta a inhibidores de MEK en melanoma metastásico.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PIK3CA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PIK3CA pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PMS2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales. Además, los pacientes con síndrome de Lynch y mutaciones de PMS2 pueden presentar un riesgo mayor de desarrollar cáncer de mama. En el cáncer de próstata, el PMS2 tiene un rol de supresor tumoral al aumentar la apoptosis en células de cáncer de próstata.
Gen:
POLD1
Utilidad clínica:
Se han sugerido las variantes de los genes POLE/POLD1 como potenciales marcadores para inmunoterapia debido a su asociación significativa con la carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés), un indicador eficaz de predicción de la respuesta en inmunoterapia.
Gen:
POLE
Utilidad clínica:
Se han sugerido las variantes de los genes POLE/POLD1 como potenciales marcadores para inmunoterapia debido a su asociación significativa con la carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés), un indicador eficaz de predicción de la respuesta en inmunoterapia.
Gen:
PTEN
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PTEN pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
SMAD4
Utilidad clínica:
Un gen supresor de tumores que se encuentra en al menos 26 tipos de cáncer, con frecuencias más altas en cánceres del tracto gastrointestinal, por ejemplo, cáncer de esófago, estómago, páncreas y colorrectal. Además, la pérdida de SMAD4 en tumores afecta el avance del cáncer y la terapia, por ejemplo, una respuesta reducida a la quimioterapia adyuvante.
Gen:
STK11
Utilidad clínica:
El STK11/LKB1 se encuentra entre los supresores tumorales más comúnmente inactivados en cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC, por sus siglas en inglés), especialmente en tumores con mutaciones de KRAS. En un estudio clínico, se halló que las alteraciones de STK11/LKB1 son el factor genómico más prevalente de la resistencia primaria a inhibidores de eje PD-1 en adenocarcinoma de pulmón con mutación de KRAS. Las mutaciones en este gen se han asociado a síndrome de Peutz-Jeghers (SPJ), un trastorno autosómico dominante caracterizado por el crecimiento de pólipos en el tracto gastrointestinal, máculas pigmentadas en la piel y la boca, y otras neoplasias. Varios informes publicados han demostrado que el SPJ predispone a los portadores a cánceres del tracto gastrointestinal, así como a susceptibilidad a una variedad de tumores.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida
en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.
Gen:
APC
Utilidad clínica:
Supresor de tumores. Promueve la rápida degradación de CTNNB1 y participa en señalización de Wnt como regulador negativo. Se requiere para regulación ascendente de MMP9 a través de la vía de señalización de JNK en células de tumores colorrectales
Gen:
ATRX
Utilidad clínica:
Las mutaciones de ATRX en gliomas se asocian fuertemente con mutaciones de IDH, y casi siempre son mutuamente excluyentes con codeleción de 1p/19q. La deficiencia de ATRX, junto con las mutaciones de IDH, es típica del astrocitoma.
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
CDKN2A
Utilidad clínica:
La pérdida de CDKN2A es común en neoplasias linfoides, tiene implicaciones de pronóstico en algunas neoplasias malignas y presenta una diana terapéutica para inhibidores del CDK4/6.
Gen:
CTNNB1
Utilidad clínica:
Las mutaciones activadoras del CTNNB1 puede predecir la respuesta a los inhibidores de WNT.
Gen:
EGFR
Utilidad clínica:
EGFR pertenece a una familia de cuatro tirosina quinasas que comprenden ErbB1 (EGFR, HER1), ErbB2 (Her-2, Neu), ErbB3 (Her-3) y ErbB4 (Her-4). Se detectaron amplificaciones y mutaciones en EGFR (HER1) en un 45 % a un 57 % de los casos de glioblastoma, lo que indica un rol causal en la patogénesis del glioblastoma. Los EGFR inducen proliferación y se han implicado en la patogénesis del glioblastoma y la resistencia al tratamiento. El EGFR se considera una potencial diana terapéutica para la terapia anti-EGFR en el cáncer de mama triple negativo (TNBC, por sus siglas en inglés). La sensibilización de las mutaciones del EGFR predicen la respuesta a TKI del EGFR en el CPCNP, incluidos TKI aprobados por la FDA (erlotinib, gefitinib y afatinib), mientras que otras mutaciones predicen la resistencia a TKI de primera y segunda generación.
Gen:
ERBB2
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el ERBB2 (HER2) son dianas emergentes asociadas a la respuesta al anticuerpo anti-HER2 (trastuzumab) o a la terapia con TKI (afatinib) en el CPCNP. En el cáncer de mama, la sobreexpresión del ERBB2 o la amplificación del gen se asocia con la respuesta a terapias dirigidas anti-HER2 establecidas. En neoplasias del SNC, se ha detectado mutación de ErbB2/HER-2 en el 8 % al 41 % de los casos de glioblastoma.
Gen:
H3F3A
Utilidad clínica:
Las mutaciones en H3F3A, que codifica la histona H3.3, ocurre con alta frecuencia en glioblastoma pediátrico y malignidades óseas. Asimismo, las sustituciones de H3F3A K27M ocurren en gliomas que surgen en ubicaciones de línea media (p. ej., el puente troncoencefálico, el tálamo, la columna vertebral); además, esta sustitución ocurre en tumores en niños y adolescentes. Más del 80 % de los tumores de células gigantes presentaron mutaciones de H3F3A en
el codón Gly34, aproximadamente el 95 % de los cuales fueron p.G34W como resultado de una alteración de un nucleótido GGG>TGG. Dada la alta prevalencia en tumores de células gigantes en huesos y prácticamente la inexistencia entre potenciales copias, las mutaciones de H3F3A G34 podrían servir como un complemento útil para el diagnóstico.
Gen:
H3F3B
Utilidad clínica:
Los genes de codificación de histona H3, particularmente H3F3A y H3F3B, los genes que codifican la variante de la histona H3.3, mutan a alta frecuencia en malignidades cerebrales y óseas pediátricas. Las mutaciones en H3F3A, que codifica la histona H3.3, ocurre con alta frecuencia en glioblastoma pediátrico y malignidades óseas. Asimismo, las sustituciones de H3F3A K27M ocurren en gliomas que surgen en ubicaciones de línea media (p. ej., el puente troncoencefálico, el tálamo, la columna vertebral); además, esta sustitución ocurre en tumores en niños y adolescentes. Más del 80 % de los tumores de células gigantes presentaron mutaciones de H3F3A en el codón Gly34, aproximadamente el 95 % de los cuales fueron p.G34W como resultado de una alteración de un nucleótido GGG>TGG. Dada la alta prevalencia en tumores de células gigantes en huesos y prácticamente la inexistencia entre potenciales copias, las mutaciones de H3F3A G34 podrían servir como un complemento útil para el diagnóstico.
Gen:
H3F3C
Utilidad clínica:
Las mutaciones en H3F3A, que codifica la histona H3.3, ocurre con alta frecuencia en glioblastoma pediátrico y malignidades óseas. Asimismo, las sustituciones de H3F3A K27M ocurren en gliomas que surgen en ubicaciones de línea media (p. ej., el puente troncoencefálico, el tálamo, la columna vertebral); además, esta sustitución ocurre en tumores en niños y adolescentes. Más del 80 % de los tumores de células gigantes presentaron mutaciones de H3F3A en
el codón Gly34, aproximadamente el 95 % de los cuales fueron p.G34W como resultado de una alteración de un nucleótido GGG>TGG. Dada la alta prevalencia en tumores de células gigantes en huesos y prácticamente la inexistencia entre potenciales copias, las mutaciones de H3F3A G34 podrían servir como un complemento útil para el diagnóstico.
Gen:
HIST1H3B
Utilidad clínica:
La mutación de HIST1H3B K27M se asocia con un comportamiento menos agresivo en el glioma pontino intrínseco difuso (GPID).
Gen:
HIST1H3C
Utilidad clínica:
Útil en un subgrupo específico de pacientes con neuroblastoma para predecir la supervivencia. La metilación de HIST1H3C se asocia tanto con la supervivencia general como con la supervivencia libre de eventos
Gen:
IDH1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del IDH (IDH1 e IDH2) son más relevantes en gliomas difusos de bajo grado, y en glioblastomas secundarios, se asocian con un mejor pronóstico en gliomas de bajo grado, y pueden predecir la respuesta a la terapia (inhibidores del IDH, temozolomida). En la leucemia mieloide aguda (LMA), las mutaciones somáticas en IDH1 e IDH2 son altamente recurrentes y son casi exclusivamente heterocigotas, y ocurren con mayor frecuencia en LMA en citogenética normal.
Gen:
IDH2
Utilidad clínica:
Las mutaciones del IDH (IDH1 e IDH2) son más relevantes en gliomas difusos de bajo grado, y en glioblastomas secundarios, se asocian con un mejor pronóstico en gliomas de bajo grado, y pueden predecir la respuesta a la terapia (inhibidores del IDH, temozolomida). En la leucemia mieloide aguda (LMA), las mutaciones somáticas en IDH1 e IDH2 son altamente recurrentes y son casi exclusivamente heterocigotas, y ocurren con mayor frecuencia en LMA en citogenética normal.
Gen:
MYC
Utilidad clínica:
Activa la transcripción de genes relacionados con el crecimiento. Se une al promotor de VEGFA, promoviendo la producción de VEGFA y la posterior angiogénesis por brote. Regulador de la reprogramación de células somáticas, controla la autorrenovación de células madre embrionarias. Actúa con el TAF6L para activar la expresión génica a través del pausado y liberación de la ARN polimerasa II.
Gen:
NF1
Utilidad clínica:
El factor nuclear I (NFI, por sus siglas en inglés) es una familia de factores de transcripción que consta de cuatro genes bien diferenciados, pero estrechamente relacionados: NFIA, NFIB, NFIC y NFIX. Los resultados de un estudio reciente han mostrado que la familia del NFI puede desempeñar un papel fundamental en el avance de diversos tumores humanos y se han identificado como supresores tumorales clave y oncogenes para numerosos cánceres.
Gen:
NF2
Utilidad clínica:
La mutación de los resultados de NF2 en el síndrome de propensión clínica a tumores, neurofibromatosis tipo 2 (NF2), caracterizada por el desarrollo de múltiples tumores intracraneales y espinales, entre ellos, schwannomas, meningiomas y ependimomas.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PDGFRA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PDGFRA predicen la respuesta a los TKI (imatinib, sunitinib).
Gen:
PIK3CA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PIK3CA pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PTEN
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PTEN pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
SMARCA4
Utilidad clínica:
SMARCA4 (BRG1), una ATPasa central de complejos BAF, es el gen similar a Snf2 con mutación más frecuente en el cáncer humano, y se ha identificado como un importante supresor tumoral en estudios de pancáncer. Las mutaciones de pérdida de función de SMARCA4 se ven incrementadas en diversos tipos de cáncer, lo que contribuye a una amplia variedad de cánceres, entre ellos, de pulmón, ovarios, piel, sarcoma torácico y linfomas. La inactivación de SMARCA4 es especialmente frecuente en el carcinoma de ovario de células pequeñas, de tipo hipercalcémico (SCCOHT, por sus siglas en inglés).
Gen:
SMARCB1
Utilidad clínica:
MARCB1/INI1 es una de las subunidades proteicas centrales del complejo remodelador de la cromatina SWI/SNF dependiente del ATP, y se identifica como un potente supresor tumoral genuino. Se han demostrado interacciones entre SMARCB1/INI1 y las proteínas clave en diversas vías relacionadas con la proliferación y avance de tumores: la vía p16-RB, la vía de señalización de WNT, la vía de señalización de sonic hedgehog y la vía Polycomb.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida
en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.
Gen:
VHL
Utilidad clínica:
Las mutaciones de VHL predisponen al desarrollo de una amplia variedad de tumores (más comúnmente, hemangioblastomas del sistema nervioso central y retinianos, carcinoma renal de células claras y feocromocitomas). El hemangioblastoma (CHB, por sus siglas en inglés) del sistema nervioso central es la manifestación más común de la enfermedad de VHL. Las mutaciones de la línea germinal en el gen supresor tumoral VHL son responsables del síndrome de predisposición al cáncer heredado o enfermedad de von Hippel-Lindau (VHL).

Perfil de GIST OnkoSight AdvancedTM (9 genes), TMB y MSI
Código de la prueba: TH58-1

BRAFKITNF1NTRK1PDGFRASDHASDHBSDHCSDHD
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
KIT
Utilidad clínica:
En GIST, las mutaciones del KIT predicen la respuesta a TKI (imatinib, sunitinib), con mutaciones secundarias asociadas a la resistencia. En casos de melanoma metastásico, se ha informado una respuesta limitada al imatinib.
Gen:
NF1
Utilidad clínica:
El factor nuclear I (NFI, por sus siglas en inglés) es una familia de factores de transcripción que consta de cuatro genes bien diferenciados, pero estrechamente relacionados: NFIA, NFIB, NFIC y NFIX. Los resultados de un estudio reciente han mostrado que la familia del NFI puede desempeñar un papel fundamental en el avance de diversos tumores humanos y se han identificado como
supresores tumorales clave y oncogenes para numerosos cánceres.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PDGFRA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PDGFRA predicen la respuesta a los TKI (imatinib, sunitinib).
Gen:
SDHA
Utilidad clínica:
Las mutaciones de los genes que codifican las subunidades del complejo succinato deshidrogenasa (SDH, por sus siglas en inglés) se describieron en GIST de tipo salvaje KIT/PDGFRA por separado en diferentes informes. El complejo SDH está compuesto o modificado por proteínas codificadas por SDHA, SDHB, SDHC, SDHD y SDHAF2. En GIST, se han informado más comúnmente alteraciones en SDH en SDHB, pero también se han encontrado en SDHC, SDHD y recientemente en SDHA. Las mutaciones de la línea germinal en SDHB y SDHC se han identificado en GIST con deficiencia de SDH, pero parecen representar menos del 15 % de los casos.
Gen:
SDHB
Utilidad clínica:
Las mutaciones de los genes que codifican las subunidades del complejo succinato deshidrogenasa (SDH, por sus siglas en inglés) se describieron en GIST de tipo salvaje KIT/PDGFRA por separado en diferentes informes. El complejo SDH está compuesto o modificado por proteínas codificadas por SDHA, SDHB, SDHC, SDHD y SDHAF2. En GIST, se han informado más comúnmente alteraciones en SDH en SDHB, pero también se han encontrado en SDHC, SDHD y recientemente en SDHA. Las mutaciones de la línea germinal en SDHB y SDHC se han identificado en GIST con deficiencia de SDH, pero parecen representar menos del 15 % de los casos.
Gen:
SDHC
Utilidad clínica:
Las mutaciones de los genes que codifican las subunidades del complejo succinato deshidrogenasa (SDH, por sus siglas en inglés) se describieron en GIST de tipo salvaje KIT/PDGFRA por separado en diferentes informes. El complejo SDH está compuesto o modificado por proteínas codificadas por SDHA, SDHB, SDHC, SDHD y SDHAF2. En GIST, se han informado más comúnmente alteraciones en SDH en SDHB, pero también se han encontrado en SDHC, SDHD y recientemente en SDHA. Las mutaciones de la línea germinal en SDHB y SDHC se han identificado en GIST con deficiencia de SDH, pero parecen representar menos del 15 % de los casos.
Gen:
SDHD
Utilidad clínica:
Las mutaciones de los genes que codifican las subunidades del complejo succinato deshidrogenasa (SDH, por sus siglas en inglés) se describieron en GIST de tipo salvaje KIT/PDGFRA por separado en diferentes informes. El complejo SDH está compuesto o modificado por proteínas codificadas por SDHA, SDHB, SDHC, SDHD y SDHAF2. En GIST, se han informado más comúnmente alteraciones en SDH en SDHB, pero también se han encontrado en SDHC, SDHD y recientemente en SDHA. Las mutaciones de la línea germinal en SDHB y SDHC se han identificado en GIST con deficiencia de SDH, pero parecen representar menos del 15 % de los casos.
Gen:
AKT1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del AKT1 pueden predecir la respuesta a los inhibidores del AKT1/mTOR.
Gen:
AR
Utilidad clínica:
Los receptores de hormonas esteroideas son factores de transcripción activados por ligando que regulan la expresión génica eucariota y afectan la proliferación celular y el ZBTB7A que recluta NCOR1 y NCOR2 para elementos de respuesta a andrógenos (ARE) en genes diana, regulando negativamente la señalización de receptores de andrógenos y la proliferación de células inducidas por andrógenos
Gen:
ATM
Utilidad clínica:
Un gen de respuesta al daño de ADN que comúnmente se encuentra mutado en el cáncer. Se cree que las mutaciones de la línea germinal en este gen contribuyen a la susceptibilidad al cáncer de mama, y actualmente se encuentra en estudio el potencial de tratamiento de la inhibición de PARP para estos pacientes. En neoplasias linfoides, las mutaciones somáticas del ATM ocurren con frecuencia en linfomas de células del manto (LCM), leucemia linfoblástica crónica (LLC) y leucemia prolinfocítica T (LPL-T).
Gen:
BRCA1
Utilidad clínica:
En situaciones de enfermedad avanzada, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, como BRCA1 y BRCA2, sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
BRCA2
Utilidad clínica:
En situaciones de enfermedad avanzada, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, como BRCA1 y BRCA2, sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
CDH1
Utilidad clínica:
Implicado en mecanismos de regulación de adhesiones celulares, movilidad y proliferación de células epiteliales. Se cree que la pérdida de función de este gen contribuye al avance del cáncer al aumentar la proliferación, la invasión o la metástasis
Gen:
CHEK2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de este gen se han asociado al síndrome de Li-Fraumeni, un fenotipo de cáncer familiar altamente penetrante generalmente relacionado con mutaciones heredadas del TP53. Además, se cree que las mutaciones de este gen están relacionadas con una predisposición a los sarcomas, cáncer de mama y tumores cerebrales
Gen:
EGFR
Utilidad clínica:
EGFR pertenece a una familia de cuatro tirosina quinasas que comprenden ErbB1 (EGFR, HER1), ErbB2 (Her-2, Neu), ErbB3 (Her-3) y ErbB4 (Her-4). Se detectaron amplificaciones y mutaciones en EGFR (HER1) en un 45 % a un 57 % de los casos de glioblastoma, lo que indica un rol causal en la patogénesis del glioblastoma. Los EGFR inducen proliferación y se han implicado en la patogénesis del glioblastoma y la resistencia al tratamiento. El EGFR se considera una potencial diana terapéutica para la terapia anti-EGFR en el cáncer de mama triple negativo (TNBC, por sus siglas en inglés). La sensibilización de las mutaciones del EGFR predicen la respuesta a TKI del EGFR en el CPCNP, incluidos TKI aprobados por la FDA (erlotinib, gefitinib y afatinib), mientras que otras mutaciones predicen la resistencia a TKI de primera y segunda generación.
Gen:
EPCAM
Utilidad clínica:
Se ha demostrado que la molécula de adhesión de las células epiteliales (EpCAM, por sus siglas en inglés) está fuertemente expresada en el cáncer de mama humano y en las células madre cancerosas, y se supone que su sobreexpresión promueve el avance y la metástasis de los tumores. Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión del EPCAM puede correlacionarse con el desarrollo de metástasis en los huesos y una peor supervivencia libre de recurrencias bioquímicas del
cáncer de próstata.
Gen:
ERBB2
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el ERBB2 (HER2) son dianas emergentes asociadas a la respuesta al anticuerpo anti-HER2 (trastuzumab) o a la terapia con TKI (afatinib) en el CPCNP. En el cáncer de mama, la sobreexpresión del ERBB2 o la amplificación del gen se asocia con la respuesta a terapias dirigidas anti-HER2 establecidas. En neoplasias del SNC, se ha detectado mutación de ErbB2/HER-2 en el 8 % al 41 % de los casos de glioblastoma.
Gen:
ESR1
Utilidad clínica:
Las mutaciones activadoras en el ESR1 se asocian con resistencia adquirida a la terapia endocrina en cáncer de mama metastásico dependiente de las hormonas.
Gen:
FANCA
Utilidad clínica:
El gen FANCA es uno de los genes en los cuales las mutaciones conducen a anemia de Fanconi, un trastorno autosómico recesivo poco frecuente caracterizado por anomalías congénitas, insuficiencia de médula ósea y predisposición a malignidades. El FANCA también es un potencial gen
de susceptibilidad al cáncer de mama y de ovario. Se asocia a la hipersensibilidad a agentes dañinos del ADN, inestabilidad cromosómica (mayor ruptura cromosómica) y reparación de ADN defectuosa. Los defectos en los genes implicados en la vía de reparación del daño del ADN (DDR, por sus siglas en inglés) surgen como biomarcadores nuevos y dianas para nuevas terapias con fármacos para el cáncer de próstata.
Gen:
FGFR1
Utilidad clínica:
La amplificación del gen FGFR1 predice la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FGFR2
Utilidad clínica:
Las alteraciones del FGFR2, incluida la amplificación, las reorganizaciones y las mutaciones puntuales,
predicen la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FOXA1
Utilidad clínica:
La expresión de FOXA1 está directamente relacionada con la expresión del receptor de andrógenos (AR, por sus siglas en inglés). A pesar de eso, se ha descubierto que el FOXA1 es un marcador de predicción de recurrencias superior en comparación con AR en pacientes con cáncer de mama receptor de estrógeno positivo (ER+, por sus siglas en inglés).
Gen:
KRAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones del KRAS en el mCRC son predictivas de beneficio para agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab). En el CPCNP, las mutaciones del KRAS se asocian con resistencia primaria a TKI del EGFR. En el cáncer de mama, se halló que la expresión de ARNm de KRAS es un factor de pronóstico independiente. La función de pronóstico del ARNm de KRAS fue efectiva solo en el cáncer de mama luminal de subtipo A.
Gen:
MLH1
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión de reparación de errores de emparejamiento (MMR, por sus siglas en inglés) de ADN es común en el cáncer de próstata y está vinculada a un resultado poco favorable, así como a características que indican inestabilidad genética. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales, mientras que otros han informado hipermetilación somática del promotor del gen MLH1, que se asocia a la inactivación del gen MLH1, en hasta un 52 % de los tumores de colon. La inestabilidad microsatelital y la deficiencia de reparación de errores de emparejamiento, que pueden surgir en el contexto de mutaciones de MLH1, MSH2, MSH6 y PMS2, sugieren
potencial vulnerabilidad a inhibidores de PD-1.
Gen:
MSH2
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata; las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. La pérdida de la proteína MSH2 se correlaciona con la inactivación de MSH2, hipermutación y una densidad más alta de linfocitos infiltrantes tumorales, y parece ser más frecuente entre los tumores primarios de muy alto grado, para los cuales pueden garantizarse análisis de detección de rutina si se validan en cohortes adicionales.
Gen:
MSH6
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. El MSH6 se asocia con un mayor riesgo de cáncer de mama, y debe considerarse al solicitar pruebas genéticas para personas que tienen antecedentes familiares o personales de cáncer de mama.
Gen:
NBN
Utilidad clínica:
La nibrina, codificada por el gen NBN, participa en la reparación de ADN. Las mutaciones en el gen NBN conducen al síndrome de rotura de Nijmegen (NBS, por sus siglas en inglés), que puede tener como resultado varios tipos de enfermedades, particularmente, susceptibilidad al cáncer, incluido el cáncer de mama. Las variantes polimórficas y las mutaciones defectuosas que ocurren en el gen NBN aumentan el riesgo de cáncer de mama a través del mecanismo de reparación de ruptura de doble cadena. También se encontraron mutaciones/polimorfismos de NBN en melanomas esporádicos y carcinomas de células basales. Además, los pacientes con NBS presentaron diversas anomalías cutáneas, entre ellas, pigmentación anormal de la piel, pelo escaso y fino y, con menos frecuencia, granulomas cutáneos no caseificantes, poroqueratosis y despigmentación. En conjunto, estos hallazgos sugieren una función clave del NBN en la homeostasis de la piel.
Gen:
MYC
Utilidad clínica:
Activa la transcripción de genes relacionados con el crecimiento. Se une al promotor de VEGFA, promoviendo la producción de VEGFA y la posterior angiogénesis por brote. Regulador de la reprogramación de células somáticas, controla la autorrenovación de células madre embrionarias. Actúa con el TAF6L para activar la expresión génica a través del pausado y liberación de la ARN polimerasa II.
Gen:
NF1
Utilidad clínica:
El factor nuclear I (NFI, por sus siglas en inglés) es una familia de factores de transcripción que consta de cuatro genes bien diferenciados, pero estrechamente relacionados: NFIA, NFIB, NFIC y NFIX. Los resultados de un estudio reciente han mostrado que la familia del NFI puede desempeñar un papel fundamental en el avance de diversos tumores humanos y se han identificado como
supresores tumorales clave y oncogenes para numerosos cánceres.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PALB2
Utilidad clínica:
PALB2 (socio y localizador de cáncer de mama 2 [BRCA2, por sus siglas en inglés]) tiene una función importante en el mantenimiento de la integridad del genoma a través de su rol en la anemia de Fanconi (AF) y vías de reparación de ADN por recombinación homóloga (HR, por sus siglas en inglés). PALB2 ha surgido como una proteína supresora de tumores fundamental relacionada con
la susceptibilidad al cáncer hereditario de mama y páncreas. En situaciones de enfermedad avanzada de cáncer de próstata, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, (p. ej., BRCA1, BRCA2, ATM, CHEK2, PALB2), sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
PIK3CA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PIK3CA pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PMS2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales. Además, los pacientes con síndrome de Lynch y mutaciones de PMS2 pueden presentar un riesgo mayor de desarrollar cáncer de mama. En el cáncer de próstata, el PMS2 tiene un rol de supresor tumoral al aumentar la apoptosis en células de cáncer de próstata.
Gen:
POLE
Utilidad clínica:
Se han sugerido las variantes de los genes POLE/POLD1 como potenciales marcadores para inmunoterapia debido a su asociación significativa con la carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés), un indicador eficaz de predicción de la respuesta en inmunoterapia.
Gen:
PTEN
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PTEN pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
RAD51D
Utilidad clínica:
Datos recientes indican que los hombres con cáncer de próstata pueden tener mutaciones de la línea germinal en 1 de 16 genes de reparación de ADN, entre ellos, RAD51D (0.4 %). Los hombres con estos síndromes heredados tienen un mayor riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal del RAD51D se han asociado recientemente con el cáncer de ovario y mama.
Gen:
RB1
Utilidad clínica:
Retinoblastoma 1 (RB1) es un gen que codifica una proteína que es un regulador negativo del ciclo celular, así como un supresor de tumores. Las mutaciones con cambio de sentido, las mutaciones sin sentido, las mutaciones silenciosas y las mutaciones por desplazamiento del marco de lectura se observan en cánceres como
cánceres de las trompas de Falopio, cánceres oculares y cáncer intestinal. El RB1 está alterado en el 4.03 % de todos los cánceres con mayor prevalencia de alteraciones en adenocarcinoma de pulmón, carcinoma ductal invasivo de mama, carcinoma de pulmón de células pequeñas, carcinoma urotelial de vejiga y adenocarcinoma de colon
Gen:
TBX3
Utilidad clínica:
El factor de transcripción T-box 3 (TBX3), un miembro de esta familia de factores T-box, se expresa en varios tejidos y desempeña papeles críticos en, entre otras estructuras, el corazón, la glándula mamaria y las extremidades, y la haploinsuficiencia del gen TBX3 es la base genética del trastorno autosómico
dominante, síndrome ulnar-mamario. Por otra parte, la sobreexpresión del TBX3 se ha vinculado a varios cánceres, entre ellos, melanoma, cáncer de mama, de páncreas, de pulmón, de hígado, de cabeza y cuello, de ovario, carcinomas de vejiga y numerosos subtipos de sarcoma. Además, existe sólida evidencia de que el TBX3 promueve la oncogénesis al impactar en la proliferación, formación de tumores y metástasis, así como en la supervivencia de las células y la resistencia a los fármacos.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.
Gen:
BAP1
Utilidad clínica:
Síndrome de predisposición tumoral (TPDS, por sus siglas en inglés) por mutaciones. Una afección caracterizada por la predisposición a desarrollar una variedad de tumores, entre ellos, tumores melanocíticos benignos, así como varios tumores malignos, entre ellos, melanoma uveal, melanoma cutáneo, mesotelioma maligno por exposición a asbesto, adenocarcinoma de pulmón y meningioma.
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
CDK4
Utilidad clínica:
La pérdida de CDKN2A es común en neoplasias linfoides, tiene implicaciones de pronóstico en algunas neoplasias malignas y presenta una diana terapéutica para inhibidores del CDK4/6.
Gen:
CDKN2A
Utilidad clínica:
La pérdida de CDKN2A es común en neoplasias linfoides, tiene implicaciones de pronóstico en algunas neoplasias malignas y presenta una diana terapéutica para inhibidores del CDK4/6.
Gen:
CTNNB1
Utilidad clínica:
Las mutaciones activadoras del CTNNB1 puede predecir la respuesta a los inhibidores de WNT.
Gen:
EIF1AX
Utilidad clínica:
El gen EIF1AX codifica la proteína vinculada al X del factor de iniciación de traducción eucariota 1A. Esta proteína tiene un papel en la iniciación de la traducción de ARNm a proteína. En el melanoma uveal, se han informado mutaciones en EIF1AX en los dos primeros exones del gen, que codifican
el extremo no estructural de la proteína EIF1AX. Las mutaciones de EIF1AX ocurren en aproximadamente el 17 % al 24 % de los melanomas uveales, y generalmente no se encuentran junto con mutaciones de SF3B1 o BAP1.
Gen:
GNA11
Utilidad clínica:
Se identifican mutaciones somáticas en los genes GNA11 o GNAQ en la mayoría de los casos de melanoma uveal.
Gen:
GNAQ
Utilidad clínica:
Se identifican mutaciones somáticas en los genes GNA11 o GNAQ en la mayoría de los casos de melanoma uveal.
Gen:
GNAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones son específicas del melanoma uveal y otros melanomas no cutáneos, y no se encuentran en tejidos normales, lo cual las hace potenciales dianas terapéuticas.
Gen:
KIT
Utilidad clínica:
En GIST, las mutaciones del KIT predicen la respuesta a TKI (imatinib, sunitinib), con mutaciones secundarias asociadas a la resistencia. En casos de melanoma metastásico, se ha informado una respuesta limitada al imatinib.
Gen:
MAP2K1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del MAP2K1 pueden conferir resistencia a inhibidores del BRAF y el MEK.
Gen:
MITF
Utilidad clínica:
Desempeña un papel importante en el desarrollo de melanocitos al regular la expresión de tirosinasa (TYR, por sus siglas en inglés) y proteína relacionada con la tirosinasa 1 (TYRP1, por sus siglas en inglés). Desempeña un papel fundamental en la diferenciación de diversos tipos de células, como los melanocitos derivados de la cresta neural, mastocitos, osteoclastos y epitelio retiniano derivado de la copa
oftálmica.
Gen:
NBN
Utilidad clínica:
La nibrina, codificada por el gen NBN, participa en la reparación de ADN. Las mutaciones en el gen NBN conducen al síndrome de rotura de Nijmegen (NBS, por sus siglas en inglés), que puede tener como resultado varios tipos de enfermedades, particularmente, susceptibilidad al cáncer, incluido el cáncer de mama. Las variantes polimórficas y las mutaciones defectuosas
que ocurren en el gen NBN aumentan el riesgo de cáncer de mama a través del mecanismo de reparación de ruptura de doble cadena. También se encontraron mutaciones/polimorfismos de NBN en melanomas esporádicos y carcinomas de células basales. Además, los pacientes con NBS presentaron diversas anomalías cutáneas, entre ellas, pigmentación anormal de la piel, pelo escaso y fino y, con menos frecuencia, granulomas cutáneos no caseificantes, poroqueratosis y despigmentación. En conjunto, estos hallazgos sugieren una función clave del NBN en la homeostasis de la piel.
Gen:
NF1
Utilidad clínica:
El factor nuclear I (NFI, por sus siglas en inglés) es una familia de factores de transcripción que consta de cuatro genes bien diferenciados, pero estrechamente relacionados: NFIA, NFIB, NFIC y NFIX. Los resultados de un estudio reciente han mostrado que la familia del NFI puede desempeñar un papel fundamental en el avance de diversos tumores humanos y se han identificado como
supresores tumorales clave y oncogenes para numerosos cánceres.
Gen:
NRAS
Utilidad clínica:
Se encuentran mutaciones y sobreexpresión del homólogo del oncogén viral RAS (v‐ras) de neuroblastoma (NRAS, por sus siglas en inglés) en múltiples tipos de tumores y son frecuentes en cánceres altamente metastásicos, como tumores de primario desconocido, melanomas y sarcomas que presentan una llamativa propensión a metástasis en pulmón. Estudios clínicos sugieren que los pacientes con tumores con mutación de NRAS o amplificados sufren una enfermedad de mayor malignidad que los pacientes con alelos NRAS de tipo salvaje. Las mutaciones de NRAS en mCRC son predictivas de falta de beneficio de los agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab), y puede predecir la respuesta a inhibidores de MEK en melanoma metastásico.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PDGFRA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PDGFRA predicen la respuesta a los TKI (imatinib, sunitinib).
Gen:
PIK3CA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PIK3CA pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PTEN
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PTEN pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
RB1
Utilidad clínica:
Retinoblastoma 1 (RB1) es un gen que codifica una proteína que es un regulador negativo del ciclo celular, así como un supresor de tumores. Las mutaciones con cambio de sentido, las mutaciones sin sentido, las mutaciones silenciosas y las mutaciones por desplazamiento del marco de lectura se observan en cánceres como
cánceres de las trompas de Falopio, cánceres oculares y cáncer intestinal. El RB1 está alterado en el 4.03 % de todos los cánceres con mayor prevalencia de alteraciones en adenocarcinoma de pulmón, carcinoma ductal invasivo de mama, carcinoma de pulmón de células pequeñas, carcinoma urotelial de vejiga y adenocarcinoma de colon
Gen:
SF3B1
Utilidad clínica:
Las mutaciones de SF3B1 se asociaron significativamente con enfermedad de receptor de estrógeno positivo, mutaciones de AKT1 y alteraciones de número de copias distintivas. Un perfilado adicional de mutaciones de zonas específicas en una prueba de subtipos histológicos especiales del cáncer de mama mostró que entre el 16 % y el 6 % de los carcinomas papilares y mucinosos
de mama tenían una mutación de SF3B1 K700E. En el melanoma uveal, las mutaciones de SF3B1 generalmente se asocian con tumores que tienen un pronóstico favorable. Además, las mutaciones de SF3B1 R625 junto con mutaciones de GNAQ y GNA11 son un marcador genético de malignidad en proliferaciones melanocíticas similares a nevo azul. En la leucemia linfocítica crónica (LLC), el SF3B1, se ha hallado la mutación de un factor de empalme expresado de forma ubicua en el 5 % al 17 % de los casos de LLC, en los cuales se asocia a un pronóstico poco favorable, supervivencia general reducida y resistencia al tratamiento con fludarabina.
Gen:
SMO
Utilidad clínica:
El receptor acoplado a proteínas G (GPCR, por sus siglas en inglés) Smoothened (SMO) es un componente de señalización clave de la vía de sonic hedgehog (Hh) y una diana clínicamente validada para el tratamiento del cáncer. Los inhibidores de SMO actualmente aprobados por la FDA son GDC-0449/Vismodegib y LDE225/Sonidegib.
Gen:
SRC
Utilidad clínica:
El protooncogén SRC no receptor de la tirosina quinasa (SRC, por sus siglas en inglés) es un factor importante que impulsa la actividad de YAP/TAZ en las células del cáncer de mama y el melanoma en humanos. La activación de la SRC aumentó la actividad de YAP/TAZ y la expresión de los genes regulados por YAP/TAZ.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.

Perfil de neoplasias ginecológicas OnkoSight AdvancedTM (33 genes), TMB
y MSI
Código de la prueba: TH53-2

AKT1ARATMBRCA1BRCA2CDH1CHEK2EGFREPCAM
ERBB2ESR1FANCAFGFR1FGFR2FOXA1KRASMLH1MSH2
MSH6NBNMYCNF1NTRK1PALB2PIK3CAPMS2POLE
PTENRAD51DRB1TBX3TERTTP53
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
KIT
Utilidad clínica:
En GIST, las mutaciones del KIT predicen la respuesta a TKI (imatinib, sunitinib), con mutaciones secundarias asociadas a la resistencia. En casos de melanoma metastásico, se ha informado una respuesta limitada al imatinib.
Gen:
NF1
Utilidad clínica:
El factor nuclear I (NFI, por sus siglas en inglés) es una familia de factores de transcripción que consta de cuatro genes bien diferenciados, pero estrechamente relacionados: NFIA, NFIB, NFIC y NFIX. Los resultados de un estudio reciente han mostrado que la familia del NFI puede desempeñar un papel fundamental en el avance de diversos tumores humanos y se han identificado como
supresores tumorales clave y oncogenes para numerosos cánceres.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PDGFRA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PDGFRA predicen la respuesta a los TKI (imatinib, sunitinib).
Gen:
SDHA
Utilidad clínica:
Las mutaciones de los genes que codifican las subunidades del complejo succinato deshidrogenasa (SDH, por sus siglas en inglés) se describieron en GIST de tipo salvaje KIT/PDGFRA por separado en diferentes informes. El complejo SDH está compuesto o modificado por proteínas codificadas por SDHA, SDHB, SDHC, SDHD y SDHAF2. En GIST, se han informado más comúnmente alteraciones en SDH en SDHB, pero también se han encontrado en SDHC, SDHD y recientemente en SDHA. Las mutaciones de la línea germinal en SDHB y SDHC se han identificado en GIST con deficiencia de SDH, pero parecen representar menos del 15 % de los casos.
Gen:
SDHB
Utilidad clínica:
Las mutaciones de los genes que codifican las subunidades del complejo succinato deshidrogenasa (SDH, por sus siglas en inglés) se describieron en GIST de tipo salvaje KIT/PDGFRA por separado en diferentes informes. El complejo SDH está compuesto o modificado por proteínas codificadas por SDHA, SDHB, SDHC, SDHD y SDHAF2. En GIST, se han informado más comúnmente alteraciones en SDH en SDHB, pero también se han encontrado en SDHC, SDHD y recientemente en SDHA. Las mutaciones de la línea germinal en SDHB y SDHC se han identificado en GIST con deficiencia de SDH, pero parecen representar menos del 15 % de los casos.
Gen:
SDHC
Utilidad clínica:
Las mutaciones de los genes que codifican las subunidades del complejo succinato deshidrogenasa (SDH, por sus siglas en inglés) se describieron en GIST de tipo salvaje KIT/PDGFRA por separado en diferentes informes. El complejo SDH está compuesto o modificado por proteínas codificadas por SDHA, SDHB, SDHC, SDHD y SDHAF2. En GIST, se han informado más comúnmente alteraciones en SDH en SDHB, pero también se han encontrado en SDHC, SDHD y recientemente en SDHA. Las mutaciones de la línea germinal en SDHB y SDHC se han identificado en GIST con deficiencia de SDH, pero parecen representar menos del 15 % de los casos.
Gen:
SDHD
Utilidad clínica:
Las mutaciones de los genes que codifican las subunidades del complejo succinato deshidrogenasa (SDH, por sus siglas en inglés) se describieron en GIST de tipo salvaje KIT/PDGFRA por separado en diferentes informes. El complejo SDH está compuesto o modificado por proteínas codificadas por SDHA, SDHB, SDHC, SDHD y SDHAF2. En GIST, se han informado más comúnmente alteraciones en SDH en SDHB, pero también se han encontrado en SDHC, SDHD y recientemente en SDHA. Las mutaciones de la línea germinal en SDHB y SDHC se han identificado en GIST con deficiencia de SDH, pero parecen representar menos del 15 % de los casos.
Gen:
AKT1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del AKT1 pueden predecir la respuesta a los inhibidores del AKT1/mTOR.
Gen:
AR
Utilidad clínica:
Los receptores de hormonas esteroideas son factores de transcripción activados por ligando que regulan la expresión génica eucariota y afectan la proliferación celular y el ZBTB7A que recluta NCOR1 y NCOR2 para elementos de respuesta a andrógenos (ARE) en genes diana, regulando negativamente la señalización de receptores de andrógenos y la proliferación de células inducidas por andrógenos
Gen:
ATM
Utilidad clínica:
Un gen de respuesta al daño de ADN que comúnmente se encuentra mutado en el cáncer. Se cree que las mutaciones de la línea germinal en este gen contribuyen a la susceptibilidad al cáncer de mama, y actualmente se encuentra en estudio el potencial de tratamiento de la inhibición de PARP para estos pacientes. En neoplasias linfoides, las mutaciones somáticas del ATM ocurren con frecuencia en linfomas de células del manto (LCM), leucemia linfoblástica crónica (LLC) y leucemia prolinfocítica T (LPL-T).
Gen:
BRCA1
Utilidad clínica:
En situaciones de enfermedad avanzada, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, como BRCA1 y BRCA2, sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
BRCA2
Utilidad clínica:
En situaciones de enfermedad avanzada, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, como BRCA1 y BRCA2, sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
CDH1
Utilidad clínica:
Implicado en mecanismos de regulación de adhesiones celulares, movilidad y proliferación de células epiteliales. Se cree que la pérdida de función de este gen contribuye al avance del cáncer al aumentar la proliferación, la invasión o la metástasis
Gen:
CHEK2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de este gen se han asociado al síndrome de Li-Fraumeni, un fenotipo de cáncer familiar altamente penetrante generalmente relacionado con mutaciones heredadas del TP53. Además, se cree que las mutaciones de este gen están relacionadas con una predisposición a los sarcomas, cáncer de mama y tumores cerebrales
Gen:
EGFR
Utilidad clínica:
EGFR pertenece a una familia de cuatro tirosina quinasas que comprenden ErbB1 (EGFR, HER1), ErbB2 (Her-2, Neu), ErbB3 (Her-3) y ErbB4 (Her-4). Se detectaron amplificaciones y mutaciones en EGFR (HER1) en un 45 % a un 57 % de los casos de glioblastoma, lo que indica un rol causal en la patogénesis del glioblastoma. Los EGFR inducen proliferación y se han implicado en la patogénesis del glioblastoma y la resistencia al tratamiento. El EGFR se considera una potencial diana terapéutica para la terapia anti-EGFR en el cáncer de mama triple negativo (TNBC, por sus siglas en inglés). La sensibilización de las mutaciones del EGFR predicen la respuesta a TKI del EGFR en el CPCNP, incluidos TKI aprobados por la FDA (erlotinib, gefitinib y afatinib), mientras que otras mutaciones predicen la resistencia a TKI de primera y segunda generación.
Gen:
EPCAM
Utilidad clínica:
Se ha demostrado que la molécula de adhesión de las células epiteliales (EpCAM, por sus siglas en inglés) está fuertemente expresada en el cáncer de mama humano y en las células madre cancerosas, y se supone que su sobreexpresión promueve el avance y la metástasis de los tumores. Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión del EPCAM puede correlacionarse con el desarrollo de metástasis en los huesos y una peor supervivencia libre de recurrencias bioquímicas del
cáncer de próstata.
Gen:
ERBB2
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el ERBB2 (HER2) son dianas emergentes asociadas a la respuesta al anticuerpo anti-HER2 (trastuzumab) o a la terapia con TKI (afatinib) en el CPCNP. En el cáncer de mama, la sobreexpresión del ERBB2 o la amplificación del gen se asocia con la respuesta a terapias dirigidas anti-HER2 establecidas. En neoplasias del SNC, se ha detectado mutación de ErbB2/HER-2 en el 8 % al 41 % de los casos de glioblastoma.
Gen:
ESR1
Utilidad clínica:
Las mutaciones activadoras en el ESR1 se asocian con resistencia adquirida a la terapia endocrina en cáncer de mama metastásico dependiente de las hormonas.
Gen:
FANCA
Utilidad clínica:
El gen FANCA es uno de los genes en los cuales las mutaciones conducen a anemia de Fanconi, un trastorno autosómico recesivo poco frecuente caracterizado por anomalías congénitas, insuficiencia de médula ósea y predisposición a malignidades. El FANCA también es un potencial gen de susceptibilidad al cáncer de mama y de ovario. Se asocia a la hipersensibilidad a agentes dañinos del ADN, inestabilidad cromosómica (mayor ruptura cromosómica) y reparación de ADN defectuosa. Los defectos en los genes implicados en la vía de reparación del daño del ADN (DDR, por sus siglas en inglés) surgen como biomarcadores nuevos y dianas para nuevas terapias con fármacos para el cáncer de próstata.
Gen:
FGFR1
Utilidad clínica:
La amplificación del gen FGFR1 predice la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FGFR2
Utilidad clínica:
Las alteraciones del FGFR2, incluida la amplificación, las reorganizaciones y las mutaciones puntuales, predicen la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FOXA1
Utilidad clínica:
La expresión de FOXA1 está directamente relacionada con la expresión del receptor de andrógenos (AR, por sus siglas en inglés). A pesar de eso, se ha descubierto que el FOXA1 es un marcador de predicción de recurrencias superior en comparación con AR en pacientes con cáncer de mama receptor de estrógeno positivo (ER+, por sus siglas en inglés).
Gen:
KRAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones del KRAS en el mCRC son predictivas de beneficio para agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab). En el CPCNP, las mutaciones del KRAS se asocian con resistencia primaria a TKI del EGFR. En el cáncer de mama, se halló que la expresión de ARNm de KRAS es un factor de pronóstico independiente. La función de pronóstico del ARNm de KRAS fue efectiva solo en el cáncer de mama luminal de subtipo A.
Gen:
MLH1
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión de reparación de errores de emparejamiento (MMR, por sus siglas en inglés) de ADN es común en el cáncer de próstata y está vinculada a un resultado poco favorable, así como a características que indican inestabilidad genética. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales, mientras que otros han informado hipermetilación somática del promotor del gen MLH1, que se asocia a la inactivación del gen MLH1, en hasta un 52 % de los tumores de colon. La inestabilidad microsatelital y la deficiencia de reparación de errores de emparejamiento, que pueden surgir en el contexto de mutaciones de MLH1, MSH2, MSH6 y PMS2, sugieren
potencial vulnerabilidad a inhibidores de PD-1.
Gen:
MSH2
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata; las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. La pérdida de la proteína MSH2 se correlaciona con la inactivación de MSH2, hipermutación y una densidad más alta de linfocitos infiltrantes tumorales, y parece ser más frecuente entre los tumores primarios de muy alto grado, para los cuales pueden garantizarse análisis de detección de rutina si se validan en cohortes adicionales.
Gen:
MSH6
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. El MSH6 se asocia con un mayor riesgo de cáncer de mama, y debe considerarse al solicitar pruebas genéticas para personas que tienen antecedentes familiares o personales de cáncer de mama.
Gen:
NBN
Utilidad clínica:
La nibrina, codificada por el gen NBN, participa en la reparación de ADN. Las mutaciones en el gen NBN conducen al síndrome de rotura de Nijmegen (NBS, por sus siglas en inglés), que puede tener como resultado varios tipos de enfermedades, particularmente, susceptibilidad al cáncer, incluido el cáncer de mama. Las variantes polimórficas y las mutaciones defectuosas que ocurren en el gen NBN aumentan el riesgo de cáncer de mama a través del mecanismo de reparación de ruptura de doble cadena. También se encontraron mutaciones/polimorfismos de NBN en melanomas esporádicos y carcinomas de células basales. Además, los pacientes con NBS presentaron diversas anomalías cutáneas, entre ellas, pigmentación anormal de la piel, pelo escaso y fino y, con menos frecuencia, granulomas cutáneos no caseificantes, poroqueratosis y despigmentación. En conjunto, estos hallazgos sugieren una función clave del NBN en la homeostasis de la piel.
Gen:
MYC
Utilidad clínica:
Activa la transcripción de genes relacionados con el crecimiento. Se une al promotor de VEGFA, promoviendo la producción de VEGFA y la posterior angiogénesis por brote. Regulador de la reprogramación de células somáticas, controla la autorrenovación de células madre embrionarias. Actúa con el TAF6L para activar la expresión génica a través del pausado y liberación de la ARN polimerasa II.
Gen:
NF1
Utilidad clínica:
El factor nuclear I (NFI, por sus siglas en inglés) es una familia de factores de transcripción que consta de cuatro genes bien diferenciados, pero estrechamente relacionados: NFIA, NFIB, NFIC y NFIX. Los resultados de un estudio reciente han mostrado que la familia del NFI puede desempeñar un papel fundamental en el avance de diversos tumores humanos y se han identificado como
supresores tumorales clave y oncogenes para numerosos cánceres.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PALB2
Utilidad clínica:
PALB2 (socio y localizador de cáncer de mama 2 [BRCA2, por sus siglas en inglés]) tiene una función importante en el mantenimiento de la integridad del genoma a través de su rol en la anemia de Fanconi (AF) y vías de reparación de ADN por recombinación homóloga (HR, por sus siglas en inglés). PALB2 ha surgido como una proteína supresora de tumores fundamental relacionada con
la susceptibilidad al cáncer hereditario de mama y páncreas. En situaciones de enfermedad avanzada de cáncer de próstata, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, (p. ej., BRCA1, BRCA2, ATM, CHEK2, PALB2), sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
PIK3CA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PIK3CA pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PMS2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales. Además, los pacientes con síndrome de Lynch y mutaciones de PMS2 pueden presentar un riesgo mayor de desarrollar cáncer de mama. En el cáncer de próstata, el PMS2 tiene un rol de supresor tumoral al aumentar la apoptosis en células de cáncer de próstata.
Gen:
POLE
Utilidad clínica:
Se han sugerido las variantes de los genes POLE/POLD1 como potenciales marcadores para inmunoterapia debido a su asociación significativa con la carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés), un indicador eficaz de predicción de la respuesta en inmunoterapia.
Gen:
PTEN
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PTEN pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
RAD51D
Utilidad clínica:
Datos recientes indican que los hombres con cáncer de próstata pueden tener mutaciones de la línea germinal en 1 de 16 genes de reparación de ADN, entre ellos, RAD51D (0.4 %). Los hombres con estos síndromes heredados tienen un mayor riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal del RAD51D se han asociado recientemente con el cáncer de ovario y mama.
Gen:
RB1
Utilidad clínica:
Retinoblastoma 1 (RB1) es un gen que codifica una proteína que es un regulador negativo del ciclo celular, así como un supresor de tumores. Las mutaciones con cambio de sentido, las mutaciones sin sentido, las mutaciones silenciosas y las mutaciones por desplazamiento del marco de lectura se observan en cánceres como
cánceres de las trompas de Falopio, cánceres oculares y cáncer intestinal. El RB1 está alterado en el 4.03 % de todos los cánceres con mayor prevalencia de alteraciones en adenocarcinoma de pulmón, carcinoma ductal invasivo de mama, carcinoma de pulmón de células pequeñas, carcinoma urotelial de vejiga y adenocarcinoma de colon
Gen:
TBX3
Utilidad clínica:
El factor de transcripción T-box 3 (TBX3), un miembro de esta familia de factores T-box, se expresa en varios tejidos y desempeña papeles críticos en, entre otras estructuras, el corazón, la glándula mamaria y las extremidades, y la haploinsuficiencia del gen TBX3 es la base genética del trastorno autosómico
dominante, síndrome ulnar-mamario. Por otra parte, la sobreexpresión del TBX3 se ha vinculado a varios cánceres, entre ellos, melanoma, cáncer de mama, de páncreas, de pulmón, de hígado, de cabeza y cuello, de ovario, carcinomas de vejiga y numerosos subtipos de sarcoma. Además, existe sólida evidencia de que el TBX3 promueve la oncogénesis al impactar en la proliferación, formación de tumores y metástasis, así como en la supervivencia de las células y la resistencia a los fármacos.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.
Gen:
BAP1
Utilidad clínica:
Síndrome de predisposición tumoral (TPDS, por sus siglas en inglés) por mutaciones. Una afección caracterizada por la predisposición a desarrollar una variedad de tumores, entre ellos, tumores melanocíticos benignos, así como varios tumores malignos, entre ellos, melanoma uveal, melanoma cutáneo, mesotelioma maligno por exposición a asbesto, adenocarcinoma de pulmón y meningioma.
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
CDK4
Utilidad clínica:
La pérdida de CDKN2A es común en neoplasias linfoides, tiene implicaciones de pronóstico en algunas neoplasias malignas y presenta una diana terapéutica para inhibidores del CDK4/6.
Gen:
CDKN2A
Utilidad clínica:
La pérdida de CDKN2A es común en neoplasias linfoides, tiene implicaciones de pronóstico en algunas neoplasias malignas y presenta una diana terapéutica para inhibidores del CDK4/6.
Gen:
CTNNB1
Utilidad clínica:
Las mutaciones activadoras del CTNNB1 puede predecir la respuesta a los inhibidores de WNT.
Gen:
EIF1AX
Utilidad clínica:
El gen EIF1AX codifica la proteína vinculada al X del factor de iniciación de traducción eucariota 1A. Esta proteína tiene un papel en la iniciación de la traducción de ARNm a proteína. En el melanoma uveal, se han informado mutaciones en EIF1AX en los dos primeros exones del gen, que codifican
el extremo no estructural de la proteína EIF1AX. Las mutaciones de EIF1AX ocurren en aproximadamente el 17 % al 24 % de los melanomas uveales, y generalmente no se encuentran junto con mutaciones de SF3B1 o BAP1.
Gen:
GNA11
Utilidad clínica:
Se identifican mutaciones somáticas en los genes GNA11 o GNAQ en la mayoría de los casos de melanoma uveal.
Gen:
GNAQ
Utilidad clínica:
Se identifican mutaciones somáticas en los genes GNA11 o GNAQ en la mayoría de los casos de melanoma uveal.
Gen:
GNAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones son específicas del melanoma uveal y otros melanomas no cutáneos, y no se encuentran en tejidos normales, lo cual las hace potenciales dianas terapéuticas.
Gen:
KIT
Utilidad clínica:
En GIST, las mutaciones del KIT predicen la respuesta a TKI (imatinib, sunitinib), con mutaciones secundarias asociadas a la resistencia. En casos de melanoma metastásico, se ha informado una respuesta limitada al imatinib.
Gen:
MAP2K1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del MAP2K1 pueden conferir resistencia a inhibidores del BRAF y el MEK.
Gen:
MITF
Utilidad clínica:
Desempeña un papel importante en el desarrollo de melanocitos al regular la expresión de tirosinasa (TYR, por sus siglas en inglés) y proteína relacionada con la tirosinasa 1 (TYRP1, por sus siglas en inglés). Desempeña un papel fundamental en la diferenciación de diversos tipos de células, como los melanocitos derivados de la cresta neural, mastocitos, osteoclastos y epitelio retiniano derivado de la copa
oftálmica
Gen:
NBN
Utilidad clínica:
La nibrina, codificada por el gen NBN, participa en la reparación de ADN. Las mutaciones en el gen NBN conducen al síndrome de rotura de Nijmegen (NBS, por sus siglas en inglés), que puede tener como resultado varios tipos de enfermedades, particularmente, susceptibilidad al cáncer, incluido el cáncer de mama. Las variantes polimórficas y las mutaciones defectuosas
que ocurren en el gen NBN aumentan el riesgo de cáncer de mama a través del mecanismo de reparación de ruptura de doble cadena. También se encontraron mutaciones/polimorfismos de NBN en melanomas esporádicos y carcinomas de células basales. Además, los pacientes con NBS presentaron diversas anomalías cutáneas, entre ellas, pigmentación anormal de la piel, pelo escaso y fino y, con menos frecuencia, granulomas cutáneos no caseificantes, poroqueratosis y despigmentación. En conjunto, estos hallazgos sugieren una función clave del NBN en la homeostasis de la piel.
Gen:
NF1
Utilidad clínica:
El factor nuclear I (NFI, por sus siglas en inglés) es una familia de factores de transcripción que consta de cuatro genes bien diferenciados, pero estrechamente relacionados: NFIA, NFIB, NFIC y NFIX. Los resultados de un estudio reciente han mostrado que la familia del NFI puede desempeñar un papel fundamental en el avance de diversos tumores humanos y se han identificado como
supresores tumorales clave y oncogenes para numerosos cánceres.
Gen:
NRAS
Utilidad clínica:
Se encuentran mutaciones y sobreexpresión del homólogo del oncogén viral RAS (v‐ras) de neuroblastoma (NRAS, por sus siglas en inglés) en múltiples tipos de tumores y son frecuentes en cánceres altamente metastásicos, como tumores de primario desconocido, melanomas y sarcomas que presentan una llamativa propensión a metástasis en pulmón. Estudios clínicos sugieren que los pacientes con tumores con mutación de NRAS o amplificados sufren una enfermedad de mayor malignidad que los pacientes con alelos NRAS de tipo salvaje. Las mutaciones de NRAS en mCRC son predictivas de falta de beneficio de los agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab), y puede predecir la respuesta a inhibidores de MEK en melanoma metastásico.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PDGFRA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PDGFRA predicen la respuesta a los TKI (imatinib, sunitinib).
Gen:
PIK3CA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PIK3CA pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PTEN
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PTEN pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
RB1
Utilidad clínica:
Retinoblastoma 1 (RB1) es un gen que codifica una proteína que es un regulador negativo del ciclo celular, así como un supresor de tumores. Las mutaciones con cambio de sentido, las mutaciones sin sentido, las mutaciones silenciosas y las mutaciones por desplazamiento del marco de lectura se observan en cánceres como
cánceres de las trompas de Falopio, cánceres oculares y cáncer intestinal. El RB1 está alterado en el 4.03 % de todos los cánceres con mayor prevalencia de alteraciones en adenocarcinoma de pulmón, carcinoma ductal invasivo de mama, carcinoma de pulmón de células pequeñas, carcinoma urotelial de vejiga y adenocarcinoma de colon.
Gen:
SF3B1
Utilidad clínica:
Las mutaciones de SF3B1 se asociaron significativamente con enfermedad de receptor de estrógeno positivo, mutaciones de AKT1 y alteraciones de número de copias distintivas. Un perfilado adicional de mutaciones de zonas específicas en una prueba de subtipos histológicos especiales del cáncer de mama mostró que entre el 16 % y el 6 % de los carcinomas papilares y mucinosos
de mama tenían una mutación de SF3B1 K700E. En el melanoma uveal, las mutaciones de SF3B1 generalmente se asocian con tumores que tienen un pronóstico favorable. Además, las mutaciones de SF3B1 R625 junto con mutaciones de GNAQ y GNA11 son un marcador genético de malignidad en proliferaciones melanocíticas similares a nevo azul. En la leucemia linfocítica crónica (LLC), el SF3B1, se ha hallado la mutación de un factor de empalme expresado de forma ubicua en el 5 % al 17 % de los casos de LLC, en los cuales se asocia a un pronóstico poco favorable, supervivencia general reducida y resistencia al tratamiento con fludarabina.
Gen:
SMO
Utilidad clínica:
El receptor acoplado a proteínas G (GPCR, por sus siglas en inglés) Smoothened (SMO) es un componente de señalización clave de la vía de sonic hedgehog (Hh) y una diana clínicamente validada para el tratamiento del cáncer. Los inhibidores de SMO actualmente aprobados por la FDA son GDC-0449/Vismodegib y LDE225/Sonidegib.
Gen:
SRC
Utilidad clínica:
El protooncogén SRC no receptor de la tirosina quinasa (SRC, por sus siglas en inglés) es un factor importante que impulsa la actividad de YAP/TAZ en las células del cáncer de mama y el melanoma en humanos. La activación de la SRC aumentó la actividad de YAP/TAZ y la expresión de los genes regulados por YAP/TAZ.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.

Perfil de melanoma OnkoSight AdvancedTM (25 genes), TMB y MSI
Código de la prueba: TH59-9

BAP1BRAFCDK4CDKN2ACTNNB1EIF1AXGNA11GNAQGNAS
KITMAP2K1MITFNBNNF1NRASNTRK1PDGFRAPIK3CA
PTENRB1SF3B1SMOSRCTERTTP53
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría
de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
KIT
Utilidad clínica:
En GIST, las mutaciones del KIT predicen la respuesta a TKI (imatinib, sunitinib), con mutaciones secundarias asociadas a la resistencia. En casos de melanoma metastásico, se ha informado una respuesta limitada al imatinib.
Gen:
NF1
Utilidad clínica:
El factor nuclear I (NFI, por sus siglas en inglés) es una familia de factores de transcripción que consta de cuatro genes bien diferenciados, pero estrechamente relacionados: NFIA, NFIB, NFIC y NFIX. Los resultados de un estudio reciente han mostrado que la familia del NFI puede desempeñar un papel fundamental en el avance de diversos tumores humanos y se han identificado como supresores tumorales clave y oncogenes para numerosos cánceres.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PDGFRA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PDGFRA predicen la respuesta a los TKI (imatinib, sunitinib).
Gen:
SDHA
Utilidad clínica:
Las mutaciones de los genes que codifican las subunidades del complejo succinato deshidrogenasa (SDH, por sus siglas en inglés) se describieron en GIST de tipo salvaje KIT/PDGFRA por separado en diferentes informes. El complejo SDH está compuesto o modificado por proteínas codificadas por SDHA, SDHB, SDHC, SDHD y SDHAF2. En GIST, se han informado más comúnmente alteraciones en SDH en SDHB, pero también se han encontrado en SDHC, SDHD y recientemente en SDHA. Las mutaciones de la línea germinal en SDHB y SDHC se han identificado en GIST con deficiencia de SDH, pero parecen representar menos del 15 % de los casos.
Gen:
SDHB
Utilidad clínica:
Las mutaciones de los genes que codifican las subunidades del complejo succinato deshidrogenasa (SDH, por sus siglas en inglés) se describieron en GIST de tipo salvaje KIT/PDGFRA por separado en diferentes informes. El complejo SDH está compuesto o modificado por proteínas codificadas por SDHA, SDHB, SDHC, SDHD y SDHAF2. En GIST, se han informado más comúnmente alteraciones en SDH en SDHB, pero también se han encontrado en SDHC, SDHD y recientemente en SDHA. Las mutaciones de la línea germinal en SDHB y SDHC se han identificado en GIST con deficiencia de SDH, pero parecen representar menos del 15 % de los casos.
Gen:
SDHC
Utilidad clínica:
Las mutaciones de los genes que codifican las subunidades del complejo succinato deshidrogenasa (SDH, por sus siglas en inglés) se describieron en GIST de tipo salvaje KIT/PDGFRA por separado en diferentes informes. El complejo SDH está compuesto o modificado por proteínas codificadas por SDHA, SDHB, SDHC, SDHD y SDHAF2. En GIST, se han informado más comúnmente alteraciones en SDH en SDHB, pero también se han encontrado en SDHC, SDHD y recientemente en SDHA. Las mutaciones de la línea germinal en SDHB y SDHC se han identificado en GIST con deficiencia de SDH, pero parecen representar menos del 15 % de los casos.
Gen:
SDHD
Utilidad clínica:
Las mutaciones de los genes que codifican las subunidades del complejo succinato deshidrogenasa (SDH, por sus siglas en inglés) se describieron en GIST de tipo salvaje KIT/PDGFRA por separado en diferentes informes. El complejo SDH está compuesto o modificado por proteínas codificadas por SDHA, SDHB, SDHC, SDHD y SDHAF2. En GIST, se han informado más comúnmente alteraciones en SDH en SDHB, pero también se han encontrado en SDHC, SDHD y recientemente en SDHA. Las mutaciones de la línea germinal en SDHB y SDHC se han identificado en GIST con deficiencia de SDH, pero parecen representar menos del 15 % de los casos.
Gen:
AKT1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del AKT1 pueden predecir la respuesta a los inhibidores del AKT1/mTOR.
Gen:
AR
Utilidad clínica:
Los receptores de hormonas esteroideas son factores de transcripción activados por ligando que regulan la expresión génica eucariota y afectan la proliferación celular y el ZBTB7A que recluta NCOR1 y NCOR2 para elementos de respuesta a andrógenos (ARE) en genes diana, regulando negativamente la señalización de receptores de andrógenos y la proliferación de células inducidas por andrógenos.
Gen:
ATM
Utilidad clínica:
Un gen de respuesta al daño de ADN que comúnmente se encuentra mutado en el cáncer. Se cree que las mutaciones de la línea germinal en este gen contribuyen a la susceptibilidad al cáncer de mama, y actualmente se encuentra en estudio el potencial de tratamiento de la inhibición de PARP para estos pacientes. En neoplasias linfoides, las mutaciones somáticas del ATM ocurren con frecuencia en linfomas de células del manto (LCM), leucemia linfoblástica crónica (LLC) y leucemia prolinfocítica T (LPL-T).
Gen:
BRCA1
Utilidad clínica:
En situaciones de enfermedad avanzada, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, como BRCA1 y BRCA2, sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
BRCA2
Utilidad clínica:
En situaciones de enfermedad avanzada, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, como BRCA1 y BRCA2, sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
CDH1
Utilidad clínica:
Implicado en mecanismos de regulación de adhesiones celulares, movilidad y proliferación de células epiteliales. Se cree que la pérdida de función de este gen contribuye al avance del cáncer al aumentar la proliferación, la invasión o la metástasis.
Gen:
CHEK2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de este gen se han asociado al síndrome de Li-Fraumeni, un fenotipo de cáncer familiar altamente penetrante generalmente relacionado con mutaciones heredadas del TP53. Además, se cree que las mutaciones de este gen están relacionadas con una predisposición a los sarcomas, cáncer de mama y tumores cerebrales.
Gen:
EGFR
Utilidad clínica:
EGFR pertenece a una familia de cuatro tirosina quinasas que comprenden ErbB1 (EGFR, HER1), ErbB2 (Her-2, Neu), ErbB3 (Her-3) y ErbB4 (Her-4). Se detectaron amplificaciones y mutaciones en EGFR (HER1) en un 45 % a un 57 % de los casos de glioblastoma, lo que indica un rol causal en la patogénesis del glioblastoma. Los EGFR inducen proliferación y se han implicado en la patogénesis del glioblastoma y la resistencia al tratamiento. El EGFR se considera una potencial diana terapéutica para la terapia anti-EGFR en el cáncer de mama triple negativo (TNBC, por sus siglas en inglés). La sensibilización de las mutaciones del EGFR predicen la respuesta a TKI del EGFR en el CPCNP, incluidos TKI aprobados por la FDA (erlotinib, gefitinib y afatinib), mientras que otras mutaciones predicen la resistencia a TKI de primera y segunda generación.
Gen:
EPCAM
Utilidad clínica:
Se ha demostrado que la molécula de adhesión de las células epiteliales (EpCAM, por sus siglas en inglés) está fuertemente expresada en el cáncer de mama humano y en las células madre cancerosas, y se supone que su sobreexpresión promueve el avance y la metástasis de los tumores. Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión del EPCAM puede correlacionarse con el desarrollo de metástasis en los huesos y una peor supervivencia libre de recurrencias bioquímicas del cáncer de próstata.
Gen:
ERBB2
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el ERBB2 (HER2) son dianas emergentes asociadas a la respuesta al anticuerpo anti-HER2 (trastuzumab) o a la terapia con TKI (afatinib) en el CPCNP. En el cáncer de mama, la sobreexpresión del ERBB2 o la amplificación del gen se asocia con la respuesta a terapias dirigidas anti-HER2 establecidas. En neoplasias del SNC, se ha detectado mutación de ErbB2/HER-2 en el 8 % al 41 % de los casos de glioblastoma.
Gen:
ESR1
Utilidad clínica:
Las mutaciones activadoras en el ESR1 se asocian con resistencia adquirida a la terapia endocrina en cáncer de mama metastásico dependiente de las hormonas.
Gen:
FANCA
Utilidad clínica:
El gen FANCA es uno de los genes en los cuales las mutaciones conducen a anemia de Fanconi, un trastorno autosómico recesivo poco frecuente caracterizado por anomalías congénitas, insuficiencia de médula ósea y predisposición a malignidades. El FANCA también es un potencial gen de susceptibilidad al cáncer de mama y de ovario. Se asocia a la hipersensibilidad a agentes dañinos del ADN, inestabilidad cromosómica (mayor ruptura cromosómica) y reparación de ADN defectuosa. Los defectos en los genes implicados en la vía de reparación del daño del ADN (DDR, por sus siglas en inglés) surgen como biomarcadores nuevos y dianas para nuevas terapias con fármacos para el cáncer de próstata.
Gen:
FGFR1
Utilidad clínica:
La amplificación del gen FGFR1 predice la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FGFR2
Utilidad clínica:
Las alteraciones del FGFR2, incluida la amplificación, las reorganizaciones y las mutaciones puntuales, predicen la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FOXA1
Utilidad clínica:
La expresión de FOXA1 está directamente relacionada con la expresión del receptor de andrógenos (AR, por sus siglas en inglés). A pesar de eso, se ha descubierto que el FOXA1 es un marcador de predicción de recurrencias superior en comparación con AR en pacientes con cáncer de mama receptor de estrógeno positivo (ER+, por sus siglas en inglés).
Gen:
KRAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones del KRAS en el mCRC son predictivas de beneficio para agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab). En el CPCNP, las mutaciones del KRAS se asocian con resistencia primaria a TKI del EGFR. En el cáncer de mama, se halló que la expresión de ARNm de KRAS es un factor de pronóstico independiente. La función de pronóstico del ARNm de KRAS fue efectiva solo en el cáncer de mama luminal de subtipo A.
Gen:
MLH1
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión de reparación de errores de emparejamiento (MMR, por sus siglas en inglés) de ADN es común en el cáncer de próstata y está vinculada a un resultado poco favorable, así como a características que indican inestabilidad genética. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales, mientras que otros han informado hipermetilación somática del promotor del gen MLH1, que se asocia a la inactivación del gen MLH1, en hasta un 52 % de los tumores de colon. La inestabilidad microsatelital y la deficiencia de reparación de errores de emparejamiento, que pueden surgir en el contexto de mutaciones de MLH1, MSH2, MSH6 y PMS2, sugieren potencial vulnerabilidad a inhibidores de PD-1.
Gen:
MSH2
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata; las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. La pérdida de la proteína MSH2 se correlaciona con la inactivación de MSH2, hipermutación y una densidad más alta de linfocitos infiltrantes tumorales, y parece ser más frecuente entre los tumores primarios de muy alto grado, para los cuales pueden garantizarse análisis de detección de rutina si se validan en cohortes adicionales.
Gen:
MSH6
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. El MSH6 se asocia con un mayor riesgo de cáncer de mama, y debe considerarse al solicitar pruebas genéticas para personas que tienen antecedentes familiares o personales de cáncer de mama.
Gen:
NBN
Utilidad clínica:
La nibrina, codificada por el gen NBN, participa en la reparación de ADN. Las mutaciones en el gen NBN conducen al síndrome de rotura de Nijmegen (NBS, por sus siglas en inglés), que puede tener como resultado varios tipos de enfermedades, particularmente, susceptibilidad al cáncer, incluido el cáncer de mama. Las variantes polimórficas y las mutaciones defectuosas que ocurren en el gen NBN aumentan el riesgo de cáncer de mama a través del mecanismo de reparación de ruptura de doble cadena. También se encontraron mutaciones/polimorfismos de NBN en melanomas esporádicos y carcinomas de células basales. Además, los pacientes con NBS presentaron diversas anomalías cutáneas, entre ellas, pigmentación anormal de la piel, pelo escaso y fino y, con menos frecuencia, granulomas cutáneos no caseificantes, poroqueratosis y despigmentación. En conjunto, estos hallazgos sugieren una función clave del NBN en la homeostasis de la piel.
Gen:
MYC
Utilidad clínica:
Activa la transcripción de genes relacionados con el crecimiento. Se une al promotor de VEGFA, promoviendo la producción de VEGFA y la posterior angiogénesis por brote. Regulador de la reprogramación de células somáticas, controla la autorrenovación de células madre embrionarias. Actúa con el TAF6L para activar la expresión génica a través del pausado y liberación de la ARN polimerasa II.
Gen:
NF1
Utilidad clínica:
El factor nuclear I (NFI, por sus siglas en inglés) es una familia de factores de transcripción que consta de cuatro genes bien diferenciados, pero estrechamente relacionados: NFIA, NFIB, NFIC y NFIX. Los resultados de un estudio reciente han mostrado que la familia del NFI puede desempeñar un papel fundamental en el avance de diversos tumores humanos y se han identificado como supresores tumorales clave y oncogenes para numerosos cánceres.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PALB2
Utilidad clínica:
PALB2 (socio y localizador de cáncer de mama 2 [BRCA2, por sus siglas en inglés]) tiene una función importante en el mantenimiento de la integridad del genoma a través de su rol en la anemia de Fanconi (AF) y vías de reparación de ADN por recombinación homóloga (HR, por sus siglas en inglés). PALB2 ha surgido como una proteína supresora de tumores fundamental relacionada con la susceptibilidad al cáncer hereditario de mama y páncreas. En situaciones de enfermedad avanzada de cáncer de próstata, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, (p. ej., BRCA1, BRCA2, ATM, CHEK2, PALB2), sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
PIK3CA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PIK3CA pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PMS2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales. Además, los pacientes con síndrome de Lynch y mutaciones de PMS2 pueden presentar un riesgo mayor de desarrollar cáncer de mama. En el cáncer de próstata, el PMS2 tiene un rol de supresor tumoral al aumentar la apoptosis en células de cáncer de próstata.
Gen:
POLE
Utilidad clínica:
Se han sugerido las variantes de los genes POLE/POLD1 como potenciales marcadores para inmunoterapia debido a su asociación significativa con la carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés), un indicador eficaz de predicción de la respuesta en inmunoterapia.
Gen:
PTEN
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PTEN pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
RAD51D
Utilidad clínica:
Datos recientes indican que los hombres con cáncer de próstata pueden tener mutaciones de la línea germinal en 1 de 16 genes de reparación de ADN, entre ellos, RAD51D (0.4 %). Los hombres con estos síndromes heredados tienen un mayor riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal del RAD51D se han asociado recientemente con el cáncer de ovario y mama.
Gen:
RB1
Utilidad clínica:
Retinoblastoma 1 (RB1) es un gen que codifica una proteína que es un regulador negativo del ciclo celular, así como un supresor de tumores. Las mutaciones con cambio de sentido, las mutaciones sin sentido, las mutaciones silenciosas y las mutaciones por desplazamiento del marco de lectura se observan en cánceres como cánceres de las trompas de Falopio, cánceres oculares y cáncer intestinal. El RB1 está alterado en el 4.03 % de todos los cánceres con mayor prevalencia de alteraciones en adenocarcinoma de pulmón, carcinoma ductal invasivo de mama, carcinoma de pulmón de células pequeñas, carcinoma urotelial de vejiga y adenocarcinoma de colon.
Gen:
TBX3
Utilidad clínica:
El factor de transcripción T-box 3 (TBX3), un miembro de esta familia de factores T-box, se expresa en varios tejidos y desempeña papeles críticos en, entre otras estructuras, el corazón, la glándula mamaria y las extremidades, y la haploinsuficiencia del gen TBX3 es la base genética del trastorno autosómico dominante, síndrome ulnar-mamario. Por otra parte, la sobreexpresión del TBX3 se ha vinculado a varios cánceres, entre ellos, melanoma, cáncer de mama, de páncreas, de pulmón, de hígado, de cabeza y cuello, de ovario, carcinomas de vejiga y numerosos subtipos de sarcoma. Además, existe sólida evidencia de que el TBX3 promueve la oncogénesis al impactar en la proliferación, formación de tumores y metástasis, así como en la supervivencia de las células y la resistencia a los fármacos.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.
Gen:
BAP1
Utilidad clínica:
Síndrome de predisposición tumoral (TPDS, por sus siglas en inglés) por mutaciones. Una afección caracterizada por la predisposición a desarrollar una variedad de tumores, entre ellos, tumores melanocíticos benignos, así como varios tumores malignos, entre ellos, melanoma uveal, melanoma cutáneo, mesotelioma maligno por exposición a asbesto, adenocarcinoma de pulmón y meningioma.
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría
de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
CDK4
Utilidad clínica:
La pérdida de CDKN2A es común en neoplasias linfoides, tiene implicaciones de pronóstico en algunas neoplasias malignas y presenta una diana terapéutica para inhibidores del CDK4/6.
Gen:
CDKN2A
Utilidad clínica:
La pérdida de CDKN2A es común en neoplasias linfoides, tiene implicaciones de pronóstico en algunas neoplasias malignas y presenta una diana terapéutica para inhibidores del CDK4/6.
Gen:
CTNNB1
Utilidad clínica:
Las mutaciones activadoras del CTNNB1 puede predecir la respuesta a los inhibidores de WNT.
Gen:
EIF1AX
Utilidad clínica:
El gen EIF1AX codifica la proteína vinculada al X del factor de iniciación de traducción eucariota 1A. Esta proteína tiene un papel en la iniciación de la traducción de ARNm a proteína. En el melanoma uveal, se han informado mutaciones en EIF1AX en los dos primeros exones del gen, que codifican el extremo no estructural de la proteína EIF1AX. Las mutaciones de EIF1AX ocurren en aproximadamente el 17 % al 24 % de los melanomas uveales, y generalmente no se encuentran junto con mutaciones de SF3B1 o BAP1.
Gen:
GNA11
Utilidad clínica:
Se identifican mutaciones somáticas en los genes GNA11 o GNAQ en la mayoría de los casos de melanoma uveal.
Gen:
GNAQ
Utilidad clínica:
Se identifican mutaciones somáticas en los genes GNA11 o GNAQ en la mayoría de los casos de melanoma uveal.
Gen:
GNAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones son específicas del melanoma uveal y otros melanomas no cutáneos, y no se encuentran en tejidos normales, lo cual las hace potenciales dianas terapéuticas.
Gen:
KIT
Utilidad clínica:
En GIST, las mutaciones del KIT predicen la respuesta a TKI (imatinib, sunitinib), con mutaciones secundarias asociadas a la resistencia. En casos de melanoma metastásico, se ha informado una respuesta limitada al imatinib.
Gen:
MAP2K1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del MAP2K1 pueden conferir resistencia a inhibidores del BRAF y el MEK.
Gen:
MITF
Utilidad clínica:
Desempeña un papel importante en el desarrollo de melanocitos al regular la expresión de tirosinasa (TYR, por sus siglas en inglés) y proteína relacionada con la tirosinasa 1 (TYRP1, por sus siglas en inglés). Desempeña un papel fundamental en la diferenciación de diversos tipos de células, como los melanocitos derivados de la cresta neural, mastocitos, osteoclastos y epitelio retiniano derivado de la copa oftálmica
Gen:
NBN
Utilidad clínica:
La nibrina, codificada por el gen NBN, participa en la reparación de ADN. Las mutaciones en el gen NBN conducen al síndrome de rotura de Nijmegen (NBS, por sus siglas en inglés), que puede tener como resultado varios tipos de enfermedades, particularmente, susceptibilidad al cáncer, incluido el cáncer de mama. Las variantes polimórficas y las mutaciones defectuosas que ocurren en el gen NBN aumentan el riesgo de cáncer de mama a través del mecanismo de reparación de ruptura de doble cadena. También se encontraron mutaciones/polimorfismos de NBN en melanomas esporádicos y carcinomas de células basales. Además, los pacientes con NBS presentaron diversas anomalías cutáneas, entre ellas, pigmentación anormal de la piel, pelo escaso y fino y, con menos frecuencia, granulomas cutáneos no caseificantes, poroqueratosis y despigmentación. En conjunto, estos hallazgos sugieren una función clave del NBN en la homeostasis de la piel.
Gen:
NF1
Utilidad clínica:
El factor nuclear I (NFI, por sus siglas en inglés) es una familia de factores de transcripción que consta de cuatro genes bien diferenciados, pero estrechamente relacionados: NFIA, NFIB, NFIC y NFIX. Los resultados de un estudio reciente han mostrado que la familia del NFI puede desempeñar un papel fundamental en el avance de diversos tumores humanos y se han identificado como supresores tumorales clave y oncogenes para numerosos cánceres.
Gen:
NRAS
Utilidad clínica:
Se encuentran mutaciones y sobreexpresión del homólogo del oncogén viral RAS (v‐ras) de neuroblastoma (NRAS, por sus siglas en inglés) en múltiples tipos de tumores y son frecuentes en cánceres altamente metastásicos, como tumores de primario desconocido, melanomas y sarcomas que presentan una llamativa propensión a metástasis en pulmón. Estudios clínicos sugieren que los pacientes con tumores con mutación de NRAS o amplificados sufren una enfermedad de mayor malignidad que los pacientes con alelos NRAS de tipo salvaje. Las mutaciones de NRAS en mCRC son predictivas de falta de beneficio de los agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab), y puede predecir la respuesta a inhibidores de MEK en melanoma metastásico.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PDGFRA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PDGFRA predicen la respuesta a los TKI (imatinib, sunitinib).
Gen:
PIK3CA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PIK3CA pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PTEN
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PTEN pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
RB1
Utilidad clínica:
Retinoblastoma 1 (RB1) es un gen que codifica una proteína que es un regulador negativo del ciclo celular, así como un supresor de tumores. Las mutaciones con cambio de sentido, las mutaciones sin sentido, las mutaciones silenciosas y las mutaciones por desplazamiento del marco de lectura se observan en cánceres como cánceres de las trompas de Falopio, cánceres oculares y cáncer intestinal. El RB1 está alterado en el 4.03 % de todos los cánceres con mayor prevalencia de alteraciones en adenocarcinoma de pulmón, carcinoma ductal invasivo de mama, carcinoma de pulmón de células pequeñas, carcinoma urotelial de vejiga y adenocarcinoma de colon.
Gen:
SF3B1
Utilidad clínica:
Las mutaciones de SF3B1 se asociaron significativamente con enfermedad de receptor de estrógeno positivo, mutaciones de AKT1 y alteraciones de número de copias distintivas. Un perfilado adicional de mutaciones de zonas específicas en una prueba de subtipos histológicos especiales del cáncer de mama mostró que entre el 16 % y el 6 % de los carcinomas papilares y mucinosos de mama tenían una mutación de SF3B1 K700E. En el melanoma uveal, las mutaciones de SF3B1 generalmente se asocian con tumores que tienen un pronóstico favorable. Además, las mutaciones de SF3B1 R625 junto con mutaciones de GNAQ y GNA11 son un marcador genético de malignidad en proliferaciones melanocíticas similares a nevo azul. En la leucemia linfocítica crónica (LLC), el SF3B1, se ha hallado la mutación de un factor de empalme expresado de forma ubicua en el 5 % al 17 % de los casos de LLC, en los cuales se asocia a un pronóstico poco favorable, supervivencia general reducida y resistencia al tratamiento con fludarabina.
Gen:
SMO
Utilidad clínica:
El receptor acoplado a proteínas G (GPCR, por sus siglas en inglés) Smoothened (SMO) es un componente de señalización clave de la vía de sonic hedgehog (Hh) y una diana clínicamente validada para el tratamiento del cáncer. Los inhibidores de SMO actualmente aprobados por la FDA son GDC-0449/Vismodegib y LDE225/Sonidegib.
Gen:
SRC
Utilidad clínica:
El protooncogén SRC no receptor de la tirosina quinasa (SRC, por sus siglas en inglés) es un factor importante que impulsa la actividad de YAP/TAZ en las células del cáncer de mama y el melanoma en humanos. La activación de la SRC aumentó la actividad de YAP/TAZ y la expresión de los genes regulados por YAP/TAZ.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.

Perfil de cáncer de pulmón OnkoSight AdvancedTM (18 genes), TMB y MSI
Código de la prueba: TH49-0

ATK1ALKBRAFDDR2EGFRERBB2FGFR1KRASMAP2K1
METNRASNTRK1PIK3CAPOLD1POLESTK11TERTTP53
Gen:
AKT1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del AKT1 pueden predecir la respuesta a los inhibidores del AKT1/mTOR.
Gen:
ALK
Utilidad clínica:
Las reorganizaciones del gen de la ALK en el CPCNP predicen la respuesta terapéutica a los inhibidores de la ALK, incluidos crizotinib y ceritinib, aprobados por la FDA, y resistencia a los inhibidores del EGFR. Las mutaciones de la ALK y las amplificaciones genéticas se asocian con resistencia adquirida al crizotinib y respuesta variable a inhibidores de la ALK de segunda generación.
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos
con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
DDR2
Utilidad clínica:
En el cáncer de pulmón de células escamosas, las mutaciones del DDR2 pueden predecir la respuesta al dasatinib y otros inhibidores del receptor de la tirosina quinasa (TKI).
Gen:
EGFR
Utilidad clínica:
EGFR pertenece a una familia de cuatro tirosina quinasas que comprenden ErbB1 (EGFR, HER1), ErbB2 (Her-2, Neu), ErbB3 (Her-3) y ErbB4 (Her-4). Se detectaron amplificaciones y mutaciones en EGFR (HER1) en un 45 % a un 57 % de los casos de glioblastoma, lo que indica un rol causal en la patogénesis del glioblastoma. Los EGFR inducen proliferación y se han implicado en la patogénesis del glioblastoma y la resistencia al tratamiento. El EGFR se considera una potencial diana terapéutica para la terapia anti-EGFR en el cáncer de mama triple negativo (TNBC, por sus siglas en inglés). La sensibilización de las mutaciones del EGFR predicen la respuesta a TKI del EGFR en el CPCNP, incluidos TKI aprobados por la FDA (erlotinib, gefitinib y afatinib), mientras que otras mutaciones predicen la resistencia a TKI de primera y segunda generación.
Gen:
ERBB2
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el ERBB2 (HER2) son dianas emergentes asociadas a la respuesta al anticuerpo anti-HER2 (trastuzumab) o a la terapia con TKI (afatinib) en el CPCNP. En el cáncer de mama, la sobreexpresión del ERBB2 o la amplificación del gen se asocia con la respuesta a terapias dirigidas anti-HER2 establecidas. En neoplasias del SNC, se ha detectado mutación de ErbB2/HER-2 en el 8 % al 41 % de los casos de glioblastoma.
Gen:
FGFR1
Utilidad clínica:
La amplificación del gen FGFR1 predice la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
KRAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones del KRAS en el mCRC son predictivas de beneficio para agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab). En el CPCNP, las mutaciones del KRAS se asocian con resistencia primaria a TKI del EGFR. En el cáncer de mama, se halló que la expresión de ARNm de KRAS es un factor de pronóstico independiente. La función de pronóstico del ARNm de KRAS fue efectiva solo en el cáncer de mama luminal de subtipo A.
Gen:
MAP2K1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del MAP2K1 pueden conferir resistencia a inhibidores del BRAF y el MEK.
Gen:
MET
Utilidad clínica:
Las alteraciones del MET en tumores sólidos, incluida la amplificación y las mutaciones, pueden predecir la respuesta a los inhibidores del MET. La amplificación del MET se ha asociado a resistencia adquirida a TKI anti-EGFR en cáncer de pulmón.
Gen:
NRAS
Utilidad clínica:
Se encuentran mutaciones y sobreexpresión del homólogo del oncogén viral RAS (v‐ras) de neuroblastoma (NRAS, por sus siglas en inglés) en múltiples tipos de tumores y son frecuentes en cánceres altamente metastásicos, como tumores de primario desconocido, melanomas y sarcomas que presentan una llamativa propensión a metástasis en pulmón. Estudios clínicos sugieren que los pacientes con tumores con mutación de NRAS o amplificados sufren una enfermedad de mayor malignidad que los pacientes con alelos NRAS de tipo salvaje. Las mutaciones de NRAS en mCRC son predictivas de falta de beneficio de los agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab), y puede predecir la respuesta a inhibidores de MEK en melanoma metastásico.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PIK3CA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PIK3CA pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
POLD1
Utilidad clínica:
Se han sugerido las variantes de los genes POLE/POLD1 como potenciales marcadores para inmunoterapia debido a su asociación significativa con la carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés), un indicador eficaz de predicción de la respuesta en inmunoterapia.
Gen:
POLE
Utilidad clínica:
Se han sugerido las variantes de los genes POLE/POLD1 como potenciales marcadores para inmunoterapia debido a su asociación significativa con la carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés), un indicador eficaz de predicción de la respuesta en inmunoterapia.
Gen:
STK11
Utilidad clínica:
El STK11/LKB1 se encuentra entre los supresores tumorales más comúnmente inactivados en cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC, por sus siglas en inglés), especialmente en tumores con mutaciones de KRAS. En un estudio clínico, se halló que las alteraciones de STK11/LKB1 son el factor genómico más prevalente de la resistencia primaria a inhibidores de eje PD-1 en adenocarcinoma de pulmón con mutación de KRAS. Las mutaciones en este gen se han asociado a síndrome de Peutz-Jeghers (SPJ), un trastorno autosómico dominante caracterizado por el crecimiento de pólipos en el tracto gastrointestinal, máculas pigmentadas en la piel y la boca, y otras neoplasias. Varios informes publicados han demostrado que el SPJ predispone a los portadores a cánceres del tracto gastrointestinal, así como a susceptibilidad a una variedad de tumores.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.
Gen:
AR
Utilidad clínica:
Los receptores de hormonas esteroideas son factores de transcripción activados por ligando que regulan la expresión génica eucariota y afectan la proliferación celular y el ZBTB7A que recluta NCOR1 y NCOR2 para elementos de respuesta a andrógenos (ARE) en genes diana, regulando negativamente la señalización de receptores de andrógenos y la proliferación de células inducidas por andrógenos
Gen:
ATM
Utilidad clínica:
Un gen de respuesta al daño de ADN que comúnmente se encuentra mutado en el cáncer. Se cree que las mutaciones de la línea germinal en este gen contribuyen a la susceptibilidad al cáncer de mama, y actualmente se encuentra en estudio el potencial de tratamiento de la inhibición de PARP para estos pacientes. En neoplasias linfoides, las mutaciones somáticas del ATM ocurren con frecuencia en linfomas de células del manto (LCM), leucemia linfoblástica crónica (LLC) y leucemia prolinfocítica
T (LPL-T).
Gen:
BRCA1
Utilidad clínica:
En situaciones de enfermedad avanzada, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, como BRCA1 y BRCA2, sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
BRCA2
Utilidad clínica:
En situaciones de enfermedad avanzada, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, como BRCA1 y BRCA2, sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
CHEK2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de este gen se han asociado al síndrome de Li-Fraumeni, un fenotipo de cáncer familiar altamente penetrante generalmente relacionado con mutaciones heredadas del TP53. Además, se cree que las mutaciones de este gen están relacionadas con una predisposición a los sarcomas, cáncer de mama y tumores cerebrales
Gen:
EPCAM
Utilidad clínica:
Se ha demostrado que la molécula de adhesión de las células epiteliales (EpCAM, por sus siglas en inglés) está fuertemente expresada en el cáncer de mama humano y en las células madre cancerosas, y se supone que su sobreexpresión promueve el avance y la metástasis de los tumores. Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión del EPCAM puede correlacionarse con el desarrollo de metástasis en los huesos y una peor supervivencia libre de recurrencias bioquímicas del cáncer de próstata.
Gen:
FANCA
Utilidad clínica:
El gen FANCA es uno de los genes en los cuales las mutaciones conducen a anemia de Fanconi, un trastorno autosómico recesivo poco frecuente caracterizado por anomalías congénitas, insuficiencia de médula ósea y predisposición a malignidades. El FANCA también es un potencial gen
de susceptibilidad al cáncer de mama y de ovario. Se asocia a la hipersensibilidad a agentes dañinos del ADN, inestabilidad cromosómica (mayor ruptura cromosómica) y reparación de ADN defectuosa. Los defectos en los genes implicados en la vía de reparación del daño del ADN (DDR, por sus siglas en inglés) surgen como biomarcadores nuevos y dianas para nuevas terapias con fármacos para el cáncer de próstata.
Gen:
HOXB13
Utilidad clínica:
HOXB13, un miembro de la familia de las proteínas homeobox, es un regulador clave de la diferenciación epitelial en la glándula prostática. El HOXB13 está sobreexpresado durante el avance maligno del tejido prostático, y se sospecha que contribuye a la patogénesis de la glándula prostática. El HOXB13 junto con las mutaciones de BRCA2 han demostrado de forma sistemática aumentar el riesgo de cáncer de próstata, y se observa más comúnmente en pacientes con diagnóstico de enfermedad de inicio temprano.
Gen:
MLH1
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión de reparación de errores de emparejamiento (MMR, por sus siglas en inglés) de ADN es común en el cáncer de próstata y está vinculada a un resultado poco favorable, así como a características que indican inestabilidad genética. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales, mientras que otros han
informado hipermetilación somática del promotor del gen MLH1, que se asocia a la inactivación del gen MLH1, en hasta un 52 % de los tumores de colon. La inestabilidad microsatelital y la deficiencia de reparación de errores de emparejamiento, que pueden surgir en el contexto de mutaciones de MLH1, MSH2, MSH6 y PMS2, sugieren potencial vulnerabilidad a inhibidores de PD-1.
Gen:
MSH2
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata; las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. La pérdida de la proteína MSH2 se correlaciona con la inactivación de MSH2, hipermutación y una densidad más alta de linfocitos infiltrantes tumorales, y parece ser más
frecuente entre los tumores primarios de muy alto grado, para los cuales pueden garantizarse análisis de detección de rutina si se validan en cohortes adicionales.
Gen:
MSH6
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. El MSH6 se asocia con un mayor riesgo de cáncer de mama, y debe considerarse al solicitar pruebas genéticas para personas que tienen antecedentes familiares o personales de cáncer de mama.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PALB2
Utilidad clínica:
PALB2 (socio y localizador de cáncer de mama 2 [BRCA2, por sus siglas en inglés]) tiene una función importante en el mantenimiento de la integridad del genoma a través de su rol en la anemia de Fanconi (AF) y vías de reparación de ADN por recombinación homóloga (HR, por sus siglas en inglés). PALB2 ha surgido como una proteína supresora de tumores fundamental relacionada con la susceptibilidad al cáncer hereditario de mama y páncreas. En situaciones de enfermedad avanzada de cáncer de próstata, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, (p. ej., BRCA1, BRCA2, ATM, CHEK2, PALB2), sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
PMS2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales. Además, los pacientes con síndrome de Lynch y mutaciones de PMS2 pueden presentar un riesgo mayor de desarrollar cáncer de mama. En el cáncer de próstata, el PMS2 tiene un rol de supresor tumoral al aumentar la apoptosis en células de cáncer de próstata.
Gen:
PTEN
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PTEN pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
RAD51D
Utilidad clínica:
Datos recientes indican que los hombres con cáncer de próstata pueden tener mutaciones de la línea germinal en 1 de 16 genes de reparación de ADN, entre ellos, RAD51D (0.4 %). Los hombres con estos síndromes heredados tienen un mayor riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal del RAD51D se han asociado recientemente con el cáncer de ovario y mama.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida
en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
AKT1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del AKT1 pueden predecir la respuesta a los inhibidores del AKT1/mTOR.
Gen:
ALK
Utilidad clínica:
Las reorganizaciones del gen de la ALK en el CPCNP predicen la respuesta terapéutica a los inhibidores de la ALK, incluidos crizotinib y ceritinib, aprobados por la FDA, y resistencia a los inhibidores del EGFR. Las mutaciones de la ALK y las amplificaciones genéticas se asocian con resistencia adquirida al crizotinib y respuesta variable a inhibidores de la ALK de segunda generación.
Gen:
APC
Utilidad clínica:
Supresor de tumores. Promueve la rápida degradación de CTNNB1 y participa en señalización de Wnt como regulador negativo. Se requiere para regulación ascendente de MMP9 a través de la vía de señalización de JNK en células de tumores colorrectales.
Gen:
ARID1A
Utilidad clínica:
El ARID1A se encuentra mutado en más del 50 % de los carcinomas de células claras de ovario y en un 30 % de los carcinomas endometrioides. La mutación del ARID1A es un conocido causante genético de cáncer de ovario. Más del 90 % de las mutaciones de ARID1A observadas en el cáncer de ovario son mutaciones por desplazamiento del marco de lectura o mutaciones sin sentido que tienen como resultado pérdida de la expresión de la proteína ARID1A. La pérdida de ARID1A se correlaciona con enfermedad en etapa tardía y predice la recurrencia temprana del carcinoma de células claras de ovario.
Gen:
ATM
Utilidad clínica:
Un gen de respuesta al daño de ADN que comúnmente se encuentra mutado en el cáncer. Se cree que las mutaciones de la línea germinal en este gen contribuyen a la susceptibilidad al cáncer de mama, y actualmente se encuentra en estudio el potencial de tratamiento de la inhibición de PARP para estos pacientes. En neoplasias linfoides, las mutaciones somáticas del ATM ocurren con frecuencia en linfomas de células del manto (LCM), leucemia linfoblástica crónica (LLC) y leucemia prolinfocítica T (LPL-T).
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos
con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
CDH1
Utilidad clínica:
Implicado en mecanismos de regulación de adhesiones celulares, movilidad y proliferación de células epiteliales. Se cree que la pérdida de función de este gen contribuye al avance del cáncer al aumentar la proliferación, la invasión o la metástasis
Gen:
CDKN2A
Utilidad clínica:
La pérdida de CDKN2A es común en neoplasias linfoides, tiene implicaciones de pronóstico en algunas neoplasias malignas y presenta una diana terapéutica para inhibidores del CDK4/6.
Gen:
CTNNB1
Utilidad clínica:
Las mutaciones activadoras del CTNNB1 puede predecir la respuesta a los inhibidores de WNT.
Gen:
EGFR
Utilidad clínica:
EGFR pertenece a una familia de cuatro tirosina quinasas que comprenden ErbB1 (EGFR, HER1), ErbB2 (Her-2, Neu), ErbB3 (Her-3) y ErbB4 (Her-4). Se detectaron amplificaciones y mutaciones en EGFR (HER1) en un 45 % a un 57 % de los casos de glioblastoma, lo que indica un rol causal en la patogénesis del glioblastoma. Los EGFR inducen proliferación y se han implicado en la patogénesis del glioblastoma y la resistencia al tratamiento. El EGFR se considera una potencial diana terapéutica para la terapia anti-EGFR en el cáncer de mama triple negativo (TNBC, por sus siglas en inglés). La sensibilización de las mutaciones del EGFR predicen la respuesta a TKI del EGFR en el CPCNP, incluidos TKI aprobados por la FDA (erlotinib, gefitinib y afatinib), mientras que otras mutaciones predicen la resistencia a TKI de primera y segunda generación.
Gen:
EPCAM
Utilidad clínica:
Se ha demostrado que la molécula de adhesión de las células epiteliales (EpCAM, por sus siglas en inglés) está fuertemente expresada en el cáncer de mama humano y en las células madre cancerosas, y se supone que su sobreexpresión promueve el avance y la metástasis de los tumores. Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión del EPCAM puede correlacionarse con el
desarrollo de metástasis en los huesos y una peor supervivencia libre de recurrencias bioquímicas del cáncer de próstata.
Gen:
ERBB2
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el ERBB2 (HER2) son dianas emergentes asociadas a la respuesta al anticuerpo anti-HER2 (trastuzumab) o a la terapia con TKI (afatinib) en el CPCNP. En el cáncer de mama, la sobreexpresión del ERBB2 o la amplificación del gen se asocia con la respuesta a terapias dirigidas anti-HER2 establecidas. En neoplasias del SNC, se ha detectado mutación de ErbB2/HER-2 en el 8 % al 41 % de los casos de glioblastoma.
Gen:
ERBB4
Utilidad clínica:
La red de señalización de ErbB desempeña un papel crucial en el crecimiento y avance de varios tipos de cáncer, entre ellos, el cáncer colorrectal (CCR), e incluye genes potencialmente tratables con fármacos. La activación de oncogenes de la vía de ErbB por mutaciones y amplificaciones focales ha surgido recientemente como un importante marcador predictivo de pronóstico de los pacientes con CCR.
Gen:
FBXW7
Utilidad clínica:
Se han observado mutaciones en el supresor de tumores FBXW7 en algunas neoplasias malignas hematológicas, entre ellas, leucemia linfática crónica (LLC) y leucemia linfoblástica aguda de células T (LLA-T).
Gen:
FGFR1
Utilidad clínica:
La amplificación del gen FGFR1 predice la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FGFR2
Utilidad clínica:
Las alteraciones del FGFR2, incluida la amplificación, las reorganizaciones y las mutaciones puntuales, predicen la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FGFR3
Utilidad clínica:
Las alteraciones del FGFR3, incluida la amplificación, las reorganizaciones y las mutaciones puntuales, predicen la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
GNA11
Utilidad clínica:
Se identifican mutaciones somáticas en los genes GNA11 o GNAQ en la mayoría de los casos de melanoma uveal.
Gen:
GNAQ
Utilidad clínica:
Se identifican mutaciones somáticas en los genes GNA11 o GNAQ en la mayoría de los casos de melanoma uveal.
Gen:
GNAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones son específicas del melanoma uveal y otros melanomas no cutáneos, y no se encuentran en tejidos normales, lo cual las hace potenciales dianas terapéuticas.
Gen:
HRAS
Utilidad clínica:
Las proteínas RAS (KRAS4A, KRAS4B, NRAS y HRAS) funcionan como interruptores de encendido y apagado binarios con regulación GDP–GTP, que regulan las redes de señalización citoplasmática que controlan los diversos procesos celulares normales. Las mutaciones con cambio de sentido de ganancia de función en genes RAS se encuentran en un ∼25 % de los cánceres humanos, lo que genera interés en identificar las estrategias terapéuticas anti-RAS para el tratamiento del cáncer. Las mutaciones del RAS
tienen un valor predictivo positivo alto para malignidad en tumores de tiroides, y ayudan en el diagnóstico de lesiones tiroideas foliculares.
Gen:
IDH1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del IDH (IDH1 e IDH2) son más relevantes en gliomas difusos de bajo grado, y en glioblastomas secundarios, se asocian con un mejor pronóstico en gliomas de bajo grado, y pueden predecir la respuesta a la terapia (inhibidores del IDH, temozolomida). En la leucemia mieloide aguda (LMA), las mutaciones somáticas en IDH1 e IDH2 son altamente recurrentes y son casi exclusivamente heterocigotas, y ocurren con mayor frecuencia en LMA
en citogenética normal.
Gen:
IDH2
Utilidad clínica:
Las mutaciones del IDH (IDH1 e IDH2) son más relevantes en gliomas difusos de bajo grado, y en glioblastomas secundarios, se asocian con un mejor pronóstico en gliomas de bajo grado, y pueden predecir la respuesta a la terapia (inhibidores del IDH, temozolomida). En la leucemia mieloide aguda (LMA), las mutaciones somáticas en IDH1 e IDH2 son altamente recurrentes y son casi exclusivamente heterocigotas, y ocurren con mayor frecuencia en LMA
en citogenética normal.
Gen:
KDR
Utilidad clínica:
KDR codifica uno de los dos receptores del factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF), que es un importante factor de crecimiento de las células endoteliales. Las mutaciones de este gen están implicadas en hemangiomas capilares infantiles.
Gen:
KIT
Utilidad clínica:
En GIST, las mutaciones del KIT predicen la respuesta a TKI (imatinib, sunitinib), con mutaciones secundarias asociadas a la resistencia. En casos de melanoma metastásico, se ha informado una respuesta limitada al imatinib.
Gen:
KRAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones del KRAS en el mCRC son predictivas de beneficio para agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab). En el CPCNP, las mutaciones del KRAS se asocian con resistencia primaria a TKI del EGFR. En el cáncer de mama, se halló que la expresión de ARNm de KRAS es un factor de pronóstico independiente. La función de pronóstico del ARNm de KRAS fue efectiva solo en el cáncer de mama luminal de subtipo A.
Gen:
MEN1
Utilidad clínica:
La neoplasia endocrina múltiple tipo 1 (MEN1, por sus siglas en inglés) es una afección hereditaria asociada a tumores de las glándulas endocrinas (que producen hormonas). Una mutación del gen MEN1 representa para una persona un mayor riesgo de desarrollar tumores endocrinos. Los tumores más comunes que se ven en MEN1 implican las glándulas paratiroides, células de islotes pancreáticos y la glándula pituitaria. Otros tumores endocrinos que se ven en MEN1 incluyen tumores corticoadrenales, tumores neuroendocrinos (anteriormente llamados “tumores carcinoides”) y feocromocitomas poco frecuentes, así como tumores en otras partes del tracto digestivo.
Gen:
MET
Utilidad clínica:
Las alteraciones del MET en tumores sólidos, incluida la amplificación y las mutaciones, pueden predecir la respuesta a los inhibidores del MET. La amplificación del MET se ha asociado a resistencia adquirida a TKI anti-EGFR en cáncer de pulmón.
Gen:
MLH1
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión de reparación de errores de emparejamiento (MMR, por sus siglas en inglés) de ADN es común en el cáncer de próstata y está vinculada a un resultado poco favorable, así como a características que indican inestabilidad genética. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales, mientras que otros han informado hipermetilación somática del promotor del gen MLH1, que se asocia a la inactivación del gen MLH1, en hasta un 52 % de los tumores de colon. La inestabilidad microsatelital y la deficiencia de reparación de errores de emparejamiento, que pueden surgir en el contexto de mutaciones de MLH1, MSH2, MSH6 y PMS2, sugieren potencial vulnerabilidad a inhibidores de PD-1.
Gen:
MSH2
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata; las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. La pérdida de la proteína MSH2 se correlaciona con la inactivación de MSH2, hipermutación y una densidad más alta de linfocitos infiltrantes tumorales, y parece ser más frecuente entre los tumores primarios de muy alto grado, para los cuales pueden garantizarse análisis de detección de rutina si se validan en cohortes adicionales.
Gen:
MSH6
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. El MSH6 se asocia con un mayor riesgo de cáncer de mama, y debe considerarse al solicitar pruebas genéticas para personas que tienen
antecedentes familiares o personales de cáncer de mama.
Gen:
NOTCH1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del NOTCH1 pueden asociarse con un mal pronóstico en un subgrupo de CPCNP. El NOTCH1 puede contribuir a la resistencia a TKI en CPCNP. Entre el 4 % y el 15% de los casos de leucemia linfocítica crónica (LLC) presentan mutaciones en NOTCH1. Las mutaciones en NOTCH1 son más frecuentes en casos sin mutación de IGVH y se han asociado a avance de la enfermedad. Más específicamente, las mutaciones de NOTCH1 se han encontrado en hasta un 42 % de los casos de LLC con trisomía del par 12.
Gen:
NRAS
Utilidad clínica:
Se encuentran mutaciones y sobreexpresión del homólogo del oncogén viral RAS (v‐ras) de neuroblastoma (NRAS, por sus siglas en inglés) en múltiples tipos de tumores y son frecuentes en cánceres altamente metastásicos, como tumores de primario desconocido, melanomas y sarcomas que presentan una llamativa propensión a metástasis en pulmón. Estudios clínicos sugieren que los pacientes con tumores con mutación de NRAS o amplificados sufren una enfermedad de mayor malignidad que los pacientes con alelos NRAS de tipo salvaje. Las mutaciones de NRAS en mCRC son predictivas de falta de beneficio de los agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab), y puede predecir la respuesta a inhibidores de MEK en melanoma
metastásico.
Gen:
PDGFRA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PDGFRA predicen la respuesta a los TKI (imatinib, sunitinib).
Gen:
PIK3CA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PIK3CA pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PMS2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales. Además, los pacientes con síndrome de Lynch y mutaciones de PMS2 pueden presentar un riesgo mayor de desarrollar cáncer de mama. En el cáncer de próstata, el PMS2 tiene un rol de supresor tumoral al aumentar la apoptosis en células de cáncer de próstata.
Gen:
POLE
Utilidad clínica:
Se han sugerido las variantes de los genes POLE/POLD1 como potenciales marcadores para inmunoterapia debido a su asociación significativa con la carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés), un indicador eficaz de predicción de la respuesta en inmunoterapia.
Gen:
PTEN
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PTEN pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PTPN11
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el PTPN11 ocurren en varios tipos de neoplasias malignas hematológicas, con más frecuencia en pacientes con LMMJ.
Gen:
RB1
Utilidad clínica:
Retinoblastoma 1 (RB1) es un gen que codifica una proteína que es un regulador negativo del ciclo celular, así como un supresor de tumores. Las mutaciones con cambio de sentido, las mutaciones sin sentido, las mutaciones silenciosas y las mutaciones por desplazamiento del marco de lectura se observan en cánceres como cánceres de las trompas de Falopio, cánceres oculares y cáncer intestinal. El RB1 está alterado en el 4.03 % de todos los cánceres con mayor prevalencia de alteraciones en adenocarcinoma de pulmón, carcinoma ductal invasivo de mama, carcinoma de pulmón de células pequeñas, carcinoma urotelial de vejiga y adenocarcinoma de colon
Gen:
RET
Utilidad clínica:
Las anomalías del RET, incluidas las reorganizaciones y mutaciones, predicen la respuesta a los inhibidores multicinasa. Las mutaciones puntuales del RET se han asociado a un pronóstico adverso en carcinomas de tiroides medulares esporádicos.
Gen:
SMAD4
Utilidad clínica:
Un gen supresor de tumores que se encuentra en al menos 26 tipos de cáncer, con frecuencias más altas en cánceres del tracto gastrointestinal, por ejemplo, cáncer de esófago, estómago, páncreas y colorrectal. Además, la pérdida de SMAD4 en tumores afecta el avance del cáncer y la terapia, por ejemplo, una respuesta reducida a la quimioterapia adyuvante.
Gen:
SMO
Utilidad clínica:
El receptor acoplado a proteínas G (GPCR, por sus siglas en inglés) Smoothened (SMO) es un componente de señalización clave de la vía de sonic hedgehog (Hh) y una diana clínicamente validada para el tratamiento del cáncer. Los inhibidores de SMO actualmente aprobados por la FDA son GDC-0449/Vismodegib y LDE225/Sonidegib.
Gen:
SRC
Utilidad clínica:
El protooncogén SRC no receptor de la tirosina quinasa (SRC, por sus siglas en inglés) es un factor importante que impulsa la actividad de YAP/TAZ en las células del cáncer de mama y el melanoma en humanos. La activación de la SRC aumentó la actividad de YAP/TAZ y la expresión de los genes regulados por YAP/TAZ.
Gen:
STK11
Utilidad clínica:
El STK11/LKB1 se encuentra entre los supresores tumorales más comúnmente inactivados en cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC, por sus siglas en inglés), especialmente en tumores con mutaciones de KRAS. En un estudio clínico, se halló que las alteraciones de STK11/LKB1 son el factor genómico más prevalente de la resistencia primaria a inhibidores de eje PD-1 en adenocarcinoma de pulmón con mutación de KRAS. Las mutaciones en este gen se han asociado a síndrome de Peutz-Jeghers (SPJ), un trastorno autosómico dominante caracterizado por el crecimiento de pólipos en el tracto gastrointestinal, máculas pigmentadas en la piel y la boca, y otras neoplasias. Varios informes publicados han demostrado que el SPJ predispone a los portadores a cánceres del tracto gastrointestinal, así como a susceptibilidad a una variedad de tumores.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TSC1
Utilidad clínica:
La mutación de TSC1 o TSC2 es responsable del complejo de esclerosis tuberosa, que es un trastorno autosómico dominante caracterizado por manifestación en la piel y formación de múltiples tumores en diferentes órganos, principalmente en el sistema nervioso central.
Gen:
TSC2
Utilidad clínica:
La mutación de TSC1 o TSC2 es responsable del complejo de esclerosis tuberosa, que es un trastorno autosómico dominante caracterizado por manifestación en la piel y formación de múltiples tumores en diferentes órganos, principalmente en el sistema nervioso central.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.
Gen:
VHL
Utilidad clínica:
Las mutaciones de VHL predisponen al desarrollo de una amplia variedad de tumores (más comúnmente, hemangioblastomas del sistema nervioso central y retinianos, carcinoma renal de células claras y feocromocitomas). El hemangioblastoma (CHB, por sus siglas en inglés) del sistema nervioso central es la manifestación más común de la enfermedad de VHL. Las mutaciones de la línea germinal en el gen supresor tumoral VHL son responsables del síndrome de predisposición al cáncer heredado o enfermedad de von Hippel-Lindau (VHL).

Perfil de cáncer de próstata OnkoSight AdvancedTM (28 genes), TMB y
MSI
Código de la prueba: TH48-2

ARATMBARD1BRCA1BRCA2BRIP1CDK12CHEK1 CHEK2
EPCAMFANCAFANCLHOXB13MLH1MSH2MSH6NTRK1PALB2
PMS2PPP2R2APTENRAD51BRAD51CRAD51DRAD54LRB1TERT
TP53
Gen:
AKT1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del AKT1 pueden predecir la respuesta a los inhibidores del AKT1/mTOR.
Gen:
ALK
Utilidad clínica:
Las reorganizaciones del gen de la ALK en el CPCNP predicen la respuesta terapéutica a los inhibidores de la ALK, incluidos crizotinib y ceritinib, aprobados por la FDA, y resistencia a los inhibidores del EGFR. Las mutaciones de la ALK y las amplificaciones genéticas se asocian con resistencia adquirida al crizotinib y respuesta variable a inhibidores de la ALK de segunda generación.
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos
con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
DDR2
Utilidad clínica:
En el cáncer de pulmón de células escamosas, las mutaciones del DDR2 pueden predecir la respuesta al dasatinib y otros inhibidores del receptor de la tirosina quinasa (TKI).
Gen:
EGFR
Utilidad clínica:
EGFR pertenece a una familia de cuatro tirosina quinasas que comprenden ErbB1 (EGFR, HER1), ErbB2 (Her-2, Neu), ErbB3 (Her-3) y ErbB4 (Her-4). Se detectaron amplificaciones y mutaciones en EGFR (HER1) en un 45 % a un 57 % de los casos de glioblastoma, lo que indica un rol causal en la patogénesis del glioblastoma. Los EGFR inducen proliferación y se han implicado en la patogénesis del glioblastoma y la resistencia al tratamiento. El EGFR se considera una potencial diana terapéutica para la terapia anti-EGFR en el cáncer de mama triple negativo (TNBC, por sus siglas en inglés). La sensibilización de las mutaciones del EGFR predicen la respuesta a TKI del EGFR en el CPCNP, incluidos TKI aprobados por la FDA (erlotinib, gefitinib y afatinib), mientras que otras mutaciones predicen la resistencia a TKI de primera y segunda generación.
Gen:
ERBB2
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el ERBB2 (HER2) son dianas emergentes asociadas a la respuesta al anticuerpo anti-HER2 (trastuzumab) o a la terapia con TKI (afatinib) en el CPCNP. En el cáncer de mama, la sobreexpresión del ERBB2 o la amplificación del gen se asocia con la respuesta a terapias dirigidas anti-HER2 establecidas. En neoplasias del SNC, se ha detectado mutación de ErbB2/HER-2 en el 8 % al 41 % de los casos de glioblastoma.
Gen:
FGFR1
Utilidad clínica:
La amplificación del gen FGFR1 predice la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
KRAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones del KRAS en el mCRC son predictivas de beneficio para agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab). En el CPCNP, las mutaciones del KRAS se asocian con resistencia primaria a TKI del EGFR. En el cáncer de mama, se halló que la expresión de ARNm de KRAS es un factor de pronóstico independiente. La función de pronóstico del ARNm de KRAS fue efectiva solo en el cáncer de mama luminal de subtipo A.
Gen:
MAP2K1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del MAP2K1 pueden conferir resistencia a inhibidores del BRAF y el MEK.
Gen:
MET
Utilidad clínica:
Las alteraciones del MET en tumores sólidos, incluida la amplificación y las mutaciones, pueden predecir la respuesta a los inhibidores del MET. La amplificación del MET se ha asociado a resistencia adquirida a TKI anti-EGFR en cáncer de pulmón.
Gen:
NRAS
Utilidad clínica:
Se encuentran mutaciones y sobreexpresión del homólogo del oncogén viral RAS (v‐ras) de neuroblastoma (NRAS, por sus siglas en inglés) en múltiples tipos de tumores y son frecuentes en cánceres altamente metastásicos, como tumores de primario desconocido, melanomas y sarcomas que presentan una llamativa propensión a metástasis en pulmón. Estudios clínicos sugieren que los pacientes con tumores con mutación de NRAS o amplificados sufren una enfermedad de mayor malignidad que los pacientes con alelos NRAS de tipo salvaje. Las mutaciones de NRAS en mCRC son predictivas de falta de beneficio de los agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab), y puede predecir la respuesta a inhibidores de MEK en melanoma metastásico.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PIK3CA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PIK3CA pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
POLD1
Utilidad clínica:
Se han sugerido las variantes de los genes POLE/POLD1 como potenciales marcadores para inmunoterapia debido a su asociación significativa con la carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés), un indicador eficaz de predicción de la respuesta en inmunoterapia.
Gen:
POLE
Utilidad clínica:
Se han sugerido las variantes de los genes POLE/POLD1 como potenciales marcadores para inmunoterapia debido a su asociación significativa con la carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés), un indicador eficaz de predicción de la respuesta en inmunoterapia.
Gen:
STK11
Utilidad clínica:
El STK11/LKB1 se encuentra entre los supresores tumorales más comúnmente inactivados en cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC, por sus siglas en inglés), especialmente en tumores con mutaciones de KRAS. En un estudio clínico, se halló que las alteraciones de STK11/LKB1 son el factor genómico más prevalente de la resistencia primaria a inhibidores de eje PD-1 en adenocarcinoma de pulmón con mutación de KRAS. Las mutaciones en este gen se han asociado a síndrome de Peutz-Jeghers (SPJ), un trastorno autosómico dominante caracterizado por el crecimiento de pólipos en el tracto gastrointestinal, máculas pigmentadas en la piel y la boca, y otras neoplasias. Varios informes publicados han demostrado que el SPJ predispone a los portadores a cánceres del tracto gastrointestinal, así como a susceptibilidad a una variedad de tumores.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.
Gen:
AR
Utilidad clínica:
Los receptores de hormonas esteroideas son factores de transcripción activados por ligando que regulan la expresión génica eucariota y afectan la proliferación celular y el ZBTB7A que recluta NCOR1 y NCOR2 para elementos de respuesta a andrógenos (ARE) en genes diana, regulando negativamente la señalización de receptores de andrógenos y la proliferación de células inducidas por andrógenos.
Gen:
ATM
Utilidad clínica:
Un gen de respuesta al daño de ADN que comúnmente se encuentra mutado en el cáncer. Se cree que las mutaciones de la línea germinal en este gen contribuyen a la susceptibilidad al cáncer de mama, y actualmente se encuentra en estudio el potencial de tratamiento de la inhibición de PARP para estos pacientes. En neoplasias linfoides, las mutaciones somáticas del ATM ocurren con frecuencia en linfomas de células del manto (LCM), leucemia linfoblástica crónica (LLC) y leucemia prolinfocítica T (LPL-T).
Gen:
BARD1
Utilidad clínica:
El heterodímero BRCA1-BARD1 media específicamente en la formación de cadenas de poliubiquitina unidas a ‘Lys-6’ y coordina una gama diversa de vías celulares, como reparación de daños de ADN, ubiquitinación y regulación transcripcional para mantener la estabilidad genómica. Desempeña un papel central en el control del ciclo celular como respuesta al daño de ADN. BARD1 se asocia a sensibilidad al inhibidor de PARP olaparib. El olaparib es una opción de tratamiento para pacientes con mCRPC y una mutación patogénica (de la línea germinal o somática) en un gen de reparación por recombinación homóloga, como BARD1, tratados anteriormente con terapia androgénica dirigida al receptor.
Gen:
BRCA1
Utilidad clínica:
En situaciones de enfermedad avanzada, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, como BRCA1 y BRCA2, sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
BRCA2
Utilidad clínica:
En situaciones de enfermedad avanzada, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, como BRCA1 y BRCA2, sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
BRIP1
Utilidad clínica:
La helicasa 1 que interactúa con el dominio C‐terminal de BRCA1 (BRIP1) es un gen que codifica una proteína que funciona en la reparación de ruptura de doble cadena del BRCA1.
BRIP1 se asocia a sensibilidad al inhibidor de PARP olaparib. El olaparib es una opción de tratamiento para pacientes con mCRPC y una mutación patogénica (de la línea germinal o somática) en un gen de reparación por recombinación homóloga, como BRIP1, tratados anteriormente con terapia androgénica dirigida al receptor.
Gen:
CDK12
Utilidad clínica:
CDK12 (quinasa dependiente de ciclina 12) es una quinasa implicada en la regulación del ciclo celular y la regulación de varios genes de respuesta al daño del ADN, como BRCA1, ATR, FANCI y FANCD2. Ocurren alteraciones dañinas de la CDK12 en un 2 % a un 4 % de los cánceres de próstata primarios, y en un 4.7 % a un 11 % de los cánceres de próstata resistentes a la castración (mCRPC, por sus siglas en inglés). CDK12 se asocia a sensibilidad al inhibidor de PARP olaparib. El olaparib es una opción de tratamiento para pacientes con mCRPC y una mutación patogénica (de la línea germinal o somática) que involucra un gen de reparación por recombinación homóloga, como CDK12, tratados anteriormente con terapia androgénica dirigida al receptor.
Gen:
CHEK1
Utilidad clínica:
Gen:
CHEK2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de este gen se han asociado al síndrome de Li-Fraumeni, un fenotipo de cáncer familiar altamente penetrante generalmente relacionado con mutaciones heredadas del TP53. Además, se cree que las mutaciones de este gen están relacionadas con una predisposición a los sarcomas, cáncer de mama y tumores cerebrales
Gen:
EPCAM
Utilidad clínica:
Se ha demostrado que la molécula de adhesión de las células epiteliales (EpCAM, por sus siglas en inglés) está fuertemente expresada en el cáncer de mama humano y en las células madre cancerosas, y se supone que su sobreexpresión promueve el avance y la metástasis de los tumores. Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión del EPCAM puede correlacionarse con el
desarrollo de metástasis en los huesos y una peor supervivencia libre de recurrencias bioquímicas del cáncer de próstata.
Gen:
FANCA
Utilidad clínica:
El gen FANCA es uno de los genes en los cuales las mutaciones conducen a anemia de Fanconi, un trastorno autosómico recesivo poco frecuente caracterizado por anomalías congénitas, insuficiencia de médula ósea y predisposición a malignidades. El FANCA también es un potencial gen de susceptibilidad al cáncer de mama y de ovario. Se asocia a la hipersensibilidad a agentes dañinos del ADN, inestabilidad cromosómica (mayor ruptura cromosómica) y reparación de ADN defectuosa. Los defectos en los genes implicados en la vía de reparación del daño del ADN (DDR, por sus siglas en inglés) surgen como biomarcadores nuevos y dianas para nuevas terapias con fármacos para el cáncer de próstata.
Gen:
FANCL
Utilidad clínica:
Se asocia a sensibilidad al inhibidor de PARP olaparib. El olaparib es una opción de tratamiento para pacientes con mCRPC y una mutación patogénica (de la línea germinal o somática) en un gen de reparación por recombinación homóloga, como FANCL, tratados anteriormente con terapia androgénica dirigida al receptor.
Gen:
HOXB13
Utilidad clínica:
HOXB13, un miembro de la familia de las proteínas homeobox, es un regulador clave de la diferenciación epitelial en la glándula prostática. El HOXB13 está sobreexpresado durante el avance maligno del tejido prostático, y se sospecha que contribuye a la patogénesis de la glándula prostática. El HOXB13 junto con las mutaciones de BRCA2 han demostrado de forma sistemática aumentar el riesgo de cáncer de próstata, y se observa más comúnmente en pacientes con diagnóstico de enfermedad de inicio temprano.
Gen:
MLH1
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión de reparación de errores de emparejamiento (MMR, por sus siglas en inglés) de ADN es común en el cáncer de próstata y está vinculada a un resultado poco favorable, así como a características que indican inestabilidad genética. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales, mientras que otros han informado hipermetilación somática del promotor del gen MLH1, que se asocia a la inactivación del gen MLH1, en hasta un 52 % de los tumores de colon. La inestabilidad microsatelital y la deficiencia de reparación de errores de emparejamiento, que pueden surgir en el contexto de mutaciones de MLH1, MSH2, MSH6 y PMS2, sugieren potencial vulnerabilidad a inhibidores de PD-1.
Gen:
MSH2
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata; las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. La pérdida de la proteína MSH2 se correlaciona con la inactivación de MSH2, hipermutación y una densidad más alta de linfocitos infiltrantes tumorales, y parece ser más frecuente entre los tumores primarios de muy alto grado, para los cuales pueden garantizarse análisis de detección de rutina si se validan en cohortes adicionales.
Gen:
MSH6
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. El MSH6 se asocia con un mayor riesgo de cáncer de mama, y debe considerarse al solicitar pruebas genéticas para personas que tienen
antecedentes familiares o personales de cáncer de mama.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PALB2
Utilidad clínica:
PALB2 (socio y localizador de cáncer de mama 2 [BRCA2, por sus siglas en inglés]) tiene una función importante en el mantenimiento de la integridad del genoma a través de su rol en la anemia de Fanconi (AF) y vías de reparación de ADN por recombinación homóloga. PALB2 ha surgido como una proteína supresora de tumores fundamental relacionada con la susceptibilidad al cáncer hereditario de mama y páncreas. En el cáncer de próstata, PALB2 se asocia a sensibilidad al inhibidor de PARP olaparib. El olaparib es una opción de tratamiento para pacientes con mCRPC y una mutación patogénica (de la línea germinal o somática) en un gen de reparación por recombinación homóloga, como PALB2, tratados anteriormente con terapia androgénica dirigida al receptor.
Gen:
PMS2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales. Además, los pacientes con síndrome de Lynch y mutaciones de PMS2 pueden presentar un riesgo mayor de desarrollar cáncer de mama. En el cáncer de próstata, el PMS2 tiene un rol de supresor tumoral al aumentar la apoptosis en células de cáncer de próstata.
Gen:
PTEN
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PTEN pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PPP2R2A
Utilidad clínica:
Predictor de respuesta tumoral a inhibidores de PARP. El olaparib es una opción de tratamiento para pacientes con mCRPC y una mutación patogénica (de la línea germinal o somática) en un gen de reparación por recombinación homóloga (BRCA1, BRCA2, ATM, BARD1, BRIP1, CDK12, CHECK1, CHECK2, FANCL, PALB2, RAD51B, RAD51C, RAD51D o RAD54L) tratados con terapia androgénica dirigida al receptor. Los pacientes con una mutación de PPP2R2A en el ensayo PROfound tuvieron un perfil de riesgo-beneficio desfavorable. No se recomienda olaparib en paciente con una mutación de PPP2R2A.
Gen:
RAD51B
Utilidad clínica:
Se asocia a sensibilidad al inhibidor de PARP olaparib. El olaparib es una opción de tratamiento para pacientes con mCRPC y una mutación patogénica (de la línea germinal o somática) en un gen de reparación por recombinación homóloga, como RAD51B, tratados anteriormente con terapia androgénica dirigida al receptor.
Gen:
RAD51C
Utilidad clínica:
Se asocia a sensibilidad al inhibidor de PARP olaparib. El olaparib es una opción de tratamiento para pacientes con mCRPC y una mutación patogénica (de la línea germinal o somática) en un gen de reparación por recombinación homóloga, como RAD51C, tratados anteriormente con terapia androgénica dirigida al receptor.
Gen:
RAD51D
Utilidad clínica:
Datos recientes indican que los hombres con cáncer de próstata pueden tener mutaciones de la línea germinal en 1 de 16 genes de reparación de ADN, entre ellos, RAD51D (0.4 %). Los hombres con estos síndromes heredados tienen un mayor riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal del RAD51D se han asociado recientemente con el cáncer de ovario y mama.
Gen:
RAD54L
Utilidad clínica:
Se asocia a sensibilidad al inhibidor de PARP olaparib. El olaparib es una opción de tratamiento para pacientes con mCRPC y una mutación patogénica (de la línea germinal o somática) en un gen de reparación por recombinación homóloga, como RAD54L, tratados anteriormente con terapia androgénica dirigida al receptor.
Gen:
RB1
Utilidad clínica:
Retinoblastoma 1 (RB1) es un gen que codifica una proteína que es un regulador negativo del ciclo celular, así como un supresor de tumores. Las mutaciones con cambio de sentido, las mutaciones sin sentido, las mutaciones silenciosas y las mutaciones por desplazamiento del marco de lectura se observan en cánceres como cánceres de las trompas de Falopio, cánceres oculares y cáncer intestinal. El RB1 está alterado en el 4.03 % de todos los cánceres con mayor prevalencia de alteraciones en adenocarcinoma de pulmón, carcinoma ductal invasivo de mama, carcinoma de pulmón de células pequeñas, carcinoma urotelial de vejiga y adenocarcinoma de colon. Los cánceres de próstata (CP) con pérdida de supresores de tumores potentes TP53 y RB1 exhiben resultados poco favorables. La TP53 y RB1 también influyen en la plasticidad celular, y con frecuencia se pierden en CP con diferenciación neuroendocrina (NE).
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida
en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.
Gen:
AKT1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del AKT1 pueden predecir la respuesta a los inhibidores del AKT1/mTOR.
Gen:
ALK
Utilidad clínica:
Las reorganizaciones del gen de la ALK en el CPCNP predicen la respuesta terapéutica a los inhibidores de la ALK, incluidos crizotinib y ceritinib, aprobados por la FDA, y resistencia a los inhibidores del EGFR. Las mutaciones de la ALK y las amplificaciones genéticas se asocian con resistencia adquirida al crizotinib y respuesta variable a inhibidores de la ALK de segunda generación.
Gen:
APC
Utilidad clínica:
Supresor de tumores. Promueve la rápida degradación de CTNNB1 y participa en señalización de Wnt como regulador negativo. Se requiere para regulación ascendente de MMP9 a través de la vía de señalización de JNK en células de tumores colorrectales.
Gen:
ARID1A
Utilidad clínica:
El ARID1A se encuentra mutado en más del 50 % de los carcinomas de células claras de ovario y en un 30 % de los carcinomas endometrioides. La mutación del ARID1A es un conocido causante genético de cáncer de ovario. Más del 90 % de las mutaciones de ARID1A observadas en el cáncer de ovario son mutaciones por desplazamiento del marco de lectura o mutaciones sin sentido que tienen como resultado pérdida de la expresión de la proteína ARID1A. La pérdida de ARID1A se correlaciona con enfermedad en etapa tardía y predice la recurrencia temprana del carcinoma de células claras de ovario.
Gen:
ATM
Utilidad clínica:
Un gen de respuesta al daño de ADN que comúnmente se encuentra mutado en el cáncer. Se cree que las mutaciones de la línea germinal en este gen contribuyen a la susceptibilidad al cáncer de mama, y actualmente se encuentra en estudio el potencial de tratamiento de la inhibición de PARP para estos pacientes. En neoplasias linfoides, las mutaciones somáticas del ATM ocurren con frecuencia en linfomas de células del manto (LCM), leucemia linfoblástica crónica (LLC) y leucemia prolinfocítica
T (LPL-T).
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos
con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
CDH1
Utilidad clínica:
Implicado en mecanismos de regulación de adhesiones celulares, movilidad y proliferación de células epiteliales. Se cree que la pérdida de función de este gen contribuye al avance del cáncer al aumentar la proliferación, la invasión o la metástasis
Gen:
CDKN2A
Utilidad clínica:
La pérdida de CDKN2A es común en neoplasias linfoides, tiene implicaciones de pronóstico en algunas neoplasias malignas y presenta una diana terapéutica para inhibidores del CDK4/6.
Gen:
CTNNB1
Utilidad clínica:
Las mutaciones activadoras del CTNNB1 puede predecir la respuesta a los inhibidores de WNT.
Gen:
EGFR
Utilidad clínica:
EGFR pertenece a una familia de cuatro tirosina quinasas que comprenden ErbB1 (EGFR, HER1), ErbB2 (Her-2, Neu), ErbB3 (Her-3) y ErbB4 (Her-4). Se detectaron amplificaciones y mutaciones en EGFR (HER1) en un 45 % a un 57 % de los casos de glioblastoma, lo que indica un rol causal en la patogénesis del glioblastoma. Los EGFR inducen proliferación y se han implicado en la patogénesis del glioblastoma y la resistencia al tratamiento. El EGFR se considera una potencial diana terapéutica para la terapia anti-EGFR en el cáncer de mama triple negativo (TNBC, por sus siglas en inglés). La sensibilización de las mutaciones del EGFR predicen la respuesta a TKI del EGFR en el CPCNP, incluidos TKI aprobados por la FDA (erlotinib, gefitinib y afatinib), mientras que otras mutaciones predicen la resistencia a TKI de primera y segunda generación.
Gen:
EPCAM
Utilidad clínica:
Se ha demostrado que la molécula de adhesión de las células epiteliales (EpCAM, por sus siglas en inglés) está fuertemente expresada en el cáncer de mama humano y en las células madre cancerosas, y se supone que su sobreexpresión promueve el avance y la metástasis de los tumores. Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión del EPCAM puede correlacionarse con el
desarrollo de metástasis en los huesos y una peor supervivencia libre de recurrencias bioquímicas del cáncer de próstata.
Gen:
ERBB2
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el ERBB2 (HER2) son dianas emergentes asociadas a la respuesta al anticuerpo anti-HER2 (trastuzumab) o a la terapia con TKI (afatinib) en el CPCNP. En el cáncer de mama, la sobreexpresión del ERBB2 o la amplificación del gen se asocia con la respuesta a terapias dirigidas anti-HER2 establecidas. En neoplasias del SNC, se ha detectado mutación de ErbB2/HER-2 en el 8 % al 41 % de los casos de glioblastoma.
Gen:
ERBB4
Utilidad clínica:
La red de señalización de ErbB desempeña un papel crucial en el crecimiento y avance de varios tipos de cáncer, entre ellos, el cáncer colorrectal (CCR), e incluye genes potencialmente tratables con fármacos. La activación de oncogenes de la vía de ErbB por mutaciones y amplificaciones focales ha surgido recientemente como un importante marcador predictivo de pronóstico de los pacientes con CCR.
Gen:
FBXW7
Utilidad clínica:
Se han observado mutaciones en el supresor de tumores FBXW7 en algunas neoplasias malignas hematológicas, entre ellas, leucemia linfática crónica (LLC) y leucemia linfoblástica aguda de células T (LLA-T).
Gen:
FGFR1
Utilidad clínica:
La amplificación del gen FGFR1 predice la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FGFR2
Utilidad clínica:
Las alteraciones del FGFR2, incluida la amplificación, las reorganizaciones y las mutaciones puntuales, predicen la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FGFR3
Utilidad clínica:
Las alteraciones del FGFR3, incluida la amplificación, las reorganizaciones y las mutaciones puntuales, predicen la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
GNA11
Utilidad clínica:
Se identifican mutaciones somáticas en los genes GNA11 o GNAQ en la mayoría de los casos de melanoma uveal.
Gen:
GNAQ
Utilidad clínica:
Se identifican mutaciones somáticas en los genes GNA11 o GNAQ en la mayoría de los casos de melanoma uveal.
Gen:
GNAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones son específicas del melanoma uveal y otros melanomas no cutáneos, y no se encuentran en tejidos normales, lo cual las hace potenciales dianas terapéuticas.
Gen:
HRAS
Utilidad clínica:
Las proteínas RAS (KRAS4A, KRAS4B, NRAS y HRAS) funcionan como interruptores de encendido y apagado binarios con regulación GDP–GTP, que regulan las redes de señalización citoplasmática que controlan los diversos procesos celulares normales. Las mutaciones con cambio de sentido de ganancia de función en genes RAS se encuentran en un ∼25 % de los cánceres humanos, lo que genera interés en identificar las estrategias terapéuticas anti-RAS para el tratamiento del cáncer. Las mutaciones del RAS
tienen un valor predictivo positivo alto para malignidad en tumores de tiroides, y ayudan en el diagnóstico de lesiones tiroideas foliculares.
Gen:
IDH1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del IDH (IDH1 e IDH2) son más relevantes en gliomas difusos de bajo grado, y en glioblastomas secundarios, se asocian con un mejor pronóstico en gliomas de bajo grado, y pueden predecir la respuesta a la terapia (inhibidores del IDH, temozolomida). En la leucemia mieloide aguda (LMA), las mutaciones somáticas en IDH1 e IDH2 son altamente recurrentes y son casi exclusivamente heterocigotas, y ocurren con mayor frecuencia en LMA
en citogenética normal.
Gen:
IDH2
Utilidad clínica:
Las mutaciones del IDH (IDH1 e IDH2) son más relevantes en gliomas difusos de bajo grado, y en glioblastomas secundarios, se asocian con un mejor pronóstico en gliomas de bajo grado, y pueden predecir la respuesta a la terapia (inhibidores del IDH, temozolomida). En la leucemia mieloide aguda (LMA), las mutaciones somáticas en IDH1 e IDH2 son altamente recurrentes y son casi exclusivamente heterocigotas, y ocurren con mayor frecuencia en LMA
en citogenética normal.
Gen:
KDR
Utilidad clínica:
KDR codifica uno de los dos receptores del factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF), que es un importante factor de crecimiento de las células endoteliales. Las mutaciones de este gen están implicadas en hemangiomas capilares infantiles.
Gen:
KIT
Utilidad clínica:
En GIST, las mutaciones del KIT predicen la respuesta a TKI (imatinib, sunitinib), con mutaciones secundarias asociadas a la resistencia. En casos de melanoma metastásico, se ha informado una respuesta limitada al imatinib.
Gen:
KRAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones del KRAS en el mCRC son predictivas de beneficio para agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab). En el CPCNP, las mutaciones del KRAS se asocian con resistencia primaria a TKI del EGFR. En el cáncer de mama, se halló que la expresión de ARNm de KRAS es un factor de pronóstico independiente. La función de pronóstico del ARNm de KRAS fue efectiva solo en el cáncer de mama luminal de subtipo A.
Gen:
MEN1
Utilidad clínica:
La neoplasia endocrina múltiple tipo 1 (MEN1, por sus siglas en inglés) es una afección hereditaria asociada a tumores de las glándulas endocrinas (que producen hormonas). Una mutación del gen MEN1 representa para una persona un mayor riesgo de desarrollar tumores endocrinos. Los tumores más comunes que se ven en MEN1 implican las glándulas paratiroides, células de islotes pancreáticos y la glándula pituitaria. Otros tumores endocrinos que se ven en MEN1 incluyen tumores corticoadrenales, tumores neuroendocrinos (anteriormente llamados “tumores carcinoides”) y feocromocitomas poco frecuentes, así como tumores en otras partes del tracto digestivo.
Gen:
MET
Utilidad clínica:
Las alteraciones del MET en tumores sólidos, incluida la amplificación y las mutaciones, pueden predecir la respuesta a los inhibidores del MET. La amplificación del MET se ha asociado a resistencia adquirida a TKI anti-EGFR en cáncer de pulmón.
Gen:
MLH1
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión de reparación de errores de emparejamiento (MMR, por sus siglas en inglés) de ADN es común en el cáncer de próstata y está vinculada a un resultado poco favorable, así como a características que indican inestabilidad genética. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales, mientras que otros han
informado hipermetilación somática del promotor del gen MLH1, que se asocia a la inactivación del gen MLH1, en hasta un 52 % de los tumores de colon. La inestabilidad microsatelital y la deficiencia de reparación de errores de emparejamiento, que pueden surgir en el contexto de mutaciones de MLH1, MSH2, MSH6 y PMS2, sugieren potencial vulnerabilidad a inhibidores de PD-1.
Gen:
MSH2
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata; las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. La pérdida de la proteína MSH2 se correlaciona con la inactivación de MSH2, hipermutación y una densidad más alta de linfocitos infiltrantes tumorales, y parece ser más frecuente entre los tumores primarios de muy alto grado, para los cuales pueden garantizarse análisis de detección de rutina si se validan en cohortes adicionales.
Gen:
MSH6
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. El MSH6 se asocia con un mayor riesgo de cáncer de mama, y debe considerarse al solicitar pruebas genéticas para personas que tienen
antecedentes familiares o personales de cáncer de mama.
Gen:
NOTCH1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del NOTCH1 pueden asociarse con un mal pronóstico en un subgrupo de CPCNP. El NOTCH1 puede contribuir a la resistencia a TKI en CPCNP. Entre el 4 % y el 15% de los casos de leucemia linfocítica crónica (LLC) presentan mutaciones en NOTCH1. Las mutaciones en NOTCH1 son más frecuentes en casos sin mutación de IGVH y se han asociado a avance de la enfermedad. Más específicamente, las mutaciones de NOTCH1 se han encontrado en hasta un 42 % de los casos de LLC con trisomía del par 12.
Gen:
NRAS
Utilidad clínica:
Se encuentran mutaciones y sobreexpresión del homólogo del oncogén viral RAS (v‐ras) de neuroblastoma (NRAS, por sus siglas en inglés) en múltiples tipos de tumores y son frecuentes en cánceres altamente metastásicos, como tumores de primario desconocido, melanomas y sarcomas que presentan una llamativa propensión a metástasis en pulmón. Estudios clínicos sugieren que los pacientes con tumores con mutación de NRAS o amplificados sufren una enfermedad de mayor malignidad que los pacientes con alelos NRAS de tipo salvaje. Las mutaciones de NRAS en mCRC son predictivas de falta de beneficio de los agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab), y puede predecir la respuesta a inhibidores de MEK en melanoma metastásico.
Gen:
PDGFRA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PDGFRA predicen la respuesta a los TKI (imatinib, sunitinib).
Gen:
PIK3CA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PIK3CA pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PMS2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales. Además, los pacientes con síndrome de Lynch y mutaciones de PMS2 pueden presentar un riesgo mayor de desarrollar cáncer de mama. En el cáncer de próstata, el PMS2 tiene un rol de supresor tumoral al aumentar la apoptosis en células de cáncer de próstata.
Gen:
POLE
Utilidad clínica:
Se han sugerido las variantes de los genes POLE/POLD1 como potenciales marcadores para inmunoterapia debido a su asociación significativa con la carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés), un indicador eficaz de predicción de la respuesta en inmunoterapia.
Gen:
PTEN
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PTEN pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PTPN11
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el PTPN11 ocurren en varios tipos de neoplasias malignas hematológicas, con más frecuencia en pacientes con LMMJ.
Gen:
RB1
Utilidad clínica:
Retinoblastoma 1 (RB1) es un gen que codifica una proteína que es un regulador negativo del ciclo celular, así como un supresor de tumores. Las mutaciones con cambio de sentido, las mutaciones sin sentido, las mutaciones silenciosas y las mutaciones por desplazamiento del marco de lectura se observan en cánceres como cánceres de las trompas de Falopio, cánceres oculares y cáncer intestinal. El RB1 está alterado en el 4.03 % de todos los cánceres con mayor prevalencia de alteraciones en adenocarcinoma de pulmón, carcinoma ductal invasivo de mama, carcinoma de pulmón de células pequeñas, carcinoma urotelial de vejiga y adenocarcinoma de colon.
Gen:
RET
Utilidad clínica:
Las anomalías del RET, incluidas las reorganizaciones y mutaciones, predicen la respuesta a los inhibidores multicinasa. Las mutaciones puntuales del RET se han asociado a un pronóstico adverso en carcinomas de tiroides medulares esporádicos.
Gen:
SMAD4
Utilidad clínica:
Un gen supresor de tumores que se encuentra en al menos 26 tipos de cáncer, con frecuencias más altas en cánceres del tracto gastrointestinal, por ejemplo, cáncer de esófago, estómago, páncreas y colorrectal. Además, la pérdida de SMAD4 en tumores afecta el avance del cáncer y la terapia, por ejemplo, una respuesta reducida a la quimioterapia adyuvante.
Gen:
SMO
Utilidad clínica:
El receptor acoplado a proteínas G (GPCR, por sus siglas en inglés) Smoothened (SMO) es un componente de señalización clave de la vía de sonic hedgehog (Hh) y una diana clínicamente validada para el tratamiento del cáncer. Los inhibidores de SMO actualmente aprobados por la FDA son GDC-0449/Vismodegib y LDE225/Sonidegib.
Gen:
SRC
Utilidad clínica:
El protooncogén SRC no receptor de la tirosina quinasa (SRC, por sus siglas en inglés) es un factor importante que impulsa la actividad de YAP/TAZ en las células del cáncer de mama y el melanoma en humanos. La activación de la SRC aumentó la actividad de YAP/TAZ y la expresión de los genes regulados por YAP/TAZ.
Gen:
STK11
Utilidad clínica:
El STK11/LKB1 se encuentra entre los supresores tumorales más comúnmente inactivados en cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC, por sus siglas en inglés), especialmente en tumores con mutaciones de KRAS. En un estudio clínico, se halló que las alteraciones de STK11/LKB1 son el factor genómico más prevalente de la resistencia primaria a inhibidores de eje PD-1 en adenocarcinoma de pulmón con mutación de KRAS. Las mutaciones en este gen se han asociado a síndrome de Peutz-Jeghers (SPJ), un trastorno autosómico dominante caracterizado por el crecimiento de pólipos en el tracto gastrointestinal, máculas pigmentadas en la piel y la boca, y otras neoplasias. Varios informes publicados han demostrado que el SPJ predispone a los portadores a cánceres del tracto gastrointestinal, así como a susceptibilidad a una variedad de tumores.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida
en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TSC1
Utilidad clínica:
La mutación de TSC1 o TSC2 es responsable del complejo de esclerosis tuberosa, que es un trastorno autosómico dominante caracterizado por manifestación en la piel y formación de múltiples tumores en diferentes órganos, principalmente en el sistema nervioso central.
Gen:
TSC2
Utilidad clínica:
La mutación de TSC1 o TSC2 es responsable del complejo de esclerosis tuberosa, que es un trastorno autosómico dominante caracterizado por manifestación en la piel y formación de múltiples tumores en diferentes órganos, principalmente en el sistema nervioso central.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.
Gen:
VHL
Utilidad clínica:
Las mutaciones de VHL predisponen al desarrollo de una amplia variedad de tumores (más comúnmente, hemangioblastomas del sistema nervioso central y retinianos, carcinoma renal de células claras y feocromocitomas). El hemangioblastoma (CHB, por sus siglas en inglés) del sistema nervioso central es la manifestación más común de la enfermedad de VHL. Las mutaciones de la línea germinal en el gen supresor tumoral VHL son responsables del síndrome de predisposición al cáncer heredado o enfermedad de von Hippel-Lindau (VHL).

Perfil de tumor sólido OnkoSight AdvancedTM (50 genes), TMB y
MSI
Código de la prueba: TJ16-5

AKT1APCARID1AATMBRAFBRCA1BRCA2CDH1CDKN2A
CTNNB1EGFREPCAMERBB2ERBB4FBXW7FGFR1FGFR2FGFR3
GNA11GNAQGNASHRASIDH1IDH2KDRKITKRAS
MEN1METMLH1MSH2MSH6NOTCH1NRASPDGFRAPIK3CA
PMS2POLEPTENPTPN11RB1RETSMAD4SMOSTK11
TERTTSC1TSC2TP53VHL
Gen:
AKT1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del AKT1 pueden predecir la respuesta a los inhibidores del AKT1/mTOR.
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos
con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
DDR2
Utilidad clínica:
En el cáncer de pulmón de células escamosas, las mutaciones del DDR2 pueden predecir la respuesta al dasatinib y otros inhibidores del receptor de la tirosina quinasa (TKI).
Gen:
EGFR
Utilidad clínica:
EGFR pertenece a una familia de cuatro tirosina quinasas que comprenden ErbB1 (EGFR, HER1), ErbB2 (Her-2, Neu), ErbB3 (Her-3) y ErbB4 (Her-4). Se detectaron amplificaciones y mutaciones en EGFR (HER1) en un 45 % a un 57 % de los casos de glioblastoma, lo que indica un rol causal en la patogénesis del glioblastoma. Los EGFR inducen proliferación y se han implicado en la patogénesis del glioblastoma y la resistencia al tratamiento. El EGFR se considera una potencial diana terapéutica para la terapia anti-EGFR en el cáncer de mama triple negativo (TNBC, por sus siglas en inglés). La sensibilización de las mutaciones del EGFR predicen la respuesta a TKI del EGFR en el CPCNP, incluidos TKI aprobados por la FDA (erlotinib, gefitinib y afatinib), mientras que otras mutaciones predicen la resistencia a TKI de primera y segunda generación.
Gen:
ERBB2
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el ERBB2 (HER2) son dianas emergentes asociadas a la respuesta al anticuerpo anti-HER2 (trastuzumab) o a la terapia con TKI (afatinib) en el CPCNP. En el cáncer de mama, la sobreexpresión del ERBB2 o la amplificación del gen se asocia con la respuesta a terapias dirigidas anti-HER2 establecidas. En neoplasias del SNC, se ha detectado mutación de ErbB2/HER-2 en el 8 % al 41 % de los casos de glioblastoma.
Gen:
BRCA1
Utilidad clínica:
En situaciones de enfermedad avanzada, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, como BRCA1 y BRCA2, sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
BRCA2
Utilidad clínica:
En situaciones de enfermedad avanzada, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, como BRCA1 y BRCA2, sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
FGFR1
Utilidad clínica:
La amplificación del gen FGFR1 predice la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
KRAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones del KRAS en el mCRC son predictivas de beneficio para agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab). En el CPCNP, las mutaciones del KRAS se asocian con resistencia primaria a TKI del EGFR. En el cáncer de mama, se halló que la expresión de ARNm de KRAS es un factor de pronóstico independiente. La función de pronóstico del ARNm de KRAS fue efectiva solo en el cáncer de mama luminal de subtipo A.
Gen:
MAP2K1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del MAP2K1 pueden conferir resistencia a inhibidores del BRAF y el MEK.
Gen:
MET
Utilidad clínica:
Las alteraciones del MET en tumores sólidos, incluida la amplificación y las mutaciones, pueden predecir la respuesta a los inhibidores del MET. La amplificación del MET se ha asociado a resistencia adquirida a TKI anti-EGFR en cáncer de pulmón.
Gen:
NRAS
Utilidad clínica:
Se encuentran mutaciones y sobreexpresión del homólogo del oncogén viral RAS (v‐ras) de neuroblastoma (NRAS, por sus siglas en inglés) en múltiples tipos de tumores y son frecuentes en cánceres altamente metastásicos, como tumores de primario desconocido, melanomas y sarcomas que presentan una llamativa propensión a metástasis en pulmón. Estudios clínicos sugieren que los pacientes con tumores con mutación de NRAS o amplificados sufren una enfermedad de mayor malignidad que
los pacientes con alelos NRAS de tipo salvaje. Las mutaciones de NRAS en mCRC son predictivas de falta de beneficio de los agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab), y puede predecir la respuesta a inhibidores de MEK en melanoma metastásico.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PIK3CA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PIK3CA pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
POLD1
Utilidad clínica:
Se han sugerido las variantes de los genes POLE/POLD1 como potenciales marcadores para inmunoterapia debido a su asociación significativa con la carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés), un indicador eficaz de predicción de la respuesta en inmunoterapia.
Gen:
POLE
Utilidad clínica:
Se han sugerido las variantes de los genes POLE/POLD1 como potenciales marcadores para inmunoterapia debido a su asociación significativa con la carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés), un indicador eficaz de predicción de la respuesta en inmunoterapia.
Gen:
STK11
Utilidad clínica:
El STK11/LKB1 se encuentra entre los supresores tumorales más comúnmente inactivados en cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC, por sus siglas en inglés), especialmente en tumores con mutaciones de KRAS. En un estudio clínico, se halló que las alteraciones de STK11/LKB1 son el factor genómico más prevalente de la resistencia primaria a inhibidores de eje PD-1 en adenocarcinoma de pulmón con mutación de KRAS. Las mutaciones en este gen se han asociado a síndrome de Peutz-Jeghers (SPJ), un trastorno autosómico dominante caracterizado por el crecimiento de pólipos en el tracto gastrointestinal, máculas pigmentadas en la piel y la boca, y otras neoplasias. Varios informes publicados han demostrado que el SPJ predispone a los portadores a cánceres del tracto gastrointestinal, así como a susceptibilidad a una variedad de tumores.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida
en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.
Gen:
AR
Utilidad clínica:
Los receptores de hormonas esteroideas son factores de transcripción activados por ligando que regulan la expresión génica eucariota y afectan la proliferación celular y el ZBTB7A que recluta NCOR1 y NCOR2 para elementos de respuesta a andrógenos (ARE) en genes diana, regulando negativamente la señalización de receptores de andrógenos y la proliferación de células inducidas por andrógenos.
Gen:
ATM
Utilidad clínica:
Un gen de respuesta al daño de ADN que comúnmente se encuentra mutado en el cáncer. Se cree que las mutaciones de la línea germinal en este gen contribuyen a la susceptibilidad al cáncer de mama, y actualmente se encuentra en estudio el potencial de tratamiento de la inhibición de PARP para estos pacientes. En neoplasias linfoides, las mutaciones somáticas del ATM ocurren con frecuencia en linfomas de células del manto (LCM), leucemia linfoblástica crónica (LLC) y leucemia prolinfocítica
T (LPL-T).
Gen:
BRCA1
Utilidad clínica:
En situaciones de enfermedad avanzada, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, como BRCA1 y BRCA2, sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
BRCA2
Utilidad clínica:
En situaciones de enfermedad avanzada, las mutaciones de los genes de reparación por recombinación homóloga, como BRCA1 y BRCA2, sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
CHEK2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de este gen se han asociado al síndrome de Li-Fraumeni, un fenotipo de cáncer familiar altamente penetrante generalmente relacionado con mutaciones heredadas del TP53. Además, se cree que las mutaciones de este gen están relacionadas con una predisposición a los sarcomas, cáncer de mama y tumores cerebrales.
Gen:
EPCAM
Utilidad clínica:
Se ha demostrado que la molécula de adhesión de las células epiteliales (EpCAM, por sus siglas en inglés) está fuertemente expresada en el cáncer de mama humano y en las células madre cancerosas, y se supone que su sobreexpresión promueve el avance y la metástasis de los tumores. Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión del EPCAM puede correlacionarse con el
desarrollo de metástasis en los huesos y una peor supervivencia libre de recurrencias bioquímicas del cáncer de próstata.
Gen:
FANCA
Utilidad clínica:
El gen FANCA es uno de los genes en los cuales las mutaciones conducen a anemia de Fanconi, un trastorno autosómico recesivo poco frecuente caracterizado por anomalías congénitas, insuficiencia de médula ósea y predisposición a malignidades. El FANCA también es un potencial gen de susceptibilidad al cáncer de mama y de ovario. Se asocia a la hipersensibilidad a agentes dañinos del ADN, inestabilidad cromosómica (mayor ruptura cromosómica) y reparación de ADN defectuosa. Los defectos en los genes implicados en la vía de reparación del daño del ADN (DDR, por sus siglas en inglés) surgen como biomarcadores nuevos y dianas para nuevas terapias con fármacos para el cáncer de próstata.
Gen:
HOXB13
Utilidad clínica:
HOXB13, un miembro de la familia de las proteínas homeobox, es un regulador clave de la diferenciación epitelial en la glándula prostática. El HOXB13 está sobreexpresado durante el avance maligno del tejido prostático, y se sospecha que contribuye a la patogénesis de la glándula prostática. El HOXB13 junto con las mutaciones de BRCA2 han demostrado de forma sistemática aumentar el riesgo de cáncer de próstata, y se observa
más comúnmente en pacientes con diagnóstico de enfermedad de inicio temprano.
Gen:
MLH1
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión de reparación de errores de emparejamiento (MMR, por sus siglas en inglés) de ADN es común en el cáncer de próstata y está vinculada a un resultado poco favorable, así como a características que indican inestabilidad genética. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales, mientras que otros han informado hipermetilación somática del promotor del gen MLH1, que se asocia a la inactivación del gen MLH1, en hasta un 52 % de los tumores de colon. La inestabilidad microsatelital y la deficiencia de reparación de errores de emparejamiento, que pueden surgir en el contexto de mutaciones de MLH1, MSH2, MSH6 y PMS2, sugieren potencial vulnerabilidad a inhibidores de PD-1.
Gen:
MSH2
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata; las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. La pérdida de la proteína MSH2 se correlaciona con la inactivación de MSH2, hipermutación y una densidad más alta de linfocitos infiltrantes tumorales, y parece ser más frecuente entre los tumores primarios de muy alto grado, para los cuales pueden garantizarse análisis de detección de rutina si se validan en cohortes adicionales.
Gen:
MSH6
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. El MSH6 se asocia con un mayor riesgo de cáncer de mama, y debe considerarse al solicitar pruebas genéticas para personas que tienen
antecedentes familiares o personales de cáncer de mama.
Gen:
NTRK1
Utilidad clínica:
La detección de la fusión del gen NTRK que implica al NTRK1, NTRK2 o NTRK3 puede ayudar en la selección de pacientes que pueden beneficiarse de terapias de inhibición de TRK.
Gen:
PALB2
Utilidad clínica:
PALB2 (socio y localizador de cáncer de mama 2 [BRCA2, por sus siglas en inglés]) tiene una función importante en el mantenimiento de la integridad del genoma a través de su rol en la anemia de Fanconi (AF) y vías de reparación de ADN por recombinación homóloga (HR, por sus siglas en inglés). PALB2 ha surgido como una proteína supresora de tumores fundamental relacionada con la susceptibilidad al cáncer hereditario de mama y páncreas. En situaciones de enfermedad avanzada de cáncer de próstata, las mutaciones
de los genes de reparación por recombinación homóloga, (p. ej., BRCA1, BRCA2, ATM, CHEK2, PALB2), sugieren la posibilidad de quimioterapia con platino y ensayos de inhibidor del PARP.
Gen:
PMS2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales. Además, los pacientes con síndrome de Lynch y mutaciones de PMS2 pueden presentar un riesgo mayor de desarrollar cáncer de mama. En el cáncer de próstata, el PMS2 tiene un rol de supresor tumoral al aumentar la apoptosis en células de cáncer de próstata.
Gen:
PTEN
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PTEN pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
RAD51D
Utilidad clínica:
Datos recientes indican que los hombres con cáncer de próstata pueden tener mutaciones de la línea germinal en 1 de 16 genes de reparación de ADN, entre ellos, RAD51D (0.4 %). Los hombres con estos síndromes heredados tienen un mayor riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal del RAD51D se han asociado recientemente con el cáncer de ovario y mama.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida
en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
AKT1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del AKT1 pueden predecir la respuesta a los inhibidores del AKT1/mTOR.
Gen:
ALK
Utilidad clínica:
Las reorganizaciones del gen de la ALK en el CPCNP predicen la respuesta terapéutica a los inhibidores de la ALK, incluidos crizotinib y ceritinib, aprobados por la FDA, y resistencia a los inhibidores del EGFR. Las mutaciones de la ALK y las amplificaciones genéticas se asocian con resistencia adquirida al crizotinib y respuesta variable a inhibidores de la ALK de segunda generación.
Gen:
APC
Utilidad clínica:
Supresor de tumores. Promueve la rápida degradación de CTNNB1 y participa en señalización de Wnt como regulador negativo. Se requiere para regulación ascendente de MMP9 a través de la vía de señalización de JNK en células de tumores colorrectales.
Gen:
ARID1A
Utilidad clínica:
El ARID1A se encuentra mutado en más del 50 % de los carcinomas de células claras de ovario y en un 30 % de los carcinomas endometrioides. La mutación del ARID1A es un conocido causante genético de cáncer de ovario. Más del 90 % de las mutaciones de ARID1A observadas en el cáncer de ovario son mutaciones por desplazamiento del marco de lectura o mutaciones sin sentido que tienen como resultado pérdida de la expresión de la proteína ARID1A. La pérdida de ARID1A se correlaciona con enfermedad en etapa tardía y predice la recurrencia temprana del carcinoma de células claras de ovario.
Gen:
ATM
Utilidad clínica:
Un gen de respuesta al daño de ADN que comúnmente se encuentra mutado en el cáncer. Se cree que las mutaciones de la línea germinal en este gen contribuyen a la susceptibilidad al cáncer de mama, y actualmente se encuentra en estudio el potencial de tratamiento de la inhibición de PARP para estos pacientes. En neoplasias linfoides, las mutaciones somáticas del ATM ocurren con frecuencia en linfomas de células del manto (LCM), leucemia linfoblástica crónica (LLC) y leucemia prolinfocítica
T (LPL-T).
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos
con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
CDH1
Utilidad clínica:
Implicado en mecanismos de regulación de adhesiones celulares, movilidad y proliferación de células epiteliales. Se cree que la pérdida de función de este gen contribuye al avance del cáncer al aumentar la proliferación, la invasión o la metástasis
Gen:
CDKN2A
Utilidad clínica:
La pérdida de CDKN2A es común en neoplasias linfoides, tiene implicaciones de pronóstico en algunas neoplasias malignas y presenta una diana terapéutica para inhibidores del CDK4/6.
Gen:
CTNNB1
Utilidad clínica:
Las mutaciones activadoras del CTNNB1 puede predecir la respuesta a los inhibidores de WNT.
Gen:
EGFR
Utilidad clínica:
EGFR pertenece a una familia de cuatro tirosina quinasas que comprenden ErbB1 (EGFR, HER1), ErbB2 (Her-2, Neu), ErbB3 (Her-3) y ErbB4 (Her-4). Se detectaron amplificaciones y mutaciones en EGFR (HER1) en un 45 % a un 57 % de los casos de glioblastoma, lo que indica un rol causal en la patogénesis del glioblastoma. Los EGFR inducen proliferación y se han implicado en la patogénesis del glioblastoma y la resistencia al tratamiento. El EGFR se considera una potencial diana terapéutica para la terapia anti-EGFR en el cáncer de mama triple negativo (TNBC, por sus siglas en inglés). La sensibilización de las mutaciones del EGFR predicen la respuesta a TKI del EGFR en el CPCNP, incluidos TKI aprobados por la FDA (erlotinib, gefitinib y afatinib), mientras que otras mutaciones predicen la resistencia a TKI de primera y segunda generación.
Gen:
EPCAM
Utilidad clínica:
Se ha demostrado que la molécula de adhesión de las células epiteliales (EpCAM, por sus siglas en inglés) está fuertemente expresada en el cáncer de mama humano y en las células madre cancerosas, y se supone que su sobreexpresión promueve el avance y la metástasis de los tumores. Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión del EPCAM puede correlacionarse con el
desarrollo de metástasis en los huesos y una peor supervivencia libre de recurrencias bioquímicas del cáncer de próstata.
Gen:
ERBB2
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el ERBB2 (HER2) son dianas emergentes asociadas a la respuesta al anticuerpo anti-HER2 (trastuzumab) o a la terapia con TKI (afatinib) en el CPCNP. En el cáncer de mama, la sobreexpresión del ERBB2 o la amplificación del gen se asocia con la respuesta a terapias dirigidas anti-HER2 establecidas. En neoplasias del SNC, se ha detectado mutación de ErbB2/HER-2 en el 8 % al 41 % de los casos de glioblastoma.
Gen:
ERBB4
Utilidad clínica:
La red de señalización de ErbB desempeña un papel crucial en el crecimiento y avance de varios tipos de cáncer, entre ellos, el cáncer colorrectal (CCR), e incluye genes potencialmente tratables con fármacos. La activación de oncogenes de la vía de ErbB por mutaciones y amplificaciones focales ha surgido recientemente como un importante marcador predictivo de pronóstico de los pacientes con CCR.
Gen:
FBXW7
Utilidad clínica:
Se han observado mutaciones en el supresor de tumores FBXW7 en algunas neoplasias malignas hematológicas, entre ellas, leucemia linfática crónica (LLC) y leucemia linfoblástica aguda de células T (LLA-T).
Gen:
FGFR1
Utilidad clínica:
La amplificación del gen FGFR1 predice la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FGFR2
Utilidad clínica:
Las alteraciones del FGFR2, incluida la amplificación, las reorganizaciones y las mutaciones puntuales, predicen la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
FGFR3
Utilidad clínica:
Las alteraciones del FGFR3, incluida la amplificación, las reorganizaciones y las mutaciones puntuales, predicen la respuesta a la inhibición del FGFR en varias neoplasias malignas.
Gen:
GNA11
Utilidad clínica:
Se identifican mutaciones somáticas en los genes GNA11 o GNAQ en la mayoría de los casos de melanoma uveal.
Gen:
GNAQ
Utilidad clínica:
Se identifican mutaciones somáticas en los genes GNA11 o GNAQ en la mayoría de los casos de melanoma uveal.
Gen:
GNAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones son específicas del melanoma uveal y otros melanomas no cutáneos, y no se encuentran en tejidos normales, lo cual las hace potenciales dianas terapéuticas.
Gen:
HRAS
Utilidad clínica:
Las proteínas RAS (KRAS4A, KRAS4B, NRAS y HRAS) funcionan como interruptores de encendido y apagado binarios con regulación GDP–GTP, que regulan las redes de señalización citoplasmática que controlan los diversos procesos celulares normales. Las mutaciones con cambio de sentido de ganancia de función en genes RAS se encuentran en un ∼25 % de los cánceres humanos, lo que genera interés en identificar las estrategias terapéuticas anti-RAS para el tratamiento del cáncer. Las mutaciones del RAS
tienen un valor predictivo positivo alto para malignidad en tumores de tiroides, y ayudan en el diagnóstico de lesiones tiroideas foliculares.
Gen:
IDH1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del IDH (IDH1 e IDH2) son más relevantes en gliomas difusos de bajo grado, y en glioblastomas secundarios, se asocian con un mejor pronóstico en gliomas de bajo grado, y pueden predecir la respuesta a la terapia (inhibidores del IDH, temozolomida). En la leucemia mieloide aguda (LMA), las mutaciones somáticas en IDH1 e IDH2 son altamente recurrentes y son casi exclusivamente heterocigotas, y ocurren con mayor frecuencia en LMA
en citogenética normal.
Gen:
IDH2
Utilidad clínica:
Las mutaciones del IDH (IDH1 e IDH2) son más relevantes en gliomas difusos de bajo grado, y en glioblastomas secundarios, se asocian con un mejor pronóstico en gliomas de bajo grado, y pueden predecir la respuesta a la terapia (inhibidores del IDH, temozolomida). En la leucemia mieloide aguda (LMA), las mutaciones somáticas en IDH1 e IDH2 son altamente recurrentes y son casi exclusivamente heterocigotas, y ocurren con mayor frecuencia en LMA
en citogenética normal.
Gen:
KDR
Utilidad clínica:
KDR codifica uno de los dos receptores del factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF), que es un importante factor de crecimiento de las células endoteliales. Las mutaciones de este gen están implicadas en hemangiomas capilares infantiles.
Gen:
KIT
Utilidad clínica:
En GIST, las mutaciones del KIT predicen la respuesta a TKI (imatinib, sunitinib), con mutaciones secundarias asociadas a la resistencia. En casos de melanoma metastásico, se ha informado una respuesta limitada al imatinib.
Gen:
KRAS
Utilidad clínica:
Las mutaciones del KRAS en el mCRC son predictivas de beneficio para agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab). En el CPCNP, las mutaciones del KRAS se asocian con resistencia primaria a TKI del EGFR. En el cáncer de mama, se halló que la expresión de ARNm de KRAS es un factor de pronóstico independiente. La función de pronóstico del ARNm de KRAS fue efectiva solo en el cáncer de mama luminal de subtipo A.
Gen:
MEN1
Utilidad clínica:
La neoplasia endocrina múltiple tipo 1 (MEN1, por sus siglas en inglés) es una afección hereditaria asociada a tumores de las glándulas endocrinas (que producen hormonas). Una mutación del gen MEN1 representa para una persona un mayor riesgo de desarrollar tumores endocrinos. Los tumores más comunes que se ven en MEN1 implican las glándulas paratiroides, células de islotes pancreáticos y la glándula pituitaria. Otros tumores endocrinos que se ven en MEN1 incluyen tumores corticoadrenales, tumores neuroendocrinos (anteriormente llamados “tumores carcinoides”) y feocromocitomas poco frecuentes, así como tumores en otras partes del tracto digestivo.
Gen:
MET
Utilidad clínica:
Las alteraciones del MET en tumores sólidos, incluida la amplificación y las mutaciones, pueden predecir la respuesta a los inhibidores del MET. La amplificación del MET se ha asociado a resistencia adquirida a TKI anti-EGFR en cáncer de pulmón.
Gen:
MLH1
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. La sobreexpresión de reparación de errores de emparejamiento (MMR, por sus siglas en inglés) de ADN es común en el cáncer de próstata y está vinculada a un resultado poco favorable, así como a características que indican inestabilidad genética. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales, mientras que otros han informado hipermetilación somática del promotor del gen MLH1, que se asocia a la inactivación del gen MLH1, en hasta un 52 % de los tumores de colon. La inestabilidad microsatelital y la deficiencia de reparación de errores de emparejamiento, que pueden surgir en el contexto de mutaciones de MLH1, MSH2, MSH6 y PMS2, sugieren potencial vulnerabilidad a inhibidores de PD-1.
Gen:
MSH2
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata; las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. La pérdida de la proteína MSH2 se correlaciona con la inactivación de MSH2, hipermutación y una densidad más alta de linfocitos infiltrantes tumorales, y parece ser más frecuente entre los tumores primarios de muy alto grado, para los cuales pueden garantizarse análisis de detección de rutina si se validan en cohortes adicionales.
Gen:
MSH6
Utilidad clínica:
Los hombres con síndrome de Lynch (mutaciones de la línea germinal en MLH1, MLH2, MSH6, PMS2 o EPCAM) tienen entre 2 y 5.8 veces más riesgo de cáncer de próstata. Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. El MSH6 se asocia con un mayor riesgo de cáncer de mama, y debe considerarse al solicitar pruebas genéticas para personas que tienen
antecedentes familiares o personales de cáncer de mama.
Gen:
NOTCH1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del NOTCH1 pueden asociarse con un mal pronóstico en un subgrupo de CPCNP. El NOTCH1 puede contribuir a la resistencia a TKI en CPCNP. Entre el 4 % y el 15% de los casos de leucemia linfocítica crónica (LLC) presentan mutaciones en NOTCH1. Las mutaciones en NOTCH1 son más frecuentes en casos sin mutación de IGVH y se han asociado a avance de la enfermedad. Más específicamente, las mutaciones de NOTCH1 se han encontrado en hasta un 42 % de los casos de LLC con trisomía del par 12.
Gen:
NRAS
Utilidad clínica:
Se encuentran mutaciones y sobreexpresión del homólogo del oncogén viral RAS (v‐ras) de neuroblastoma (NRAS, por sus siglas en inglés) en múltiples tipos de tumores y son frecuentes en cánceres altamente metastásicos, como tumores de primario desconocido, melanomas y sarcomas que presentan una llamativa propensión a metástasis en pulmón. Estudios clínicos sugieren que los pacientes con tumores con mutación de NRAS o amplificados sufren una enfermedad de mayor malignidad que los pacientes con alelos NRAS de tipo salvaje. Las mutaciones de NRAS en mCRC son predictivas de falta de beneficio de los agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab), y puede predecir la respuesta a inhibidores de MEK en melanoma metastásico.
Gen:
PDGFRA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PDGFRA predicen la respuesta a los TKI (imatinib, sunitinib).
Gen:
PIK3CA
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PIK3CA pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PMS2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de la línea germinal en genes MMR en personas con síndrome de Lynch son responsables del 2 % al 4 % de los casos de cáncer de colon. Se han informado defectos de MMR somáticos en aproximadamente el 19 % de los tumores colorrectales. Además, los pacientes con síndrome de Lynch y mutaciones de PMS2 pueden presentar un riesgo mayor de desarrollar cáncer de mama. En el cáncer de próstata, el PMS2 tiene un rol de supresor tumoral al aumentar la apoptosis en células de cáncer de próstata.
Gen:
POLE
Utilidad clínica:
Se han sugerido las variantes de los genes POLE/POLD1 como potenciales marcadores para inmunoterapia debido a su asociación significativa con la carga mutacional tumoral (TMB, por sus siglas en inglés), un indicador eficaz de predicción de la respuesta en inmunoterapia.
Gen:
PTEN
Utilidad clínica:
Las mutaciones del PTEN pueden predecir la respuesta a los inhibidores del PI3K/AKT/mTOR.
Gen:
PTPN11
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el PTPN11 ocurren en varios tipos de neoplasias malignas hematológicas, con más frecuencia en pacientes con LMMJ.
Gen:
RB1
Utilidad clínica:
Retinoblastoma 1 (RB1) es un gen que codifica una proteína que es un regulador negativo del ciclo celular, así como un supresor de tumores. Las mutaciones con cambio de sentido, las mutaciones sin sentido, las mutaciones silenciosas y las mutaciones por desplazamiento del marco de lectura se observan en cánceres como cánceres de las trompas de Falopio, cánceres oculares y cáncer intestinal. El RB1 está alterado en el 4.03 % de todos los cánceres con mayor prevalencia de alteraciones en adenocarcinoma de pulmón, carcinoma ductal invasivo de mama, carcinoma de pulmón de células pequeñas, carcinoma urotelial de vejiga y adenocarcinoma de colon.
Gen:
RET
Utilidad clínica:
Las anomalías del RET, incluidas las reorganizaciones y mutaciones, predicen la respuesta a los inhibidores multicinasa. Las mutaciones puntuales del RET se han asociado a un pronóstico adverso en carcinomas de tiroides medulares esporádicos.
Gen:
SMAD4
Utilidad clínica:
Un gen supresor de tumores que se encuentra en al menos 26 tipos de cáncer, con frecuencias más altas en cánceres del tracto gastrointestinal, por ejemplo, cáncer de esófago, estómago, páncreas y colorrectal. Además, la pérdida de SMAD4 en tumores afecta el avance del cáncer y la terapia, por ejemplo, una respuesta reducida a la quimioterapia adyuvante.
Gen:
SMO
Utilidad clínica:
El receptor acoplado a proteínas G (GPCR, por sus siglas en inglés) Smoothened (SMO) es un componente de señalización clave de la vía de sonic hedgehog (Hh) y una diana clínicamente validada para el tratamiento del cáncer. Los inhibidores de SMO actualmente aprobados por la FDA son GDC-0449/Vismodegib y LDE225/Sonidegib.
Gen:
SRC
Utilidad clínica:
El protooncogén SRC no receptor de la tirosina quinasa (SRC, por sus siglas en inglés) es un factor importante que impulsa la actividad de YAP/TAZ en las células del cáncer de mama y el melanoma en humanos. La activación de la SRC aumentó la actividad de YAP/TAZ y la expresión de los genes regulados por YAP/TAZ.
Gen:
STK11
Utilidad clínica:
El STK11/LKB1 se encuentra entre los supresores tumorales más comúnmente inactivados en cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC, por sus siglas en inglés), especialmente en tumores con mutaciones de KRAS. En un estudio clínico, se halló que las alteraciones de STK11/LKB1 son el factor genómico más prevalente de la resistencia primaria a inhibidores de eje PD-1 en adenocarcinoma de pulmón con mutación de KRAS. Las mutaciones en este gen se han asociado a síndrome de Peutz-Jeghers (SPJ), un trastorno autosómico dominante caracterizado por el crecimiento de pólipos en el tracto gastrointestinal, máculas pigmentadas en la piel y la boca, y otras neoplasias. Varios informes publicados han demostrado que el SPJ predispone a los portadores a cánceres del tracto gastrointestinal, así como a susceptibilidad a una variedad de tumores.
Gen:
TERT
Utilidad clínica:
Tiene valor tanto de diagnóstico como de pronóstico para los tumores del SNC. Diagnóstico: La mutación de TERT, en combinación con mutación de IDH y codeleción de 1p/19q, es característica del oligodendroglioma. La ausencia de mutación de TERT, combinada con mutación de IDH, designa astrocitoma. Pronóstico: En ausencia de mutación de IDH, las mutaciones de TERT en gliomas difusos infiltrantes se asocian a una supervivencia general reducida
en comparación con gliomas que no tienen mutaciones de TERT. Las mutaciones combinadas de TERT e IDH en ausencia de codeleción de 1p/19q son un hecho poco frecuente, pero dichos tumores tienen un pronóstico tan favorable como los gliomas con las tres alteraciones moleculares. Para el cáncer de pulmón, la evidencia clínica sugiere que la mutación de los genes de telomerasa (Tert/Terc) está asociada a un mayor riesgo de enfermedades congénitas, así como relacionadas con la edad (p. ej., neumonitis, fibrosis pulmonar idiopática [FPI], disqueratosis congénita, enfisema, neumonía intersticial no especifica, etc.) Las mutaciones oncogénicas en NRAS están presentes en más del 25 % de los melanomas, y los pacientes cuyos tumores tienen mutaciones de NRAS tienen opciones terapéuticas limitadas y pronóstico poco favorable.
Gen:
TSC1
Utilidad clínica:
La mutación de TSC1 o TSC2 es responsable del complejo de esclerosis tuberosa, que es un trastorno autosómico dominante caracterizado por manifestación en la piel y formación de múltiples tumores en diferentes órganos, principalmente en el sistema nervioso central.
Gen:
TSC2
Utilidad clínica:
La mutación de TSC1 o TSC2 es responsable del complejo de esclerosis tuberosa, que es un trastorno autosómico dominante caracterizado por manifestación en la piel y formación de múltiples tumores en diferentes órganos, principalmente en el sistema nervioso central.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Las mutaciones somáticas en el gen TP53 se encuentran en la mayoría de los cánceres humanos y, generalmente, se asocian con características de pronóstico adverso en varios tipos de tumores.
Gen:
VHL
Utilidad clínica:
Las mutaciones de VHL predisponen al desarrollo de una amplia variedad de tumores (más comúnmente, hemangioblastomas del sistema nervioso central y retinianos, carcinoma renal de células claras y feocromocitomas). El hemangioblastoma (CHB, por sus siglas en inglés) del sistema nervioso central es la manifestación más común de la enfermedad de VHL. Las mutaciones de la línea germinal en el gen supresor tumoral VHL son responsables del síndrome de predisposición al cáncer heredado o enfermedad de von Hippel-Lindau (VHL).

PERFIL DE NGS HEMATOLÓGICO

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Perfil de neoplasias linfoides crónicas OnkoSight AdvancedTM (31 genes),
TMB y MSI
CÓDIGO DE LA PRUEBA: TH55-7

ATMBCL2BCL6 BIRC3BRAFBTXCARD11CD79BCDKN2A
CXCR4DNMT3A EZH2IDH1IDH2JAK1 JAK3 KMT2DMAP2K1
MYD88NOTCH1NOTCH2NRASPLCG2RHOASETD2SF3B1STAT3
STAT5BTET2TNFRSF14 TP53
Gen:
ATM
Utilidad clínica:
Un gen de respuesta al daño de ADN que comúnmente se encuentra mutado en el cáncer. Se cree que las mutaciones de la línea germinal en este gen contribuyen a la susceptibilidad al cáncer de mama, y actualmente se encuentra en estudio el potencial de tratamiento de la inhibición de PARP para estos pacientes. En neoplasias linfoides, las mutaciones somáticas del ATM ocurren con frecuencia en linfomas de células del manto (LCM), leucemia linfoblástica crónica (LLC) y leucemia prolinfocítica
T (LPL-T).
Gen:
BCL2
Utilidad clínica:
Las mutaciones de BCL2 en linfoma folicular se correlacionan con la expresión de la citidina desaminasa inducida por activación y, con frecuencia, alteran la secuencia de aminoácidos de la proteína. Las mutaciones en la secuencia de codificación de BCL2 al momento del diagnóstico se asocian con un tiempo más breve hasta la transformación y muerte más temprana por linfoma.
Gen:
BIRC3
Utilidad clínica:
BIRC3 es un regulador importante de la señalización de NF-kB, y un gen recurrentemente mutado en la leucemia linfocítica crónica (LLC). Los pacientes con LLC con baja expresión de BIRC3 presentan un avance más rápido de la enfermedad. Las células de LLC primarias con mutación de BIRC3 son menos sensibles a la fludarabina.
Gen:
BRAF
Utilidad clínica:
Algunas mutaciones en el BRAF predicen la respuesta a los inhibidores del RAF en diversos tumores sólidos. Las terapias dirigidas al melanoma con mutación V600 del BRAF (vemurafenib, dabrafenib y trametinib) han sido aprobadas por la FDA. BRAF V600E es un marcador de pronóstico negativo en cánceres colorrectales, con resistencia a la terapia anti-EGFR en algunos entornos clínicos. En neoplasias del SNC, las mutaciones de BRAF V600E rara vez se encuentran en gliomas adultos
con solo el 1 % al 2 % de muestras mutadas en glioblastomas y del 2 % al 5 % en gliomas adultos de bajo grado. Aunque aún no podría establecerse una diferencia de pronóstico clara, los glioblastomas con mutación de BRAF V600E tienen características histopatológicas y moleculares distintivas. En la mayoría de los casos, las mutaciones de BRAF son mutuamente excluyentes respecto de las mutaciones de IDH canónicas.
Gen:
BTK
Utilidad clínica:
La tirosina quinasa de Bruton (BTK, por sus siglas en inglés) es una quinasa no receptora que tiene un papel fundamental en la señalización oncogénica que es crítica para la proliferación y supervivencia de las células leucémicas en muchas malignidades de linfocitos B. La BTK puede predecir la respuesta a los inhibidores de BTK.
Gen:
CARD11
Utilidad clínica:
CARD11 funciona como armazón de señalización clave que controla la activación de linfocitos inducidos por antígeno durante la respuesta inmune adaptativa. Frecuentemente, se encuentran mutaciones somáticas en CARD11 en linfoma no hodgkiniano, y al menos tres clases de mutaciones de CARD11 de la línea germinal se han descrito como base para la inmunodeficiencia primaria.
Gen:
CD79B
Utilidad clínica:
Recientemente, se han encontrado mutaciones activadoras en CD79 y MYD88 en un subgrupo de linfoma difuso de células B grandes (DLBCL, por sus siglas en inglés), que identifica al receptor de linfocitos B y la señalización de MYD88 como dianas terapéuticas potenciales para tratamiento personalizado.
Gen:
CDKN2A
Utilidad clínica:
La pérdida de CDKN2A es común en neoplasias linfoides, tiene implicaciones de pronóstico en algunas neoplasias malignas y presenta una diana terapéutica para inhibidores del CDK4/6.
Gen:
CXCR4
Utilidad clínica:
Aproximadamente el 30 % de los pacientes con linfoma linfoplasmocítico (LLP) presentan una mutación del gen CXCR4, lo que tiene como resultado una disminución de la respuesta a la terapia con inhibidores de la tirosina quinasa de Bruton (BTK, por sus siglas en inglés), así como una enfermedad de mayor malignidad.
Gen:
DNMT3A
Utilidad clínica:
Las mutaciones en el DNMT3A se han asociado a mal pronóstico en subgrupos de síndrome mielodisplásico (SMD, por sus siglas en inglés) y leucemia mieloide aguda (LMA), según el contexto clínico y molecular. Los pacientes con LMA con mutación del DNMT3A tienen una supervivencia inferior cuando se los trata con terapia de inducción de dosis estándar y deben ser considerados para terapia de inducción de dosis alta.
Gen:
EZH2
Utilidad clínica:
Las mutaciones del EZH2 se correlacionan con resultados adversos en trastornos mieloides (SMD, LMMC, MFP).
Gen:
IDH1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del IDH (IDH1 e IDH2) son más relevantes en gliomas difusos de bajo grado, y en glioblastomas secundarios, se asocian con un mejor pronóstico en gliomas de bajo grado, y pueden predecir la respuesta a la terapia (inhibidores del IDH, temozolomida). En la leucemia mieloide aguda (LMA), las mutaciones somáticas en IDH1 e IDH2 son altamente recurrentes y son casi exclusivamente heterocigotas, y ocurren con mayor frecuencia en
LMA en citogenética normal.
Gen:
IDH2
Utilidad clínica:
Las mutaciones del IDH (IDH1 e IDH2) son más relevantes en gliomas difusos de bajo grado, y en glioblastomas secundarios, se asocian con un mejor pronóstico en gliomas de bajo grado, y pueden predecir la respuesta a la terapia (inhibidores del IDH, temozolomida). En la leucemia mieloide aguda (LMA), las mutaciones somáticas en IDH1 e IDH2 son altamente recurrentes y son casi exclusivamente heterocigotas, y ocurren con mayor frecuencia en LMA en citogenética normal.
Gen:
KMT2D
Utilidad clínica:
La metiltransferasa 2D específica de lisina (K) (KMT2D, por sus siglas en inglés) es un gen que codifica una proteína que funciona como una histona metiltransferasa que metila la posición LYS-4 de la histona H3. KMT2D está alterado en el 8.52 % de todos los cánceres con mayor prevalencia de alteraciones en adenocarcinoma de pulmón, adenocarcinoma de colon, carcinoma urotelial de vejiga, carcinoma ductal invasivo de mama y adenocarcinoma endometrioide. En el linfoma folicular (LF) y linfoma difuso de células B grandes (DLBCL, por sus siglas en inglés), KMT2D ha surgido como uno de los genes mutados con mayor frecuencia. Las mutaciones de KMT2D pueden promover los tumores malignos al perturbar la expresión de los genes supresores de tumores que controlan las vías de activación de linfocitos B.
Gen:
MAP2K1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del MAP2K1 pueden conferir resistencia a inhibidores del BRAF y el MEK.
Gen:
MYD88
Utilidad clínica:
Las mutaciones del MYD88 pueden ayudar en el diagnóstico diferencial del linfoma difuso de células B grandes (DLBCL, por sus siglas en inglés) y el linfoma linfoplasmocítico (LLP), y pueden predecir la respuesta a la terapia (ibrutinib).
Gen:
NOTCH1
Utilidad clínica:
Las mutaciones del NOTCH1 pueden asociarse con un mal pronóstico en un subgrupo de CPCNP. El NOTCH1 puede contribuir a la resistencia a TKI en CPCNP. Entre el 4 % y el 15% de los casos de leucemia linfocítica crónica (LLC) presentan mutaciones en NOTCH1. Las mutaciones en NOTCH1 son más frecuentes en casos sin mutación de IGVH y se han asociado a avance de la enfermedad. Más específicamente, las mutaciones de NOTCH1 se han encontrado en hasta un 42 % de los casos de LLC con trisomía del par 12.
Gen:
NOTCH2
Utilidad clínica:
Se han informado mutaciones de ganancia de función recurrentes de NOTCH1 y NOTCH2 en trastornos linfoproliferativos de la serie B, incluida la leucemia linfocítica crónica (LLC), linfoma de células del manto (LCM), linfoma esplénico de la zona marginal (LEZM), linfoma difuso de células B grandes (DLBCL, por sus siglas en inglés), linfoma folicular (LF), linfoma de Burkitt (LB) y linfoma Hodgkin (LH). También se han informado mecanismos no mutacionales de la activación de NOTCH en mieloma múltiple.
Gen:
NRAS
Utilidad clínica:
Se encuentran mutaciones y sobreexpresión del homólogo del oncogén viral RAS (v‐ras) de neuroblastoma (NRAS, por sus siglas en inglés) en múltiples tipos de tumores y son frecuentes en cánceres altamente metastásicos, como tumores de primario desconocido, melanomas y sarcomas que presentan una llamativa propensión a metástasis en pulmón. Estudios clínicos sugieren que los pacientes con tumores con mutación de NRAS o amplificados sufren una enfermedad
de mayor malignidad que los pacientes con alelos NRAS de tipo salvaje. Las mutaciones de NRAS en mCRC son predictivas de falta de beneficio de los agentes terapéuticos anti-EGFR (cetuximab, panitumumab), y puede predecir la respuesta a inhibidores de MEK en melanoma metastásico.
Gen:
PLCG2
Utilidad clínica:
Las pruebas de mutaciones de PLCG2 pueden ser útiles en pacientes que reciben acalabrutinib y cuando se sospecha que ha habido un avance.
Gen:
RHOA
Utilidad clínica:
Se han informado mutaciones somáticas en RHOA, DNMT3A, IDH2 y TET2 en linfoma angioinmunoblástico de células T (LAIT) y linfoma periférico de células T no especificado (PTCL-NOS, por sus siglas en inglés), que se caracterizan por fenotipos de células T auxiliares foliculares. También se han identificado mutaciones de RHOA en cáncer gástrico y linfoma de Burkitt.
Gen:
SF3B1
Utilidad clínica:
Las mutaciones de SF3B1 se asociaron significativamente con enfermedad de receptor de estrógeno positivo, mutaciones de AKT1 y alteraciones de número de copias distintivas. Un perfilado adicional de mutaciones de zonas específicas en una prueba de subtipos histológicos especiales del cáncer de mama mostró que entre el 16 % y el 6 % de los carcinomas papilares y mucinosos de mama tenían una mutación de SF3B1 K700E. En el melanoma uveal, las mutaciones de SF3B1 generalmente se asocian con tumores que tienen un pronóstico favorable. Además, las mutaciones de SF3B1 R625 junto con mutaciones de GNAQ y GNA11 son un marcador genético de malignidad en proliferaciones melanocíticas similares a nevo azul. En la leucemia linfocítica crónica (LLC), el SF3B1, se ha hallado la mutación de un factor de empalme expresado de forma ubicua en el 5 % al 17 % de los casos de LLC, en los cuales se asocia a un pronóstico poco favorable, supervivencia general reducida y resistencia al
tratamiento con fludarabina.
Gen:
STAT3
Utilidad clínica:
Las pruebas de mutación de STAT3 se recomiendan bajo ciertas circunstancias para el diagnóstico de leucemia de linfocitos grandes granulares (LGLL, por sus siglas en inglés) y leucemias NK. Se han identificado mutaciones de STAT3 en aproximadamente el 50 % de LGLL y leucemia NK
Gen:
STAT5B
Utilidad clínica:
El gen STAT5B se asocia a insensibilidad a la hormona del crecimiento autosómica recesiva con inmunodeficiencia
Gen:
TET2
Utilidad clínica:
En las neoplasias malignas mieloides, frecuentemente se observa deleción o mutación del TET2, que puede tener un impacto de pronóstico adverso en la LMA y puede predecir una respuesta a los agentes hipometilantes en el SMD.
Gen:
TP53
Utilidad clínica:
Generalmente, las mutaciones somáticas del TP53 se asocian con mal pronóstico en neoplasias mieloides y pueden modular la respuesta al tratamiento en el SMD de bajo riesgo.
Gen:
BCL6
Utilidad clínica:
Las traslocaciones que afectan al gen BCL6 ocurren con frecuencia en el linfoma difuso de células B grandes con células B activadas (ABC-DLBCL), que es una forma de DLBCL de mayor malignidad.
Gen:
JAK1
Utilidad clínica:
Se han observado mutaciones en JAK1 y JAK3 en diversas neoplasias malignas linfoides de los linajes de células T y células B, así como en algunas leucemias mieloides agudas.
Gen:
JAK3
Utilidad clínica:
Se han observado mutaciones en JAK1 y JAK3 en diversas neoplasias malignas linfoides de los linajes de células T y células B, así como en algunas leucemias mieloides agudas.
Gen:
SETD2
Utilidad clínica:
Se hallaron mutaciones de SETD2 en el 12 % de los casos de leucemia linfoblástica aguda de células B, en el 1 % al 2 % de los casos de linfoma de células B, leucemia linfocítica crónica y LMA, y ocasionalmente en casos de neoplasias mieloproliferativas.
Gen:
TNFRSF14
Utilidad clínica:
Los estudios de perfil mutacional de pacientes con linfoma folicular (LF) ahora revelan varias anomalías que afectan principalmente las proteínas remodeladoras de la cromatina, cuya aptitud como dianas terapéuticas para LF se está explorando. Junto con MLL2, EZH2 y CREBBP, entre otros genes, las mutaciones en el gen TNFRSF14, un miembro de la superfamilia de los receptores de TNF, pueden encontrarse en muestras de linfoma folicular.
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